seq1 = pF1KB7774.tfa, 1518 bp
seq2 = pF1KB7774/gi568815575f_47270669.tfa (gi568815575f:47270669_47513591), 242923 bp

>pF1KB7774 1518
>gi568815575f:47270669_47513591 (ChrX)

1-72  (100001-100072)   100% ->
73-199  (139608-139734)   100% ->
200-295  (140012-140107)   100% ->
296-1518  (141701-142923)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCAGCTAATGGGACATCACCCCAGAGATTCCCTGCCCTGATTCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCAGCTAATGGGACATCACCCCAGAGATTCCCTGCCCTGATTCCAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGAACCTGGCAGATCTTTTGAG         GGGTCCGTGTCATTCGAGG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100051 AGAACCTGGCAGATCTTTTGAGGTA...CAGGGGTCCGTGTCATTCGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATGTGGCTGTGGATTTCACCCGACAGGAGTGGCACAGACTGGACCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139627 ATGTGGCTGTGGATTTCACCCGACAGGAGTGGCACAGACTGGACCCTGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CAGAGGACCATGCACAAGGATGTGATGCTGGAGACCTACAGCAACCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139677 CAGAGGACCATGCACAAGGATGTGATGCTGGAGACCTACAGCAACCTGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ATCTGTGG         GCCTCTGCGTGGCCAAACCAGAGATGATCTTCA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 139727 ATCTGTGGGTG...CAGGCCTCTGCGTGGCCAAACCAGAGATGATCTTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGTTGGAGCGAGGAGAAGAGCTGTGGATATTAGAGGAGGAATCCTCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140045 AGTTGGAGCGAGGAGAAGAGCTGTGGATATTAGAGGAGGAATCCTCAGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CATGGTTACTCAG         GATCTCTCTCACTGCTGTGTGGCAATGG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 140095 CATGGTTACTCAGGTA...AAGGATCTCTCTCACTGCTGTGTGGCAATGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TTCTGTTGGGGATAATGCCCTCAGGCATGATAATGACCTTCTTCACCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141729 TTCTGTTGGGGATAATGCCCTCAGGCATGATAATGACCTTCTTCACCATC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGAAGATTCAAACATTGGATCAAAATGTTGAATATAATGGATGCAGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141779 AGAAGATTCAAACATTGGATCAAAATGTTGAATATAATGGATGCAGGAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GCCTTCCATGAGAAAACAGGCTTTGTTAGACGTAAAAGAACACCCAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141829 GCCTTCCATGAGAAAACAGGCTTTGTTAGACGTAAAAGAACACCCAGAGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AGATAAAAACTTTGAATGTCATGAATGTGGGAAAGCTTACTGTAGGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141879 AGATAAAAACTTTGAATGTCATGAATGTGGGAAAGCTTACTGTAGGAAGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CAAACCTTGTTGAACATCTGAGAATACACACAGGAGAGAGACCCTATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141929 CAAACCTTGTTGAACATCTGAGAATACACACAGGAGAGAGACCCTATGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TGCGGTGAATGTGCAAAAACCTTCAGTGCAAGATCATACCTCATTGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141979 TGCGGTGAATGTGCAAAAACCTTCAGTGCAAGATCATACCTCATTGCTCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TCAGAAAACTCACACAGGGGAGAGGCCCTTTGAATGTAATGAATGTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142029 TCAGAAAACTCACACAGGGGAGAGGCCCTTTGAATGTAATGAATGTGGGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AATCTTTTGGCAGGAAGTCACAACTCATCCTACATACAAGAACACACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142079 AATCTTTTGGCAGGAAGTCACAACTCATCCTACATACAAGAACACACACT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GGAGAGAGACCCTATGAATGTACTGAATGTGGGAAAACCTTTTCTGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142129 GGAGAGAGACCCTATGAATGTACTGAATGTGGGAAAACCTTTTCTGAGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GGCAACCCTCACGATTCATCAGAGAACTCACACAGGGGAGAAACCCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142179 GGCAACCCTCACGATTCATCAGAGAACTCACACAGGGGAGAAACCCTATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 AATGTAGTGAATGTGGGAAAACATTTCGTGTAAAGATATCCCTTACCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142229 AATGTAGTGAATGTGGGAAAACATTTCGTGTAAAGATATCCCTTACCCAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 CACCACAGAACTCATACAGGGGAGAAACCTTATGAATGTGGGGAGTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142279 CACCACAGAACTCATACAGGGGAGAAACCTTATGAATGTGGGGAGTGTGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 GAAAAACTTCCGTGCAAAGAAATCCCTAAATCAGCATCAAAGAATTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142329 GAAAAACTTCCGTGCAAAGAAATCCCTAAATCAGCATCAAAGAATTCACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 CAGGTGAGAAACCCTATGAGTGTGGTGAATGTGGGAAATTCTTCCGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142379 CAGGTGAGAAACCCTATGAGTGTGGTGAATGTGGGAAATTCTTCCGAATG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 AAGATGACTCTCAATAATCATCAAAGAACTCACACAGGTGAAAAGCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142429 AAGATGACTCTCAATAATCATCAAAGAACTCACACAGGTGAAAAGCCCTA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 TCAGTGTAATGAATGTGGGAAATCTTTCAGGGTGCACTCATCTCTTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142479 TCAGTGTAATGAATGTGGGAAATCTTTCAGGGTGCACTCATCTCTTGGGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 TCCATCAGAGAATTCACACAGGAGAGAAACCTTACGAATGTAATGAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142529 TCCATCAGAGAATTCACACAGGAGAGAAACCTTACGAATGTAATGAGTGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 GGTAATGCTTTCTATGTGAAAGCACGCCTAATTGAACATCAGAGGATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142579 GGTAATGCTTTCTATGTGAAAGCACGCCTAATTGAACATCAGAGGATGCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 TTCAGGAGAGAAACCCTACGAATGTAGTGAATGTGGGAAAATCTTCAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142629 TTCAGGAGAGAAACCCTACGAATGTAGTGAATGTGGGAAAATCTTCAGTA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 TGAAGAAATCCCTTTGTCAACACCGGAGAACTCACACAGGAGAGAAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142679 TGAAGAAATCCCTTTGTCAACACCGGAGAACTCACACAGGAGAGAAACCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 TATGAATGTAGTGAATGTGGAAATGCCTTCTATGTGAAAGTACGCCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142729 TATGAATGTAGTGAATGTGGAAATGCCTTCTATGTGAAAGTACGCCTCAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 TGAACATCAGCGAATTCACACAGGAGAGAGACCCTTTGAGTGTCAAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142779 TGAACATCAGCGAATTCACACAGGAGAGAGACCCTTTGAGTGTCAAGAAT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 GTGGGAAAGCTTTCTGCCGGAAAGCACACCTCACAGAACATCAGAGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142829 GTGGGAAAGCTTTCTGCCGGAAAGCACACCTCACAGAACATCAGAGAACT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1474 CACATAGGCTGGTCCTGGCGTTGTACAATGAAGAAAGCCTCTCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142879 CACATAGGCTGGTCCTGGCGTTGTACAATGAAGAAAGCCTCTCAC