seq1 = pF1KB7766.tfa, 1509 bp
seq2 = pF1KB7766/gi568815579f_20289669.tfa (gi568815579f:20289669_23246553), 2956885 bp

>pF1KB7766 1509
>gi568815579f:20289669_23246553 (Chr19)

1-130  (2844410-2844538)   99% ->
131-226  (2846280-2846375)   100% ->
227-1509  (2855603-2856885)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGAGCGTTGACATTTAGAGATGTGGCCATAGAATTCTCTCTGGAGGA
        |-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2844410 A GGGAGCGTTGACATTTAGAGATGTGGCCATAGAATTCTCTCTGGAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTGGCAATGTCTGGACACCGAACAACAGAATTTATATAGAAATGTAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2844459 GTGGCAATGTCTGGACACCGAACAACAGAATTTATATAGAAATGTAATGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TAGATAACTACAGAAACCTGGTCTTCCTGG         GTATTGCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
2844509 TAGATAACTACAGAAACCTGGTCTTCCTGGGTG...CAGGTATTGCTGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCAAAGCCAGACCTGATCACCTGTCTGGAGCAAGAAAAAGAGCCTTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2846291 TCAAAGCCAGACCTGATCACCTGTCTGGAGCAAGAAAAAGAGCCTTGGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TTTGAAGACACATGATATGGTAGCCAAACCCCCAG         TTATAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
2846341 TTTGAAGACACATGATATGGTAGCCAAACCCCCAGGTA...CAGTTATAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GTTCTCATATTGCCCAAGACCTTTGGCCAGAGCAAGGCATAAAAGATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2855609 GTTCTCATATTGCCCAAGACCTTTGGCCAGAGCAAGGCATAAAAGATTAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTCCAAGAAGTCATACTGAGACAATATAAAAAATGTAGACATGAGAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2855659 TTCCAAGAAGTCATACTGAGACAATATAAAAAATGTAGACATGAGAATTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 ACTGTTAAGAAAAGGCTGTAAAAATGTGGATGAGTTTAAGATGCACAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2855709 ACTGTTAAGAAAAGGCTGTAAAAATGTGGATGAGTTTAAGATGCACAAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AAGGTTATAATAGACATAACCAGTGTTTGACAACTTCCCATAGCAAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2855759 AAGGTTATAATAGACATAACCAGTGTTTGACAACTTCCCATAGCAAAATA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TTTCAGTGTGACAAATATGTGAAAGTCTTTCATAAATTTTCAAATTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2855809 TTTCAGTGTGACAAATATGTGAAAGTCTTTCATAAATTTTCAAATTCAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CAGACATAAGATAAGACATACTTCGAAGAAACCTTTCAAATGTAAAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2855859 CAGACATAAGATAAGACATACTTCGAAGAAACCTTTCAAATGTAAAGAAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GTGGAAAATTATTTTGCATTCTTTCACACTTAGCTCAACATAAAAAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2855909 GTGGAAAATTATTTTGCATTCTTTCACACTTAGCTCAACATAAAAAAATT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CATACTGGAGAGAAATCCTACAAATGTGAAGAATATGGCAAAGCCTTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2855959 CATACTGGAGAGAAATCCTACAAATGTGAAGAATATGGCAAAGCCTTTAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TGAGTCCTCAAACTGTACTACACATAAAAGAATTACTGAGAAAAAACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2856009 TGAGTCCTCAAACTGTACTACACATAAAAGAATTACTGAGAAAAAACCTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 ACAAATGTAAAGAATGTGGCAAAGCCTTTAACTGGTTTTCACATTTTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2856059 ACAAATGTAAAGAATGTGGCAAAGCCTTTAACTGGTTTTCACATTTTACT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 ACACATAAGAGAATTCATACTGGAGAAAAACCCTACCAATGTGAGAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2856109 ACACATAAGAGAATTCATACTGGAGAAAAACCCTACCAATGTGAGAAATG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 TGGCAAATTTTTTAACCAATCCACAAACCTTACTACACATAAAAGAATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2856159 TGGCAAATTTTTTAACCAATCCACAAACCTTACTACACATAAAAGAATTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 ATACTGGAGAGAAACCCTATAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCCTTTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2856209 ATACTGGAGAGAAACCCTATAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCCTTTAAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 CAGTCCTCAAACCTTACTGAACATAAGAAAATTCATACTAAAGAGCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2856259 CAGTCCTCAAACCTTACTGAACATAAGAAAATTCATACTAAAGAGCAACC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 ATACAAATGCGAAAAATGTGGCAAAGCTTTTAAGTGGTCCTCAACCCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2856309 ATACAAATGCGAAAAATGTGGCAAAGCTTTTAAGTGGTCCTCAACCCTTA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 CAAAACATAAAAGAATTCATAATGGAGAAAAACCCTACAAATGTGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2856359 CAAAACATAAAAGAATTCATAATGGAGAAAAACCCTACAAATGTGAAGAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 TGTGGCAAAGCTTTTAACCGATCCTCAACCCTTAATAGACATAAGATAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2856409 TGTGGCAAAGCTTTTAACCGATCCTCAACCCTTAATAGACATAAGATAAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 TCATACTGGAGAGAAACCCTACAAATATAAAGAATGTGGTAAAGCTTTTA
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2856459 TCATACTGGAGGGAAACCCTACAAATATAAAGAATGTGGTAAAGCTTTTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 ACCAATCCTCAACTCTTACTATACATAAGATAATTCATACTGTAGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2856509 ACCAATCCTCAACTCTTACTATACATAAGATAATTCATACTGTAGAGAAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 TTTTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCCTTTAGCCGTATCTCACACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2856559 TTTTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCCTTTAGCCGTATCTCACACCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 TACTACACATAAGAGAATTCATACTGGAGAGAAACCCTACAAATGTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2856609 TACTACACATAAGAGAATTCATACTGGAGAGAAACCCTACAAATGTGAAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 AATGTGGCAGAGCTTTCAACCAGTCCTCAACCCTTACTACACATAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2856659 AATGTGGCAGAGCTTTCAACCAGTCCTCAACCCTTACTACACATAAAAGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 ATTCATACTGGAGAGAAACCCTATGAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2856709 ATTCATACTGGAGAGAAACCCTATGAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCTTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 TAACCGGTCCTCAACCCTCACTACACATAAGATAATTCATTCTGGGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2856759 TAACCGGTCCTCAACCCTCACTACACATAAGATAATTCATTCTGGGGAAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1433 AAATCTACAAATGTAAAGAATGTGGTAAAGCCTTTAGGCGGTTCTCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2856809 AAATCTACAAATGTAAAGAATGTGGTAAAGCCTTTAGGCGGTTCTCACAC

   1500     .    :    .    :    .
   1483 CTTACTAGGCATAAGACAATTCATACA
        |||||||||||||||||||||||||||
2856859 CTTACTAGGCATAAGACAATTCATACA