seq1 = pF1KB7805.tfa, 1566 bp
seq2 = pF1KB7805/gi568815593f_178846356.tfa (gi568815593f:178846356_179065970), 219615 bp

>pF1KB7805 1566
>gi568815593f:178846356_179065970 (Chr5)

1-33  (96437-96469)   100% ->
34-160  (100004-100130)   100% ->
161-250  (100542-100631)   100% ->
251-1566  (118300-119615)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGTCAGCCACCTGCCAACCATGGTCCAG         GAATCGGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
  96437 ATGGCTGTCAGCCACCTGCCAACCATGGTCCAGGTG...CAGGAATCGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GACCTTCAAGGATGTGGCTATACTGTTCACCCAGGAAGAGTGGGGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100012 GACCTTCAAGGATGTGGCTATACTGTTCACCCAGGAAGAGTGGGGGCAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGAGCCCCGCCCAGAGGGCCCTGTACAGGGACGTGATGCTGGAGAACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100062 TGAGCCCCGCCCAGAGGGCCCTGTACAGGGACGTGATGCTGGAGAACTAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGCAACCTGGTCTCACTGG         GACTCTTAGGACCCAAACCAGA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100112 AGCAACCTGGTCTCACTGGGTA...CAGGACTCTTAGGACCCAAACCAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TACGTTTTCCCAGCTAGAAAAAAGGGAAGTGTGGATGCCAGAGGACACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100564 TACGTTTTCCCAGCTAGAAAAAAGGGAAGTGTGGATGCCAGAGGACACCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTGGAGGCTTCTGTCTTG         ACTGGATGACTATGCCTGCCAGT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100614 CTGGAGGCTTCTGTCTTGGTA...CAGACTGGATGACTATGCCTGCCAGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AAGAAATCTACTGTCAAGGCAGAGATTCCTGAAGAAGAATTGGATCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118323 AAGAAATCTACTGTCAAGGCAGAGATTCCTGAAGAAGAATTGGATCAATG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GACAATAAAGGAAAGATTCAGTAGCAGTAGTCACTGGAAGTGTGCTAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118373 GACAATAAAGGAAAGATTCAGTAGCAGTAGTCACTGGAAGTGTGCTAGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGCTGGAGTGGCAATGTGGAGGCCAGGAGATCAGTTTGCAGCGAGTGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118423 TGCTGGAGTGGCAATGTGGAGGCCAGGAGATCAGTTTGCAGCGAGTGGTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CTCACTCACCCCAACACCCCATCACAGGAATATGATGAATCCGGGAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 118473 CTCACTCACCCCAACACCCCATCACAGGAATGTGATGAATCCGGGAGCAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TATGAGCTCATCTCTTCACAGTGATCAAAGTCAGGGATTTCAACCTAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118523 TATGAGCTCATCTCTTCACAGTGATCAAAGTCAGGGATTTCAACCTAGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AAAATGCCTTTGAGTGTAGTGAGTGTGGAAAAGTCTTCTCTAAGAGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118573 AAAATGCCTTTGAGTGTAGTGAGTGTGGAAAAGTCTTCTCTAAGAGTTCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ACTCTTAATAAACATCAGAAAATTCATAATGAAAAAAATGCAAATCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118623 ACTCTTAATAAACATCAGAAAATTCATAATGAAAAAAATGCAAATCAGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 AATTCATATTAAGGAGAAAAGATATGAATGTAGAGAATGTGGGAAAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118673 AATTCATATTAAGGAGAAAAGATATGAATGTAGAGAATGTGGGAAAGCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TTCACCAGAGTACGCACCTTATCCATCACCAAAGAATTCACACTGGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118723 TTCACCAGAGTACGCACCTTATCCATCACCAAAGAATTCACACTGGCGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 AAACCCTATGAATGTAAGGAATGTGGCAAGGCCTTCTCAGTGAGCTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118773 AAACCCTATGAATGTAAGGAATGTGGCAAGGCCTTCTCAGTGAGCTCCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 ACTTACGTACCATCAGAAAATTCATACTGGAGAGAAGCCTTTTGAATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118823 ACTTACGTACCATCAGAAAATTCATACTGGAGAGAAGCCTTTTGAATGCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 ACTTATGTGGAAAAGCTTTTATCCGAAATATACACCTTGCCCATCATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118873 ACTTATGTGGAAAAGCTTTTATCCGAAATATACACCTTGCCCATCATCAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 AGAATACATACTGGAGAGAAACCTTTTAAATGTAACATTTGTGAAAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118923 AGAATACATACTGGAGAGAAACCTTTTAAATGTAACATTTGTGAAAAAGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 CTTTGTGTGCAGGGCACACCTTACCAAACACCAGAATATCCACAGTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118973 CTTTGTGTGCAGGGCACACCTTACCAAACACCAGAATATCCACAGTGGAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 AGAAACCCTATAAATGCAATGAATGTGGAAAAGCCTTTAATCAGAGTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119023 AGAAACCCTATAAATGCAATGAATGTGGAAAAGCCTTTAATCAGAGTACA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 AGTTTCCTTCAGCATCAGAGAATTCACACTGGAGAGAAACCCTTTGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119073 AGTTTCCTTCAGCATCAGAGAATTCACACTGGAGAGAAACCCTTTGAATG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 TAATGAATGTGGGAAGGCCTTCAGGGTGAACTCTTCCCTTACTGAACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119123 TAATGAATGTGGGAAGGCCTTCAGGGTGAACTCTTCCCTTACTGAACATC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 AGAGAATTCATACTGGAGAGAAACCTTATAAATGTAATGAATGTGGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119173 AGAGAATTCATACTGGAGAGAAACCTTATAAATGTAATGAATGTGGGAAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 GCTTTCAGGGATAATTCATCCTTTGCACGACATCGGAAAATTCACACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119223 GCTTTCAGGGATAATTCATCCTTTGCACGACATCGGAAAATTCACACTGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 AGAGAAACCTTACAGATGTGGCTTGTGTGAGAAAGCCTTTCGGGACCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119273 AGAGAAACCTTACAGATGTGGCTTGTGTGAGAAAGCCTTTCGGGACCAAT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 CAGCACTAGCCCAACATCAGAGAATTCATACTGGGGAAAAACCTTATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119323 CAGCACTAGCCCAACATCAGAGAATTCATACTGGGGAAAAACCTTATACA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 TGTAACATATGTGAAAAAGCCTTCAGTGACCATTCAGCCCTTACCCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119373 TGTAACATATGTGAAAAAGCCTTCAGTGACCATTCAGCCCTTACCCAACA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 TAAGAGAATTCATACTAGGGAAAAACCTTACAAATGTAAAATCTGTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119423 TAAGAGAATTCATACTAGGGAAAAACCTTACAAATGTAAAATCTGTGAGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 AAGCCTTTATCCGAAGCACTCACCTGACTCAACATCAGAGGATTCACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119473 AAGCCTTTATCCGAAGCACTCACCTGACTCAACATCAGAGGATTCACACA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 GGAGAGAAACCCTATAAATGTAATAAATGTGGGAAAGCTTTTAACCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119523 GGAGAGAAACCCTATAAATGTAATAAATGTGGGAAAGCTTTTAACCAGAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :
   1524 TGCAAACCTCATTCAGCATCAGAGACATCATATTGGAGAGAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119573 TGCAAACCTCATTCAGCATCAGAGACATCATATTGGAGAGAAG