seq1 = pF1KB7751.tfa, 1335 bp
seq2 = pF1KB7751/gi568815590f_75439993.tfa (gi568815590f:75439993_75664093), 224101 bp

>pF1KB7751 1335
>gi568815590f:75439993_75664093 (Chr8)

1-88  (100001-100088)   100% ->
89-257  (103819-103987)   100% ->
258-352  (107595-107689)   100% ->
353-459  (111396-111502)   100% ->
460-615  (113050-113205)   100% ->
616-703  (115990-116077)   100% ->
704-856  (118526-118678)   100% ->
857-1093  (118809-119045)   100% ->
1094-1216  (120352-120474)   100% ->
1217-1335  (123983-124101)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACATGGCAAATTACAGTGAAGTTTTGGACCCAACTTACACAACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACATGGCAAATTACAGTGAAGTTTTGGACCCAACTTACACAACTTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGTTTGAAACTATGCAGATTCTATATAATTCAAGTG         ATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100051 GGAGTTTGAAACTATGCAGATTCTATATAATTCAAGTGGTG...CAGATA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GTTCTGCCCCAGAGACAAGTATGAATACCACAGACAACGGTGTCAACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103822 GTTCTGCCCCAGAGACAAGTATGAATACCACAGACAACGGTGTCAACTGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGTGTGCTATCTGTGGGGACAGAGCAACAGGAAAACACTATGGGGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103872 CTGTGTGCTATCTGTGGGGACAGAGCAACAGGAAAACACTATGGGGCATC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAGCTGTGATGGGTGCAAGGGTTTCTTCAGACGCAGCATTCGTAAGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103922 CAGCTGTGATGGGTGCAAGGGTTTCTTCAGACGCAGCATTCGTAAGAGTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACGTTTATTCTTGCAG         GTTCAGTCGGCAATGTGTTGTTGAC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 103972 ACGTTTATTCTTGCAGGTA...TAGGTTCAGTCGGCAATGTGTTGTTGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAGGACAAAAGGAATCAATGTAGATATTGTCGATTAAGAAAGTGTTTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107620 AAGGACAAAAGGAATCAATGTAGATATTGTCGATTAAGAAAGTGTTTTAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGCGGGAATGAAAAAAGAAG         CTGTACAAAATGAACGTGACA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 107670 AGCGGGAATGAAAAAAGAAGGTA...TAGCTGTACAAAATGAACGTGACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GAATAAGCACCAGAAGAAGCACATTTGATGGCAGCAACATCCCCTCCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111417 GAATAAGCACCAGAAGAAGCACATTTGATGGCAGCAACATCCCCTCCATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AACACACTGGCACAAGCTGAAGTTCGGTCTCGCCAG         ATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 111467 AACACACTGGCACAAGCTGAAGTTCGGTCTCGCCAGGTA...TAGATCTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AGTCTCAAGCCCTGGGTCAAGCACTGACATAAACGTTAAGAAAATTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113055 AGTCTCAAGCCCTGGGTCAAGCACTGACATAAACGTTAAGAAAATTGCAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GTATTGGTGATGTCTGTGAATCTATGAAACAGCAGCTCTTAGTCTTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113105 GTATTGGTGATGTCTGTGAATCTATGAAACAGCAGCTCTTAGTCTTGGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GAATGGGCTAAATATATTCCTGCCTTCTGTGAATTACCATTGGATGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113155 GAATGGGCTAAATATATTCCTGCCTTCTGTGAATTACCATTGGATGATCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 G         GTGGCACTGTTGAGAGCTCACGCAGGGGAGCACTTACTGC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113205 GGTA...AAGGTGGCACTGTTGAGAGCTCACGCAGGGGAGCACTTACTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TTGGAGCTACAAAGAGATCCATGATGTATAAAGATATTTTGCTTTTGG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 116030 TTGGAGCTACAAAGAGATCCATGATGTATAAAGATATTTTGCTTTTGGGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    704        GAAACAACTATGTTATTCACCGCAACAGCTGTGAAGTTGAGAT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116080 A...TAGGAAACAACTATGTTATTCACCGCAACAGCTGTGAAGTTGAGAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TAGCCGTGTGGCCAATCGTGTTCTAGATGAGCTGGTTAGACCATTTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118569 TAGCCGTGTGGCCAATCGTGTTCTAGATGAGCTGGTTAGACCATTTCAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AAATCCAGATTGATGACAATGAGTATGCTTGTTTAAAGGCAATTGTATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118619 AAATCCAGATTGATGACAATGAGTATGCTTGTTTAAAGGCAATTGTATTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TTTGATCCAG         ATGCAAAAGGGCTAAGCGATCCAGTAAAAAT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 118669 TTTGATCCAGGTT...TAGATGCAAAAGGGCTAAGCGATCCAGTAAAAAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TAAGAACATGAGGTTCCAAGTGCAGATCGGTTTGGAGGACTACATCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118840 TAAGAACATGAGGTTCCAAGTGCAGATCGGTTTGGAGGACTACATCAATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 ATCGGCAGTATGACTCCCGGGGGAGGTTTGGAGAGTTGCTTCTGCTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118890 ATCGGCAGTATGACTCCCGGGGGAGGTTTGGAGAGTTGCTTCTGCTCCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CCCACACTGCAGAGCATCACGTGGCAAATGATTGAGCAAATACAGTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118940 CCCACACTGCAGAGCATCACGTGGCAAATGATTGAGCAAATACAGTTTGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TAAACTTTTTGGGATGGTTAAAATTGACAATCTACTTCAGGAAATGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118990 TAAACTTTTTGGGATGGTTAAAATTGACAATCTACTTCAGGAAATGCTAT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TAGGTG         GGGCTTCCAATGATGGCAGTCATCTCCATCATCCA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119040 TAGGTGGTG...TAGGGGCTTCCAATGATGGCAGTCATCTCCATCATCCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 ATGCATCCACATTTGTCTCAAGACCCATTAACTGGACAAACTATACTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120387 ATGCATCCACATTTGTCTCAAGACCCATTAACTGGACAAACTATACTTTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 AGGTCCCATGTCAACACTGGTTCATGCAGACCAGATCT         CAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 120437 AGGTCCCATGTCAACACTGGTTCATGCAGACCAGATCTGTA...CAGCAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 CTCCTGAAACCCCACTCCCTTCCCCACCACAAGGCTCTGGGCAAGAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123986 CTCCTGAAACCCCACTCCCTTCCCCACCACAAGGCTCTGGGCAAGAACAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 TACAAAATAGCTGCAAACCAAGCATCAGTCATTTCACACCAGCATCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124036 TACAAAATAGCTGCAAACCAAGCATCAGTCATTTCACACCAGCATCTCTC

   1400     .    :    .
   1320 CAAACAAAAGCAATTG
        ||||||||||||||||
 124086 CAAACAAAAGCAATTG