seq1 = pF1KB7772.tfa, 1515 bp
seq2 = pF1KB7772/gi568815575f_70996529.tfa (gi568815575f:70996529_71201740), 205212 bp

>pF1KB7772 1515
>gi568815575f:70996529_71201740 (ChrX)

1-453  (100001-100453)   100% ->
454-1515  (104156-105216)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATCCGGGGAATGAGAATTCAGCCACAGAGGCTGCCGCGATCATAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATCCGGGGAATGAGAATTCAGCCACAGAGGCTGCCGCGATCATAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTAGATCCCGACTTCGAACCCCAGAGCCGTCCCCGCTCCTGCACCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTAGATCCCGACTTCGAACCCCAGAGCCGTCCCCGCTCCTGCACCTGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCTTCCCCGACCAGAGATCGCTAACCAGCCGTCCGAGCCGCCCGAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCTTCCCCGACCAGAGATCGCTAACCAGCCGTCCGAGCCGCCCGAGGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGCCAGATCTGGGGGAAAAGGTACACACGGAGGGGCGCTCAGAGCCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGCCAGATCTGGGGGAAAAGGTACACACGGAGGGGCGCTCAGAGCCGAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTGTTGCCCTCTCGGCTCCCAGAGCCGGCCGGGGGCCCCCAGCCCGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTGTTGCCCTCTCGGCTCCCAGAGCCGGCCGGGGGCCCCCAGCCCGGAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCCTGGGGGCTGTAACAGGTCCTCGGAAGGGAGGCTCCCGCCGGAATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCCTGGGGGCTGTAACAGGTCCTCGGAAGGGAGGCTCCCGCCGGAATGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TGGGGAAATCAGTCATATGCAGAACTCATCAGCCAGGCCATTGAAAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TGGGGAAATCAGTCATATGCAGAACTCATCAGCCAGGCCATTGAAAGCGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCCGGAGAAGCGACTGACACTTGCCCAGATCTACGAGTGGATGGTCCGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCCGGAGAAGCGACTGACACTTGCCCAGATCTACGAGTGGATGGTCCGTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CTGTACCCTACTTCAAGGACAAGGGTGACAGCAACAGCTCAGCAGGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CTGTACCCTACTTCAAGGACAAGGGTGACAGCAACAGCTCAGCAGGATGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AAG         AACTCGATCCGCCACAACCTGTCCCTGCACAGCAAGTT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AAGGTA...CAGAACTCGATCCGCCACAACCTGTCCCTGCACAGCAAGTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CATCAAGGTTCACAACGAGGCCACCGGCAAAAGCTCTTGGTGGATGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104194 CATCAAGGTTCACAACGAGGCCACCGGCAAAAGCTCTTGGTGGATGCTGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 ACCCTGAGGGAGGCAAGAGCGGCAAAGCCCCCCGCCGCCGGGCCGCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104244 ACCCTGAGGGAGGCAAGAGCGGCAAAGCCCCCCGCCGCCGGGCCGCCTCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 ATGGATAGCAGCAGCAAGCTGCTCCGGGGCCGCAGTAAAGCCCCCAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104294 ATGGATAGCAGCAGCAAGCTGCTCCGGGGCCGCAGTAAAGCCCCCAAGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GAAACCATCTGTGCTGCCAGCTCCACCCGAAGGTGCCACTCCAACGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104344 GAAACCATCTGTGCTGCCAGCTCCACCCGAAGGTGCCACTCCAACGAGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CTGTCGGCCACTTTGCCAAGTGGTCAGGCAGCCCTTGCTCTCGAAACCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104394 CTGTCGGCCACTTTGCCAAGTGGTCAGGCAGCCCTTGCTCTCGAAACCGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GAAGAAGCCGATATGTGGACCACCTTCCGTCCACGAAGCAGTTCAAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104444 GAAGAAGCCGATATGTGGACCACCTTCCGTCCACGAAGCAGTTCAAATGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CAGCAGTGTCAGCACCCGGCTGTCCCCCTTGAGGCCAGAGTCTGAGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104494 CAGCAGTGTCAGCACCCGGCTGTCCCCCTTGAGGCCAGAGTCTGAGGTGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TGGCGGAGGAAATACCAGCTTCAGTCAGCAGTTATGCAGGGGGTGTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104544 TGGCGGAGGAAATACCAGCTTCAGTCAGCAGTTATGCAGGGGGTGTCCCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 CCCACCCTCAATGAAGGTCTAGAGCTGTTAGATGGGCTCAATCTCACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104594 CCCACCCTCAATGAAGGTCTAGAGCTGTTAGATGGGCTCAATCTCACCTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 TTCCCATTCCCTGCTATCTCGGAGTGGTCTCTCTGGCTTCTCTTTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104644 TTCCCATTCCCTGCTATCTCGGAGTGGTCTCTCTGGCTTCTCTTTGCAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 ATCCTGGGGTTACCGGCCCCTTACACACCTACAGCAGCTCCCTTTTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104694 ATCCTGGGGTTACCGGCCCCTTACACACCTACAGCAGCTCCCTTTTCAGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 CCAGCAGAGGGGCCCCTGTCAGCAGGAGAAGGGTGCTTCTCCAGCTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104744 CCAGCAGAGGGGCCCCTGTCAGCAGGAGAAGGGTGCTTCTCCAGCTCCCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 GGCTCTGGAGGCCCTGCTCACCTCTGATACGCCACCACCCCCTGCTGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104794 GGCTCTGGAGGCCCTGCTCACCTCTGATACGCCACCACCCCCTGCTGACG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 TCCTCATGACCCAGGTAGATCCCATTCTGTCCCAGGCTCCGACTCTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104844 TCCTCATGACCCAGGTAGATCCCATTCTGTCCCAGGCTCCGACTCTTCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 TTGCTGGGGGGGCTTCCTTCCTCCAGTAAGCTGGCCACGGGCGTCGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104894 TTGCTGGGGGGGCTTCCTTCCTCCAGTAAGCTGGCCACGGGCGTCGGCCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 GTGTCCCAAGCCCCTAGAGGCTCCAGGCCCCAGCAGTCTGGTTCCCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104944 GTGTCCCAAGCCCCTAGAGGCTCCAGGCCCCAGCAGTCTGGTTCCCACCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 TTTCTATGATAGCACCACCTCCAGTCATGGCAAGTGCCCCCATCCCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104994 TTTCTATGATAGCACCACCTCCAGTCATGGCAAGTGCCCCCATCCCCAAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 GCTCTGGGGACTCCTGTGCTCACACCCCCTACTGAAGCTGCAAGCCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105044 GCTCTGGGGACTCCTGTGCTCACACCCCCTACTGAAGCTGCAAGCCAAGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 CAGAATGCCTCAGGATCTAGATCTTGATATGTATATGGAGAACCTGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105094 CAGAATGCCTCAGGATCTAGATCTTGATATGTATATGGAGAACCTGGAGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 GTGACATGGATAACATCATCAGTGACCTCATGGATGAGGGCGAGGGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105144 GTGACATGGATAACATCATCAGTGACCTCATGGATGAGGGCGAGGGACTG

   1500     .    :    .    :
   1492 GACTTCAACTTTGAGCCAGATCCC
        ||||||||||||||||||| | |-
 105194 GACTTCAACTTTGAGCCAGGTAC