seq1 = pF1KB7807.tfa, 1575 bp
seq2 = pF1KB7807/gi568815586f_56989272.tfa (gi568815586f:56989272_57194718), 205447 bp

>pF1KB7807 1575
>gi568815586f:56989272_57194718 (Chr12)

1-83  (100001-100083)   100% ->
84-957  (101854-102727)   100% ->
958-1091  (103177-103310)   100% ->
1092-1143  (103646-103697)   100% ->
1144-1276  (103792-103924)   100% ->
1277-1468  (104136-104327)   100% ->
1469-1575  (105341-105447)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCACAGAGCGCCTTCCCCCACAGCCGAGCAGCCGCCGGGCGGAGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCACAGAGCGCCTTCCCCCACAGCCGAGCAGCCGCCGGGCGGAGGGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGCGCCCGCCGGACCCTGCAGCCCAGACTCAA         GCCCAGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100051 CAGCGCCCGCCGGACCCTGCAGCCCAGACTCAAGTT...CAGGCCCAGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCCGAGCCATGGCACTGCCTCGGACGCTGGGGGAGCTGCAGCTGTACCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101862 CCCGAGCCATGGCACTGCCTCGGACGCTGGGGGAGCTGCAGCTGTACCGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTCCTGCAGCGCGCCAACCTCCTTTCCTACTATGAGACCTTCATCCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101912 GTCCTGCAGCGCGCCAACCTCCTTTCCTACTATGAGACCTTCATCCAGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGGAGGGGACGACGTGCAGCAGCTGTGTGAGGCGGGTGAGGAGGAGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101962 GGGAGGGGACGACGTGCAGCAGCTGTGTGAGGCGGGTGAGGAGGAGTTTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGGAGATCATGGCACTTGTGGGCATGGCCACCAAGCCCCTCCATGTCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102012 TGGAGATCATGGCACTTGTGGGCATGGCCACCAAGCCCCTCCATGTCCGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CGCCTGCAGAAGGCACTGAGAGAGTGGGCCACCAATCCAGGGCTCTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102062 CGCCTGCAGAAGGCACTGAGAGAGTGGGCCACCAATCCAGGGCTCTTCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TCAACCAGTGCCTGCTGTTCCCGTCTCCAGCATCCCGCTCTTCAAGATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102112 TCAACCAGTGCCTGCTGTTCCCGTCTCCAGCATCCCGCTCTTCAAGATCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CTGAGACTGCGGGTACCCGGAAAGGGAGCATGAGCAATGGGCATGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102162 CTGAGACTGCGGGTACCCGGAAAGGGAGCATGAGCAATGGGCATGGCAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CCAGGGGAAAAGGCAGGCAGTGCCCGCAGTTTTAGCCCCAAGAGCCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102212 CCAGGGGAAAAGGCAGGCAGTGCCCGCAGTTTTAGCCCCAAGAGCCCCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TGAACTTGGAGAGAAGCTATCACCACTGCCTGGGGGACCTGGGGCAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102262 TGAACTTGGAGAGAAGCTATCACCACTGCCTGGGGGACCTGGGGCAGGGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 ACCCCCGGATCTGGCCAGGCCGGAGCACTCCAGAGTCGGACGTTGGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102312 ACCCCCGGATCTGGCCAGGCCGGAGCACTCCAGAGTCGGACGTTGGGGCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GGAGGAGAAGAGGAGGCTGGCTCGCCCCCCTTCTCCCCCCCTGCAGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102362 GGAGGAGAAGAGGAGGCTGGCTCGCCCCCCTTCTCCCCCCCTGCAGGGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 AGGAGTCCCTGAGGGGACTGGGGCTGGGGGGCTGGCAGCAGGTGGGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102412 AGGAGTCCCTGAGGGGACTGGGGCTGGGGGGCTGGCAGCAGGTGGGACTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 GGGGTGGTCCAGACCGACTGGAGCCAGAGATGGTACGCATGGTGGTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102462 GGGGTGGTCCAGACCGACTGGAGCCAGAGATGGTACGCATGGTGGTGGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 AGTGTGGAGAGGATCTTCCGGAGCTTCCCAAGGGGGGATGCTGGGGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102512 AGTGTGGAGAGGATCTTCCGGAGCTTCCCAAGGGGGGATGCTGGGGAGGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CACATCCCTGCTAAAGCTGAATAAGAAGCTGGCACGGAGCGTTGGGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102562 CACATCCCTGCTAAAGCTGAATAAGAAGCTGGCACGGAGCGTTGGGCACA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TCTTTGAGATGGATGATAATGACAGCCAGAAGGAAGAGGAGATCCGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102612 TCTTTGAGATGGATGATAATGACAGCCAGAAGGAAGAGGAGATCCGCAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 TACAGCATCATCTATGGCCGTTTCGACTCTAAGCGGCGGGAGGGCAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102662 TACAGCATCATCTATGGCCGTTTCGACTCTAAGCGGCGGGAGGGCAAGCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 GCTCAGCCTGCACGAG         CTCACCATCAACGAGGCTGCTGCCC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 102712 GCTCAGCCTGCACGAGGTG...CAGCTCACCATCAACGAGGCTGCTGCCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 AGTTCTGCATGAGGGACAACACGCTCTTATTACGGAGAGTGGAGCTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103202 AGTTCTGCATGAGGGACAACACGCTCTTATTACGGAGAGTGGAGCTCTTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 TCTTTGTCCCGCCAAGTAGCCCGAGAGAGCACCTACTTGTCCTCCTTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103252 TCTTTGTCCCGCCAAGTAGCCCGAGAGAGCACCTACTTGTCCTCCTTGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 GGGCTCCAG         GCTTCACCCTGAAGAACTGGGAGGCCCTCCAC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 103302 GGGCTCCAGGTG...CAGGCTTCACCCTGAAGAACTGGGAGGCCCTCCAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 TGAAGAAGCTGAAACAAGAG         GTTGGAGAACAGAGTCACCCT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 103678 TGAAGAAGCTGAAACAAGAGGTA...CAGGTTGGAGAACAGAGTCACCCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 GAAATCCAGCAGCCTCCCCCAGGCCCTGAGTCCTATGTACCCCCATACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103813 GAAATCCAGCAGCCTCCCCCAGGCCCTGAGTCCTATGTACCCCCATACCG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 CCCCAGCCTGGAGGAGGACAGCGCCAGCCTGTCTGGGGAGAGTCTGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103863 CCCCAGCCTGGAGGAGGACAGCGCCAGCCTGTCTGGGGAGAGTCTGGATG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 GACATTTGCAGG         CTGTGGGGTCATGTCCAAGGCTGACGCCG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 103913 GACATTTGCAGGGTG...CAGCTGTGGGGTCATGTCCAAGGCTGACGCCG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 CCCCCTGCTGACCTGCCTCTGGCATTGCCAGCCCATGGGCTATGGAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104165 CCCCCTGCTGACCTGCCTCTGGCATTGCCAGCCCATGGGCTATGGAGCCG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 ACACATCCTGCAGCAGACACTGATGGACGAGGGGCTGCGGCTCGCCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104215 ACACATCCTGCAGCAGACACTGATGGACGAGGGGCTGCGGCTCGCCCGCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 TCGTCTCCCACGACCGCGTGGGCCGCCTCAGCCCCTGTGTGCCTGCGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104265 TCGTCTCCCACGACCGCGTGGGCCGCCTCAGCCCCTGTGTGCCTGCGAAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 CCACCTCTCGCAG         AGTTCGAGGAAGGGCTGCTGGACAGATG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 104315 CCACCTCTCGCAGGTG...CAGAGTTCGAGGAAGGGCTGCTGGACAGATG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497 TCCTGCCCCAGGACCCCATCCCGCGCTGGTGGAGGGTCGCAGGAGCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105369 TCCTGCCCCAGGACCCCATCCCGCGCTGGTGGAGGGTCGCAGGAGCAGCG

   1600     .    :    .    :    .
   1547 TGAAAGTGGAGGCTGAGGCCAGCCGGCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||
 105419 TGAAAGTGGAGGCTGAGGCCAGCCGGCAG