seq1 = pF1KB7815.tfa, 1596 bp
seq2 = pF1KB7815/gi568815579r_51864857.tfa (gi568815579r:51864857_52069134), 204278 bp

>pF1KB7815 1596
>gi568815579r:51864857_52069134 (Chr19)

(complement)

13-142  (100001-100130)   100% ->
143-238  (100462-100557)   100% ->
239-1596  (102921-104278)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     13 CAGGAATCCATAACACTGGAGGATGTGGCTGTGGACTTCACTTGGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 CAGGAATCCATAACACTGGAGGATGTGGCTGTGGACTTCACTTGGGAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     63 GTGGCAACTCCTGGGCGCTGCTCAGAAGGACCTGTACCGGGATGTGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTGGCAACTCCTGGGCGCTGCTCAGAAGGACCTGTACCGGGATGTGATGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    113 TGGAGAACTACAGCAACCTGGTGGCAGTGG         GGTATCAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 100101 TGGAGAACTACAGCAACCTGGTGGCAGTGGGTG...CAGGGTATCAAGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    154 AGCAAACCGGATGCACTCTTCAAGTTGGAACAAGGAGAACAACTGTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100473 AGCAAACCGGATGCACTCTTCAAGTTGGAACAAGGAGAACAACTGTGGAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    204 AATTGAAGATGGAATCCACAGTGGAGCCTGTTCAG         ACATAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100523 AATTGAAGATGGAATCCACAGTGGAGCCTGTTCAGGTG...TAGACATAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    245 GGAAAGTTGATCATGTGCTGGAGCGCTTGCAGAGTGAAAGCCTGGTGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102927 GGAAAGTTGATCATGTGCTGGAGCGCTTGCAGAGTGAAAGCCTGGTGAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    295 AGAAGGAAACCATGTCATGAACATGATGCATTTGAAAATATTGTTCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102977 AGAAGGAAACCATGTCATGAACATGATGCATTTGAAAATATTGTTCATTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    345 CAGCAAAAGTCAGTTTCTGTTAGGGCAAAATCATGATATATTTGACTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103027 CAGCAAAAGTCAGTTTCTGTTAGGGCAAAATCATGATATATTTGACTTAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    395 GTGGAAAAAGTTTGAAATCCAATTTAACTTTAGTTAACCAGAGCAAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103077 GTGGAAAAAGTTTGAAATCCAATTTAACTTTAGTTAACCAGAGCAAAGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    445 TATGAAATAAAGAACTCTGTTGAGTTTACTGGAAATGGGGACTCCTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103127 TATGAAATAAAGAACTCTGTTGAGTTTACTGGAAATGGGGACTCCTTTCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    495 TCATGCTAACCATGAACGACTTCATACTGCAATTAAATTCCCTGCAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103177 TCATGCTAACCATGAACGACTTCATACTGCAATTAAATTCCCTGCAAGTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    545 AAAAACTCATCAGCACTAAGTCCCAATTCATCAGTCCCAAGCATCAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103227 AAAAACTCATCAGCACTAAGTCCCAATTCATCAGTCCCAAGCATCAGAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    595 ACACGAAAATTAGAGAAGCATCATGTGTGCAGTGAATGTGGGAAAGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103277 ACACGAAAATTAGAGAAGCATCATGTGTGCAGTGAATGTGGGAAAGCCTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    645 CATCAAGAAGTCTTGGCTAACTGATCACCAGGTAATGCATACAGGAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103327 CATCAAGAAGTCTTGGCTAACTGATCACCAGGTAATGCATACAGGAGAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    695 AACCCCACAGATGTAGTCTATGTGAGAAAGCCTTCTCCAGAAAGTTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103377 AACCCCACAGATGTAGTCTATGTGAGAAAGCCTTCTCCAGAAAGTTCATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    745 CTTACTGAACATCAGCGAACTCATACAGGAGAAAAACCTTATGAATGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103427 CTTACTGAACATCAGCGAACTCATACAGGAGAAAAACCTTATGAATGCCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    795 TGAATGTGGCAAAGCCTTTCTCAAGAAATCACGGCTCAACATACATCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103477 TGAATGTGGCAAAGCCTTTCTCAAGAAATCACGGCTCAACATACATCAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    845 AAACACATACCGGAGAGAAACCCTATATATGCAGTGAATGTGGAAAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103527 AAACACATACCGGAGAGAAACCCTATATATGCAGTGAATGTGGAAAAGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    895 TTCATCCAGAAAGGAAATCTCATTGTACACCAGCGAATTCATACAGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103577 TTCATCCAGAAAGGAAATCTCATTGTACACCAGCGAATTCATACAGGTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    945 GAAACCTTATATATGCAATGAATGTGGAAAAGGCTTCATTCAGAAGACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103627 GAAACCTTATATATGCAATGAATGTGGAAAAGGCTTCATTCAGAAGACGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    995 GTCTCATAGCACATCAGAGATTTCACACAGGAAAGACGCCCTTTGTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103677 GTCTCATAGCACATCAGAGATTTCACACAGGAAAGACGCCCTTTGTGTGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1045 AGTGAATGTGGAAAATCCTGTTCTCAGAAATCAGGTCTCATTAAACATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103727 AGTGAATGTGGAAAATCCTGTTCTCAGAAATCAGGTCTCATTAAACATCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1095 AAGAATTCACACAGGAGAGAAACCCTTTGAATGTAGTGAATGTGGGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103777 AAGAATTCACACAGGAGAGAAACCCTTTGAATGTAGTGAATGTGGGAAAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1145 CCTTTAGCACAAAGCAAAAGCTCATTGTCCATCAAAGGACTCATACAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103827 CCTTTAGCACAAAGCAAAAGCTCATTGTCCATCAAAGGACTCATACAGGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1195 GAGAGACCCTATGGCTGTAACGAGTGTGGGAAAGCGTTTGCGTATATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103877 GAGAGACCCTATGGCTGTAACGAGTGTGGGAAAGCGTTTGCGTATATGTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1245 GTGTCTGGTTAAGCATAAGAGAATACACACAAGGGAGAAACAAGAGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103927 GTGTCTGGTTAAGCATAAGAGAATACACACAAGGGAGAAACAAGAGGCAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1295 CCAAGGTGGAAAATCCTCCTGCAGAGAGGCACAGCTCATTACACACCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103977 CCAAGGTGGAAAATCCTCCTGCAGAGAGGCACAGCTCATTACACACCAGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1345 GATGTCATGCAGGAGAAAAACTCTGCTAACGGGGCGACTACACAAGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104027 GATGTCATGCAGGAGAAAAACTCTGCTAACGGGGCGACTACACAAGTGCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1395 TTCTGTGGCCCCTCAGACATCATTAAACATCAGCGGCCTCCTCGCAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104077 TTCTGTGGCCCCTCAGACATCATTAAACATCAGCGGCCTCCTCGCAAACA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1445 GGAACGTAGTCCTTGTGGGACAGCCAGTGGTCAGATGTGCAGCCTCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104127 GGAACGTAGTCCTTGTGGGACAGCCAGTGGTCAGATGTGCAGCCTCAGGA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1495 GATAACAGAGGATTTGCACAGGACAGAAACCTTGTGAATGCAGTGAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104177 GATAACAGAGGATTTGCACAGGACAGAAACCTTGTGAATGCAGTGAATGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1545 GGTTGTGCCTTCCGTGATCAATTATGTCTTATTTTATGTTACAGAAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104227 GGTTGTGCCTTCCGTGATCAATTATGTCTTATTTTATGTTACAGAAAACC

   1600 
   1595 CA
        ||
 104277 CA