seq1 = pF1KB7758.tfa, 1494 bp
seq2 = pF1KB7758/gi568815587f_5596233.tfa (gi568815587f:5596233_5809645), 213413 bp

>pF1KB7758 1494
>gi568815587f:5596233_5809645 (Chr11)

1-423  (100001-100423)   100% ->
424-519  (101016-101111)   100% ->
520-750  (102083-102313)   100% ->
751-773  (110362-110384)   100% ->
774-874  (111941-112041)   100% ->
875-901  (112345-112371)   100% ->
902-1494  (112821-113413)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATTTCTCAGTAAAGGTAGACATAGAGAAGGAGGTGACCTGCCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATTTCTCAGTAAAGGTAGACATAGAGAAGGAGGTGACCTGCCCCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGCCTGGAGCTCCTGACAGAACCTCTGAGCCTAGATTGTGGCCACAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGCCTGGAGCTCCTGACAGAACCTCTGAGCCTAGATTGTGGCCACAGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTGCCAAGCCTGCATCACTGCAAAGATCAAGGAGTCAGTGATCATCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTGCCAAGCCTGCATCACTGCAAAGATCAAGGAGTCAGTGATCATCTCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGAGGGGAAAGCAGCTGTCCTGTGTGTCAGACCAGATTCCAGCCTGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGAGGGGAAAGCAGCTGTCCTGTGTGTCAGACCAGATTCCAGCCTGGGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTCCGACCTAATCGGCATCTGGCCAACATAGTTGAGAGAGTCAAAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTCCGACCTAATCGGCATCTGGCCAACATAGTTGAGAGAGTCAAAGAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCAAGATGAGCCCACAGGAGGGGCAGAAGAGAGATGTCTGTGAGCACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCAAGATGAGCCCACAGGAGGGGCAGAAGAGAGATGTCTGTGAGCACCAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGAAAAAAACTCCAGATCTTCTGTAAGGAGGATGGAAAAGTCATTTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGAAAAAAACTCCAGATCTTCTGTAAGGAGGATGGAAAAGTCATTTGCTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGTTTGTGAACTGTCTCAGGAACACCAAGGTCACCAAACATTCCGCATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGTTTGTGAACTGTCTCAGGAACACCAAGGTCACCAAACATTCCGCATAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACGAGGTGGTCAAGGAATGTCAG         GAAAAGCTGCAGGTAGCC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100401 ACGAGGTGGTCAAGGAATGTCAGGTA...CAGGAAAAGCTGCAGGTAGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CTGCAGAGGCTGATAAAGGAGGATCAAGAGGCTGAGAAGCTGGAAGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101034 CTGCAGAGGCTGATAAAGGAGGATCAAGAGGCTGAGAAGCTGGAAGATGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CATCAGACAAGAGAGAACCGCCTGGAAG         AATTATATCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 101084 CATCAGACAAGAGAGAACCGCCTGGAAGGCA...AAGAATTATATCCAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TCGAGAGACAGAAGATTCTGAAAGGGTTCAATGAAATGAGAGTCATCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102096 TCGAGAGACAGAAGATTCTGAAAGGGTTCAATGAAATGAGAGTCATCTTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GACAATGAGGAGCAGAGAGAGCTGCAAAAGCTGGAGGAAGGTGAGGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102146 GACAATGAGGAGCAGAGAGAGCTGCAAAAGCTGGAGGAAGGTGAGGTGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TGTGCTGGATAACCTGGCAGCAGCTACAGACCAGCTGGTCCAGCAGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102196 TGTGCTGGATAACCTGGCAGCAGCTACAGACCAGCTGGTCCAGCAGAGGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 AGGATGCCAGCACGCTCATCTCAGATCTCCAGCGGAGGTTGAGGGGATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102246 AGGATGCCAGCACGCTCATCTCAGATCTCCAGCGGAGGTTGAGGGGATCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 TCAGTAGAGATGCTGCAG         GATGTGATTGACGTCATGAAAAG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 102296 TCAGTAGAGATGCTGCAGGTA...CAGGATGTGATTGACGTCATGAAAAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774          GAGTGAAAGCTGGACATTGAAGAAGCCAAAATCTGTTTCCA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110385 GTA...TAGGAGTGAAAGCTGGACATTGAAGAAGCCAAAATCTGTTTCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 AGAAACTAAAGAGTGTATTCCGAGTACCAGATCTGAGTGGGATGCTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111982 AGAAACTAAAGAGTGTATTCCGAGTACCAGATCTGAGTGGGATGCTGCAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 GTTCTTAAAG         AGCTGACAGATGTCCAGTACTACTGGG    
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||>>>.
 112032 GTTCTTAAAGGTA...CAGAGCTGACAGATGTCCAGTACTACTGGGGTA.

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    902      TGGACGTGATGCTGAATCCAGGCAGTGCCACTTCGAATGTTGCTA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112376 ..CAGTGGACGTGATGCTGAATCCAGGCAGTGCCACTTCGAATGTTGCTA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TTTCTGTGGATCAGAGACAAGTGAAAACTGTACGCACCTGCACATTTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112866 TTTCTGTGGATCAGAGACAAGTGAAAACTGTACGCACCTGCACATTTAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 AATTCAAATCCATGTGATTTTTCTGCTTTTGGTGTCTTCGGCTGCCAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112916 AATTCAAATCCATGTGATTTTTCTGCTTTTGGTGTCTTCGGCTGCCAATA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 TTTCTCTTCGGGGAAATATTACTGGGAAGTAGATGTGTCTGGAAAGATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112966 TTTCTCTTCGGGGAAATATTACTGGGAAGTAGATGTGTCTGGAAAGATTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 CCTGGATCCTGGGCGTACACAGTAAAATAAGTAGTCTGAATAAAAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113016 CCTGGATCCTGGGCGTACACAGTAAAATAAGTAGTCTGAATAAAAGGAAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 AGCTCTGGGTTTGCTTTTGATCCAAGTGTAAATTATTCAAAAGTTTACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113066 AGCTCTGGGTTTGCTTTTGATCCAAGTGTAAATTATTCAAAAGTTTACTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 CAGATATAGACCTCAATATGGCTACTGGGTTATAGGATTACAGAATACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113116 CAGATATAGACCTCAATATGGCTACTGGGTTATAGGATTACAGAATACAT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 GTGAATATAATGCTTTTGAGGACTCCTCCTCTTCTGATCCCAAGGTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113166 GTGAATATAATGCTTTTGAGGACTCCTCCTCTTCTGATCCCAAGGTTTTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 ACTCTCTTTATGGCTGTGCCTCCCTGTCGTATTGGGGTTTTCCTAGACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113216 ACTCTCTTTATGGCTGTGCCTCCCTGTCGTATTGGGGTTTTCCTAGACTA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 TGAGGCAGGCATTGTCTCATTTTTCAATGTCACAAACCACGGAGCACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113266 TGAGGCAGGCATTGTCTCATTTTTCAATGTCACAAACCACGGAGCACTCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1397 TCTACAAGTTCTCTGGATGTCGCTTTTCTCGACCTGCTTATCCGTATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113316 TCTACAAGTTCTCTGGATGTCGCTTTTCTCGACCTGCTTATCCGTATTTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1447 AATCCTTGGAACTGCCTAGTCCCCATGACTGTGTGCCCACCGAGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113366 AATCCTTGGAACTGCCTAGTCCCCATGACTGTGTGCCCACCGAGCTCC