seq1 = pF1KB7771.tfa, 1350 bp
seq2 = pF1KB7771/gi568815596r_174248500.tfa (gi568815596r:174248500_174495622), 247123 bp

>pF1KB7771 1350
>gi568815596r:174248500_174495622 (Chr2)

(complement)

1-72  (100001-100072)   100% ->
73-167  (107844-107938)   100% ->
168-252  (113846-113928)   90% ->
253-317  (114908-114972)   100% ->
318-366  (115373-115421)   100% ->
367-484  (116583-116700)   100% ->
485-591  (143898-144004)   100% ->
592-677  (144878-144963)   100% ->
678-1350  (146451-147123)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGAAATCCTTCGCCAACTTCATGTGCAAGAAAGACTTTCATCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGAAATCCTTCGCCAACTTCATGTGCAAGAAAGACTTTCATCCTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCCAAATCCAATATCAAAAAA         GTATGGATGGCAGAACAGA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100051 CTCCAAATCCAATATCAAAAAAGTG...TAGGTATGGATGGCAGAACAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAATATCATATGATAAGAAGAAACAAGAAGAATTGATGCAGCAATATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107863 AAATATCATATGATAAGAAGAAACAAGAAGAATTGATGCAGCAATATCTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAAGAACAAGAATCATATGATAATAG         ATTGCTTATGGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 107913 AAAGAACAAGAATCATATGATAATAGGTA...TAGATTGCTTATGGGAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGAACGTGTAAAGAATGGCCTTAATTTCATGTATGAAGCCCCACCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113861 TGAACGTGTAAAGAATGGCCTTAATTTCATGTATGAAGCCCCACCAGGAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTAAAAAAGAAAACAAAGAG         AAAGAAGAAACAGAAGGAGAG
        |||||||||  |-|  |  ->>>...>>>|||||||||||||||||||||
 113911 CTAAAAAAGGTA CTTATC TTC...TAGAAAGAAGAAACAGAAGGAGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 ACCGAATACAAATTTGAATGGCAGAAAGGAGCCCCACGAGAAAA      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 114929 ACCGAATACAAATTTGAATGGCAGAAAGGAGCCCCACGAGAAAAGTA...

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    318    ATATGCCAAAGATGACATGAACATCAGAGATCAGCCCTTTGGTATTC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115370 TAGATATGCCAAAGATGACATGAACATCAGAGATCAGCCCTTTGGTATTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AG         GTTCGAAATGTGAGGTGCATTAAATGTCACAAATGGGGT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115420 AGGCA...CAGGTTCGAAATGTGAGGTGCATTAAATGTCACAAATGGGGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 CATGTCAACACAGATCGAGAATGTCCTTTGTTTGGTCTTTCTGGAATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116622 CATGTCAACACAGATCGAGAATGTCCTTTGTTTGGTCTTTCTGGAATCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 TGCAAGTTCGGTTCCCACTGATGGCTCAG         GGCCATCGATGC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 116672 TGCAAGTTCGGTTCCCACTGATGGCTCAGGTA...CAGGGCCATCGATGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 ACCCCTCGGAGCTAATAGCGGAGATGAGAAACAGTGGGTTTGCACTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143910 ACCCCTCGGAGCTAATAGCGGAGATGAGAAACAGTGGGTTTGCACTGAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 CGAAATGTACTGGGGAGAAACTTGACCGCAAATGATCCATCACAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 143960 CGAAATGTACTGGGGAGAAACTTGACCGCAAATGATCCATCACAGGTA..

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592     GAGTATGTTGCAAGTGAGGGTGAAGAAGATCCAGAAGTTGAATTTT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144010 .CAGGAGTATGTTGCAAGTGAGGGTGAAGAAGATCCAGAAGTTGAATTTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 TAAAGTCACTAACAACCAAACAAAAACAGAAACTTCTCAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 144924 TAAAGTCACTAACAACCAAACAAAAACAGAAACTTCTCAGGTA...CAGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679 AAATTAGATCGACTGGAGAAGAAAAAAAAGAAAAAAGATAGAAAAAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146452 AAATTAGATCGACTGGAGAAGAAAAAAAAGAAAAAAGATAGAAAAAAGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 AAAGTTTCAGAAGAGCAGAAGTAAACACAAAAAACATAAGTCCTCTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146502 AAAGTTTCAGAAGAGCAGAAGTAAACACAAAAAACATAAGTCCTCTTCTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 CCTCATCTTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCTACTGAGACTTCAGAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146552 CCTCATCTTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCTACTGAGACTTCAGAAAGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 AGTAGTGAGAGTGAGAGTAACAATAAAGAAAAAAAAATACAAAGGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146602 AGTAGTGAGAGTGAGAGTAACAATAAAGAAAAAAAAATACAAAGGAAGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 AAGAAAGAAAAACAAGTGTTCAGGGCATAACAACAGTGATTCTGAAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146652 AAGAAAGAAAAACAAGTGTTCAGGGCATAACAACAGTGATTCTGAAGAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 AGGACAAGTCTAAGAAGAGAAAGCTTCATGAAGAACTTTCTAGCAGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146702 AGGACAAGTCTAAGAAGAGAAAGCTTCATGAAGAACTTTCTAGCAGTCAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 CATAACCGGGAAAAAGCCAAGGAAAAGCCCAGGTTCTTAAAACACGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146752 CATAACCGGGAAAAAGCCAAGGAAAAGCCCAGGTTCTTAAAACACGAGAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 TTCTAGGGAGGACAGCAAATGGAGCCATTCTGATTCTGACAAAAAGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146802 TTCTAGGGAGGACAGCAAATGGAGCCATTCTGATTCTGACAAAAAGTCCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 GAACCCATAAACATAGCCCAGAGAAGAGAGGCTCTGAAAGAAAGGAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146852 GAACCCATAAACATAGCCCAGAGAAGAGAGGCTCTGAAAGAAAGGAGGGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 AGCAGCAGAAGCCACGGCAGGGAGGAAAGGAGCCGGAGAAGCCGGAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146902 AGCAGCAGAAGCCACGGCAGGGAGGAAAGGAGCCGGAGAAGCCGGAGCAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 AAGTCCTGGTAGTTACAAGCAAAGGGAGACAAGGAAACGGGCACAGCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146952 AAGTCCTGGTAGTTACAAGCAAAGGGAGACAAGGAAACGGGCACAGCGAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 ATCCTGGTGAAGAGCAAAGCAGAAGAAATGACAGCAGAAGCCATGGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147002 ATCCTGGTGAAGAGCAAAGCAGAAGAAATGACAGCAGAAGCCATGGCACA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 GACTTGTATAGAGGAGAAAAAATGTACAGAGAGCACCCAGGAGGTACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147052 GACTTGTATAGAGGAGAAAAAATGTACAGAGAGCACCCAGGAGGTACACA

   1400     .    :    .    :
   1329 TACTAAAGTGACACAAAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||
 147102 TACTAAAGTGACACAAAGAGAA