seq1 = pF1KB7814.tfa, 1761 bp
seq2 = pF1KB7814/gi568815588r_129740245.tfa (gi568815588r:129740245_130063768), 323524 bp

>pF1KB7814 1761
>gi568815588r:129740245_130063768 (Chr10)

(complement)

1-134  (100001-100134)   100% ->
135-291  (100246-100402)   100% ->
292-355  (100764-100827)   100% ->
356-411  (101543-101598)   100% ->
412-485  (104762-104835)   100% ->
486-554  (106443-106511)   100% ->
555-636  (185920-186001)   100% ->
637-754  (190173-190290)   100% ->
755-885  (195857-195987)   100% ->
886-1012  (196502-196628)   100% ->
1013-1101  (215289-215377)   100% ->
1102-1167  (220567-220632)   100% ->
1168-1345  (221476-221653)   100% ->
1346-1534  (222737-222925)   100% ->
1535-1732  (223327-223524)   100% ->
1733-1761  (225809-225837)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTTGGGATTCAGGAGAATATTCCGCGCGGGGGGACGACCATGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTTGGGATTCAGGAGAATATTCCGCGCGGGGGGACGACCATGAAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGCCGCTGGGCAGCGGCATGAACCCGGTGCGCTCGTGGATGCACACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGCCGCTGGGCAGCGGCATGAACCCGGTGCGCTCGTGGATGCACACGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGGCGTGGTGGACGCCAACACGGCCGCCCAGAG         CGGCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100101 CGGGCGTGGTGGACGCCAACACGGCCGCCCAGAGGTA...CAGCGGCGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGGCTGGCGCGGGCGCACTTCGAGAAGCAGCCGCCTTCCAACCTCCGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100253 GGGCTGGCGCGGGCGCACTTCGAGAAGCAGCCGCCTTCCAACCTCCGGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ATCCAATTTCTTCCACTTCGTGCTGGCGCTCTACGATAGGCAGGGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100303 ATCCAATTTCTTCCACTTCGTGCTGGCGCTCTACGATAGGCAGGGGCAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CGGTGGAGATTGAAAGGACCGCTTTTGTGGACTTTGTGGAGAAAGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100353 CGGTGGAGATTGAAAGGACCGCTTTTGTGGACTTTGTGGAGAAAGAGAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292          GAGCCAAACAACGAGAAAACCAACAACGGCATCCACTATAA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100403 GTA...CAGGAGCCAAACAACGAGAAAACCAACAACGGCATCCACTATAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 ACTCCAGTTATTGTACAGCAACG         GAGTCAGAACAGAGCAAG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100805 ACTCCAGTTATTGTACAGCAACGGTA...CAGGAGTCAGAACAGAGCAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATCTGTATGTTCGCCTCATAGATTCAATGACCAAACAG         GCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 101561 ATCTGTATGTTCGCCTCATAGATTCAATGACCAAACAGGTG...CAGGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 ATCGTCTACGAGGGCCAGGACAAGAACCCGGAGATGTGCCGTGTGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104765 ATCGTCTACGAGGGCCAGGACAAGAACCCGGAGATGTGCCGTGTGCTGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GACCCACGAGATCATGTGCAG         CCGGTGCTGTGACAAGAAAA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 104815 GACCCACGAGATCATGTGCAGGTG...CAGCCGGTGCTGTGACAAGAAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 GTTGTGGCAATAGAAACGAAACGCCCTCAGACCCTGTAATCATTGACAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 106463 GTTGTGGCAATAGAAACGAAACGCCCTCAGACCCTGTAATCATTGACAGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    555         ATTCTTTCTAAAGTTTTTCCTCAAGTGCAATCAGAACTGTTT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106513 TA...TAGATTCTTTCTAAAGTTTTTCCTCAAGTGCAATCAGAACTGTTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 GAAGAATGCAGGCAACCCTCGAGATATGCGGAGATTCCAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 185962 GAAGAATGCAGGCAACCCTCGAGATATGCGGAGATTCCAGGTA...CAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 TTGTTGTATCGACAACAGTCAACGTGGACGGCCACGTGCTGGCCGTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190174 TTGTTGTATCGACAACAGTCAACGTGGACGGCCACGTGCTGGCCGTGTCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 GACAACATGTTTGTGCACAACAATTCCAAACACGGGAGGCGGGCCCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190224 GACAACATGTTTGTGCACAACAATTCCAAACACGGGAGGCGGGCCCGCCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 CCTAGACCCGTCAGAAG         CCACTCCGTGCATCAAGGCCATCA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 190274 CCTAGACCCGTCAGAAGGTA...CAGCCACTCCGTGCATCAAGGCCATCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 GTCCCAGTGAAGGCTGGACCACGGGGGGTGCCACCGTCATCATAATTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195881 GTCCCAGTGAAGGCTGGACCACGGGGGGTGCCACCGTCATCATAATTGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 GACAACTTCTTTGACGGGCTGCAAGTTGTATTCGGAACTATGTTGGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195931 GACAACTTCTTTGACGGGCTGCAAGTTGTATTCGGAACTATGTTGGTGTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 GAGCGAG         CTGATAACTCCCCATGCCATCCGAGTCCAGACCC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195981 GAGCGAGGTA...TAGCTGATAACTCCCCATGCCATCCGAGTCCAGACCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 CGCCGAGGCACATTCCTGGCGTCGTCGAAGTGACCCTCTCCTACAAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196536 CGCCGAGGCACATTCCTGGCGTCGTCGAAGTGACCCTCTCCTACAAATCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 AAGCAGTTCTGCAAAGGTGCTCCTGGGCGCTTTGTCTACACCG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 196586 AAGCAGTTCTGCAAAGGTGCTCCTGGGCGCTTTGTCTACACCGGTG...C

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1013   CCCTTAATGAACCAACCATAGATTACGGCTTTCAGAGGTTGCAGAAAG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215287 AGCCCTTAATGAACCAACCATAGATTACGGCTTTCAGAGGTTGCAGAAAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 TGATCCCAAGACATCCGGGTGATCCCGAAAGGTTACCCAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 215337 TGATCCCAAGACATCCGGGTGATCCCGAAAGGTTACCCAAGGTT...TAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 GAGGTGTTACTGAAGCGGGCGGCGGACCTGGTGGAAGCCTTATACGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 220567 GAGGTGTTACTGAAGCGGGCGGCGGACCTGGTGGAAGCCTTATACGGAAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 GCCTCACAACAACCAG         GAGATCATCTTGAAGCGAGCGGCGG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 220617 GCCTCACAACAACCAGGTA...CAGGAGATCATCTTGAAGCGAGCGGCGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1193 ACATCGCCGAGGCGCTGTACAGCGTTCCCCGCAATCACAACCAGATCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 221501 ACATCGCCGAGGCGCTGTACAGCGTTCCCCGCAATCACAACCAGATCCCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 ACCCTGGGCAACAACCCTGCACACACGGGCATGATGGGCGTCAACTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 221551 ACCCTGGGCAACAACCCTGCACACACGGGCATGATGGGCGTCAACTCCTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 CAGCAGCCAGCTAGCCGTCAACGTGTCAGAGACGTCACAAGCCAACGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 221601 CAGCAGCCAGCTAGCCGTCAACGTGTCAGAGACGTCACAAGCCAACGACC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 AAG         TCGGCTACAGTCGCAATACAAGCAGCGTGTCCCCGCGA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 221651 AAGGTA...CAGTCGGCTACAGTCGCAATACAAGCAGCGTGTCCCCGCGA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 GGCTACGTCCCCAGCAGTACTCCCCAGCAGTCCAATTACAACACAGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222775 GGCTACGTCCCCAGCAGTACTCCCCAGCAGTCCAATTACAACACAGTCAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 CACTAGCATGAATGGATATGGAAGTGGCGCCATGGCCAGTCTAGGGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222825 CACTAGCATGAATGGATATGGAAGTGGCGCCATGGCCAGTCTAGGGGTCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 CTGGCTCGCCTGGATTTCTTAATGGCTCCTCCGCTAACTCTCCCTACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222875 CTGGCTCGCCTGGATTTCTTAATGGCTCCTCCGCTAACTCTCCCTACGGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 A         TAGTGCCGTCCAGCCCCACCATGGCAGCCTCTTCGGTCAC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222925 AGTA...CAGTAGTGCCGTCCAGCCCCACCATGGCAGCCTCTTCGGTCAC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 CCTCCCTTCAAACTGTAGCAGCACACACGGCATTTTCTCATTCTCACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 223367 CCTCCCTTCAAACTGTAGCAGCACACACGGCATTTTCTCATTCTCACCTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 CCAATGTCATCTCCGCAGTGAAACAGAAGAGCGCCTTCGCGCCCGTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 223417 CCAATGTCATCTCCGCAGTGAAACAGAAGAGCGCCTTCGCGCCCGTGGTC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 CGGCCCCAAGCCTCTCCTCCTCCTTCCTGCACCAGCGCCAACGGGAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 223467 CGGCCCCAAGCCTCTCCTCCTCCTTCCTGCACCAGCGCCAACGGGAATGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1725 ACTGCAAG         CTATGTCTGGGCTGGTAGTCCCGCCAATG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 223517 ACTGCAAGGTG...CAGCTATGTCTGGGCTGGTAGTCCCGCCAATG