seq1 = pF1KB7767.tfa, 1341 bp
seq2 = pF1KB7767/gi568815579r_49241327.tfa (gi568815579r:49241327_49460075), 218749 bp

>pF1KB7767 1341
>gi568815579r:49241327_49460075 (Chr19)

(complement)

1-232  (100001-100232)   100% ->
233-297  (100577-100641)   100% ->
298-360  (102762-102824)   100% ->
361-468  (104657-104764)   100% ->
469-527  (104870-104928)   100% ->
528-592  (108711-108775)   100% ->
593-735  (111231-111373)   100% ->
736-909  (112713-112886)   100% ->
910-1077  (116678-116845)   100% ->
1078-1230  (117486-117638)   100% ->
1231-1341  (118639-118749)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGGAACCCCGGGCTGGGGCCGCCCTGGACGATGGCAGCGGCTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGGAACCCCGGGCTGGGGCCGCCCTGGACGATGGCAGCGGCTGGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGCAGTGAGGAAGGCAGTGAGGAGGGTACCGGCGGCAGTGAGGGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGCAGTGAGGAAGGCAGTGAGGAGGGTACCGGCGGCAGTGAGGGGGCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGGGTGACGGGGGCCCGGATGCAGAGGGGGTGTGGAGCCCAGACATTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGGGTGACGGGGGCCCGGATGCAGAGGGGGTGTGGAGCCCAGACATTGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGAGCTTCCAGGAGGCCCTGGCCATCTATCCACCCTGCGGCCGCCGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAGAGCTTCCAGGAGGCCCTGGCCATCTATCCACCCTGCGGCCGCCGGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AATAATTTTGTCTGATGAAGGCAAGATGTATG         GTCGGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100201 AATAATTTTGTCTGATGAAGGCAAGATGTATGGTG...CAGGTCGGAATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AACTGATCGCCCGCTACATCAAGCTGAGAACGGGGAAGACCCGAACTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100586 AACTGATCGCCCGCTACATCAAGCTGAGAACGGGGAAGACCCGAACTCGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AAACAG         GTTTCTAGTCACATCCAGGTTTTGGCCCGAAGGAA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100636 AAACAGGTC...CAGGTTTCTAGTCACATCCAGGTTTTGGCCCGAAGGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 ATCAAGGGAAATCCAGTCCAAGTTGAAG         GACCAGGTTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 102797 ATCAAGGGAAATCCAGTCCAAGTTGAAGGTA...CAGGACCAGGTTTCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGGACAAGGCTTTCCAGACAATGGCAACCATGTCCTCTGCCCAGCTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104670 AGGACAAGGCTTTCCAGACAATGGCAACCATGTCCTCTGCCCAGCTCATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TCCGCGCCTTCTCTGCAGGCCAAACTGGGTCCCACTGGTCCTCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 104720 TCCGCGCCTTCTCTGCAGGCCAAACTGGGTCCCACTGGTCCTCAGGTG..

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    469     GCCTCTGAGCTTTTCCAGTTTTGGTCTGGAGGATCTGGGCCCCCCT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104770 .CAGGCCTCTGAGCTTTTCCAGTTTTGGTCTGGAGGATCTGGGCCCCCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GGAATGTTCCAGA         TGTGAAGCCATTCTCACAGACACCGTTC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 104916 GGAATGTTCCAGAGTG...CAGTGTGAAGCCATTCTCACAGACACCGTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 ACCTTGTCACTGACTCCCCCATCTACTGACCTCCCAG         GGTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 108739 ACCTTGTCACTGACTCCCCCATCTACTGACCTCCCAGGTA...TAGGGTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 CGAGCCCCCCCAAGCCCTCTCACCCCTGCCCCCACCTACCCCATCGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111235 CGAGCCCCCCCAAGCCCTCTCACCCCTGCCCCCACCTACCCCATCGCCCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CAGCCTGGCAGGCTCGGGGCCTGGGCACCGCCCGGTTGCAGCTGGTAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111285 CAGCCTGGCAGGCTCGGGGCCTGGGCACCGCCCGGTTGCAGCTGGTAGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 TTCTCAGCCTTCGTGGAACCGCCAGATGCAGTTGATTCT         TA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 111335 TTCTCAGCCTTCGTGGAACCGCCAGATGCAGTTGATTCTGTG...CAGTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 CCAGAGGCACCTGTTCGTGCACATCAGCCAGCACTGCCCCAGCCCCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112715 CCAGAGGCACCTGTTCGTGCACATCAGCCAGCACTGCCCCAGCCCCGGAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 CGCCGCCGCTCGAGAGTGTGGACGTCCGGCAGATCTACGACAAATTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112765 CGCCGCCGCTCGAGAGTGTGGACGTCCGGCAGATCTACGACAAATTCCCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GAGAAAAAGGGTGGCCTCCGAGAGCTATATGATCGTGGCCCCCCCCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112815 GAGAAAAAGGGTGGCCTCCGAGAGCTATATGATCGTGGCCCCCCCCATGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CTTCTTCCTGGTCAAGTTCTGG         GCGGACCTGAACTGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 112865 CTTCTTCCTGGTCAAGTTCTGGGTG...CAGGCGGACCTGAACTGGGGCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 CAAGTGGTGAGGAGGCAGGGGCCGGTGGCAGCATCAGCAGTGGTGGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116697 CAAGTGGTGAGGAGGCAGGGGCCGGTGGCAGCATCAGCAGTGGTGGCTTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 TACGGAGTGAGCAGCCAGTATGAGAGCCTGGAACACATGACCCTCACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116747 TACGGAGTGAGCAGCCAGTATGAGAGCCTGGAACACATGACCCTCACCTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 TTCCTCCAAGGTCTGCTCTTTTGGCAAGCAGGTGGTGGAGAAGGTGGAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 116797 TTCCTCCAAGGTCTGCTCTTTTGGCAAGCAGGTGGTGGAGAAGGTGGAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1078         ACGGAACGGGCCCAGCTGGAGGACGGCAGATTTGTGTACCGC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116847 TG...CAGACGGAACGGGCCCAGCTGGAGGACGGCAGATTTGTGTACCGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 CTGCTGCGCTCGCCCATGTGCGAGTACCTGGTGAATTTCTTGCACAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117528 CTGCTGCGCTCGCCCATGTGCGAGTACCTGGTGAATTTCTTGCACAAGTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GCGGCAGCTGCCTGAGCGATACATGATGAACAGCGTCCTGGAAAACTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117578 GCGGCAGCTGCCTGAGCGATACATGATGAACAGCGTCCTGGAAAACTTCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 CCATCCTCCAG         GTGGTGACAAACAGAGACACCCAGGAACTG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 117628 CCATCCTCCAGGTG...CAGGTGGTGACAAACAGAGACACCCAGGAACTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 CTGCTCTGCACCGCCTATGTCTTCGAGGTCTCCACCAGCGAGCGTGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118669 CTGCTCTGCACCGCCTATGTCTTCGAGGTCTCCACCAGCGAGCGTGGGGC

   1400     .    :    .    :    .    :
   1311 CCAGCATCACATTTACCGCCTGGTCAGGGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 118719 CCAGCATCACATTTACCGCCTGGTCAGGGAC