seq1 = pF1KB7796.tfa, 1554 bp
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>pF1KB7796 1554
>gi568815597f:18531604_18836036 (Chr1)

1-85  (100001-100085)   100% ->
86-321  (102700-102935)   100% ->
322-451  (103508-103637)   100% ->
452-580  (104640-104768)   100% ->
581-780  (160151-160350)   100% ->
781-946  (169050-169215)   100% ->
947-1149  (171491-171693)   100% ->
1150-1554  (204029-204433)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCCCTTCCCGGCACGGTACCGAGAATGATGCGGCCGGCTCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCCCTTCCCGGCACGGTACCGAGAATGATGCGGCCGGCTCCGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCAGAACTACCCCCGCACGGGATTCCCTTTGGAAG         TGTCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100051 GCAGAACTACCCCCGCACGGGATTCCCTTTGGAAGGTA...CAGTGTCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCCCGCTTGGCCAAGGCCGGGTCAATCAGCTGGGAGGGGTCTTCATCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102706 CCCCGCTTGGCCAAGGCCGGGTCAATCAGCTGGGAGGGGTCTTCATCAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGGCGACCCCTGCCTAACCACATCCGCCACAAGATAGTGGAGATGGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102756 GGGCGACCCCTGCCTAACCACATCCGCCACAAGATAGTGGAGATGGCCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCATGGCATCCGGCCCTGTGTCATCTCCCGACAGCTGCGTGTCTCCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102806 CCATGGCATCCGGCCCTGTGTCATCTCCCGACAGCTGCGTGTCTCCCACG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCTGCGTCTCCAAGATTCTTTGCCGCTACCAGGAGACCGGGTCCATCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102856 GCTGCGTCTCCAAGATTCTTTGCCGCTACCAGGAGACCGGGTCCATCCGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCTGGGGCCATCGGCGGCAGCAAGCCCAGA         CAGGTGGCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 102906 CCTGGGGCCATCGGCGGCAGCAAGCCCAGAGTG...AAGCAGGTGGCGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TCCGGATGTAGAGAAAAAGATTGAGGAGTACAAGAGGGAAAACCCAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103519 TCCGGATGTAGAGAAAAAGATTGAGGAGTACAAGAGGGAAAACCCAGGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGTTCAGCTGGGAGATCCGGGACAGGCTGCTGAAGGATGGGCACTGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103569 TGTTCAGCTGGGAGATCCGGGACAGGCTGCTGAAGGATGGGCACTGTGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CGAAGCACTGTGCCCTCAG         TGAGTTCGATTAGCCGCGTGCT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 103619 CGAAGCACTGTGCCCTCAGGTG...TAGTGAGTTCGATTAGCCGCGTGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CAGAATCAAGTTCGGGAAGAAAGAGGAGGAGGATGAAGCGGACAAGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104662 CAGAATCAAGTTCGGGAAGAAAGAGGAGGAGGATGAAGCGGACAAGAAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGGACGACGGCGAAAAGAAGGCCAAACACAGCATCGACGGCATCCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104712 AGGACGACGGCGAAAAGAAGGCCAAACACAGCATCGACGGCATCCTGGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GACAAAG         GGAACCGGCTGGACGAGGGCTCGGATGTGGAGTC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104762 GACAAAGGTA...TAGGGAACCGGCTGGACGAGGGCTCGGATGTGGAGTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GGAACCTGACCTCCCACTGAAGCGCAAGCAGCGACGCAGTCGGACCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160185 GGAACCTGACCTCCCACTGAAGCGCAAGCAGCGACGCAGTCGGACCACAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TCACGGCCGAGCAGCTGGAGGAGCTGGAGAAGGCCTTTGAGAGGACCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160235 TCACGGCCGAGCAGCTGGAGGAGCTGGAGAAGGCCTTTGAGAGGACCCAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TACCCAGACATATACACCCGCGAGGAGCTGGCGCAGAGGACCAAGCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160285 TACCCAGACATATACACCCGCGAGGAGCTGGCGCAGAGGACCAAGCTGAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 AGAGGCGCGTGTGCAG         GTCTGGTTCAGTAACCGCCGCGCCC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 160335 AGAGGCGCGTGTGCAGGTG...CAGGTCTGGTTCAGTAACCGCCGCGCCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GTTGGCGTAAGCAGGCAGGAGCCAACCAGCTGGCGGCGTTCAACCACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169075 GTTGGCGTAAGCAGGCAGGAGCCAACCAGCTGGCGGCGTTCAACCACCTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CTGCCAGGAGGCTTCCCACCCACCGGCATGCCCACGCTGCCCCCCTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169125 CTGCCAGGAGGCTTCCCACCCACCGGCATGCCCACGCTGCCCCCCTACCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GCTGCCGGACTCCACCTACCCCACCACCACCATCTCCCAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 169175 GCTGCCGGACTCCACCTACCCCACCACCACCATCTCCCAAGGTG...CAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 ATGGGGGCAGCACTGTGCACCGGCCTCAGCCCCTGCCACCGTCCACCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171491 ATGGGGGCAGCACTGTGCACCGGCCTCAGCCCCTGCCACCGTCCACCATG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CACCAGGGCGGGCTGGCTGCAGCGGCTGCAGCCGCCGACACCAGCTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171541 CACCAGGGCGGGCTGGCTGCAGCGGCTGCAGCCGCCGACACCAGCTCTGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CTACGGAGCCCGCCACAGCTTCTCCAGCTACTCTGACAGCTTCATGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171591 CTACGGAGCCCGCCACAGCTTCTCCAGCTACTCTGACAGCTTCATGAATC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 CGGCGGCGCCCTCCAACCACATGAACCCGGTCAGCAACGGCCTGTCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171641 CGGCGGCGCCCTCCAACCACATGAACCCGGTCAGCAACGGCCTGTCTCCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 CAG         GTGATGAGCATCTTGGGCAACCCCAGTGCGGTGCCCCC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171691 CAGGTA...CAGGTGATGAGCATCTTGGGCAACCCCAGTGCGGTGCCCCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GCAGCCACAGGCTGACTTCTCCATCTCCCCGCTGCATGGCGGCCTGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204067 GCAGCCACAGGCTGACTTCTCCATCTCCCCGCTGCATGGCGGCCTGGACT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 CGGCCACCTCCATCTCAGCCAGCTGCAGCCAGCGGGCCGACTCCATCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204117 CGGCCACCTCCATCTCAGCCAGCTGCAGCCAGCGGGCCGACTCCATCAAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 CCAGGAGACAGCCTGCCCACCTCCCAGGCCTACTGCCCACCCACCTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204167 CCAGGAGACAGCCTGCCCACCTCCCAGGCCTACTGCCCACCCACCTACAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 CACCACCGGCTACAGCGTGGACCCCGTGGCCGGCTATCAGTACGGCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204217 CACCACCGGCTACAGCGTGGACCCCGTGGCCGGCTATCAGTACGGCCAGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 ACGGCCAGAGTGAGTGCCTGGTGCCCTGGGCGTCCCCCGTCCCCATTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204267 ACGGCCAGAGTGAGTGCCTGGTGCCCTGGGCGTCCCCCGTCCCCATTCCT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 TCTCCCACCCCCAGGGCCTCCTGCTTGTTTATGGAGAGCTACAAGGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204317 TCTCCCACCCCCAGGGCCTCCTGCTTGTTTATGGAGAGCTACAAGGTGGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 GTCAGGGTGGGGAATGTCCATTTCACAGATGGAAAAATTGAAGTCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204367 GTCAGGGTGGGGAATGTCCATTTCACAGATGGAAAAATTGAAGTCCAGCC

   1600     .    :    .
   1538 AGATGGAACAGTTCACC
        |||||||||||||||||
 204417 AGATGGAACAGTTCACC