seq1 = pF1KB7787.tfa, 1374 bp
seq2 = pF1KB7787/gi568815582r_71375173.tfa (gi568815582r:71375173_71579007), 203835 bp

>pF1KB7787 1374
>gi568815582r:71375173_71579007 (Chr16)

(complement)

1-33  (96894-96926)   100% ->
34-160  (100003-100129)   99% ->
161-274  (100667-100780)   100% ->
275-1374  (102736-103835)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGCCATGCCTCTGAAAGCTCAATACCAG         GAGATGGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
  96894 ATGGCAGCCATGCCTCTGAAAGCTCAATACCAGGTG...TAGGAGATGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GACCTTCGAGGATGTGGCTGTGCACTTCACCAAGACAGAATGGACTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100011 GACCTTCGAGGATGTGGCTGTGCACTTCACCAAGACAGAATGGACTGGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTTCTCCTGCCCAGAGGGCCCTGTATAGAAGTGTGATGTTGGAGAATTTT
        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 100061 TTTCTCCTGCCCAGAGGGCCCTGTACAGAAGTGTGATGTTGGAGAATTTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGGAACCTGACTGCTTTGG         GGTACCCAGTTCCCAAACCTGC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100111 GGGAACCTGACTGCTTTGGGTA...CAGGGTACCCAGTTCCCAAACCTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 ACTGATCTCACTTTTGGAGAGAGGGGACATGGCTTGGGGCCTGGAAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100689 ACTGATCTCACTTTTGGAGAGAGGGGACATGGCTTGGGGCCTGGAAGCAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGGATGATCCCCCAGCAGAGAGGACCAAAAACGTCTGTAAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100739 AGGATGATCCCCCAGCAGAGAGGACCAAAAACGTCTGTAAAGGTA...CA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    275  ATGTTGAGACCAACATTGACAGTGAGTCCACATTAATCCAGGGAATTTC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102735 GATGTTGAGACCAACATTGACAGTGAGTCCACATTAATCCAGGGAATTTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TGAAGAAAGAGATGGGATGATGTCACATGGTCAGCTGAAGAGTGTCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102785 TGAAGAAAGAGATGGGATGATGTCACATGGTCAGCTGAAGAGTGTCCCTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGAGAACTGACTTCCCAGAAACACGTAATGTGGAAAAGCACCAGGACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102835 AGAGAACTGACTTCCCAGAAACACGTAATGTGGAAAAGCACCAGGACATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CCCACAGTGAAAAATATCCAAGGAAAGGTTCCAAGAATCCCCTGTGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102885 CCCACAGTGAAAAATATCCAAGGAAAGGTTCCAAGAATCCCCTGTGCAAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GAAACCTTTCATATGTGAGGAGTGTGGGAAATCCTTCAGCTACTTTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102935 GAAACCTTTCATATGTGAGGAGTGTGGGAAATCCTTCAGCTACTTTTCTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ACTATGCTAGACACCAGAGAATCCACACTGGGGAGAAACCTTTTGAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102985 ACTATGCTAGACACCAGAGAATCCACACTGGGGAGAAACCTTTTGAGTGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AGTGAGTGTGGAAAAGCCTTTAATGGTAATTCTTCGTTAATTCGGCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103035 AGTGAGTGTGGAAAAGCCTTTAATGGTAATTCTTCGTTAATTCGGCACCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GAGGATTCACACTGGAGAGAGACCCTATCACTGTGAGGAGTGTGGGCGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
 103085 GAGGATTCACACTGGAGAGAGACCCTATCAGTGTGAGGAGTGTGGGCGAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CCTTTAATGATAATGCAAATCTGATCAGGCATCAGAGAATCCACAGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103135 CCTTTAATGATAATGCAAATCTGATCAGGCATCAGAGAATCCACAGTGGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GACAGACCCTATTACTGTACAGAGTGTGGGAATAGTTTCACCAGTAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 103185 GACAGACCCTATTACTGTACAGAGTGTGGGAATAGTTTCACGAGTAGTTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CGAGTTTGTTATACATCAGAGAATCCACACTGGGGAGAAACCCTATGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103235 CGAGTTTGTTATACATCAGAGAATCCACACTGGGGAGAAACCCTATGAGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 GTAATGAGTGTGGCAAAGCTTTTGTTGGTAATTCACCCTTACTTCGGCAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
 103285 GTAATGAGTGTGGCAAAGCTTTTGTTGGTAATTCACCCCTACTTCGGCAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 CAGAAAATCCACACTGGAGAGAAACCCTATGAGTGTAATGAGTGTGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103335 CAGAAAATCCACACTGGAGAGAAACCCTATGAGTGTAATGAGTGTGGCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 AAGCTTTGGAAGGACTTCCCATCTAAGCCAACATCAGCGTATTCACACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103385 AAGCTTTGGAAGGACTTCCCATCTAAGCCAACATCAGCGTATTCACACAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 GGGAAAAGCCTTATTCTTGTAAAGTATGTGGACAAGCCTTCAATTTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103435 GGGAAAAGCCTTATTCTTGTAAAGTATGTGGACAAGCCTTCAATTTTCAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 ACAAAACTAACTCGGCACCAGAGAATTCACAGTGAGGAGAAACCCTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103485 ACAAAACTAACTCGGCACCAGAGAATTCACAGTGAGGAGAAACCCTTTGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 CTGTGTAGATTGTGGAAAAGCCTTCAGTGCTCAGGAACAATTAAAAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103535 CTGTGTAGATTGTGGAAAAGCCTTCAGTGCTCAGGAACAATTAAAAAGGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 ATCTGAGAATTCATACTCAGGAGTCTTCCTATGTATGTGATGAGTGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103585 ATCTGAGAATTCATACTCAGGAGTCTTCCTATGTATGTGATGAGTGTGGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 AAAGCCTTGACTAGCAAAAGAAATCTTCATCAGCATCAAAGAATCCATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103635 AAAGCCTTGACTAGCAAAAGAAATCTTCATCAGCATCAAAGAATCCATAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 TGGAGAGAAACCCTATGAGTGTAGCAAGTATGAGAAGGCCTTTGGGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103685 TGGAGAGAAACCCTATGAGTGTAGCAAGTATGAGAAGGCCTTTGGGACTT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 CTTCCCAGCTAGGTCACCTTGAGCATGTCTACTCTGGAGAGAAGCCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103735 CTTCCCAGCTAGGTCACCTTGAGCATGTCTACTCTGGAGAGAAGCCTGTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 CTGGACATTTGTCGTTTTGGCCTCCCAGAATTTTTTACCCCCTTTTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103785 CTGGACATTTGTCGTTTTGGCCTCCCAGAATTTTTTACCCCCTTTTACTG

   1400 
   1374 G
        |
 103835 G