seq1 = pF1KB7750.tfa, 1404 bp
seq2 = pF1KB7750/gi568815584r_89062417.tfa (gi568815584r:89062417_89512476), 450060 bp

>pF1KB7750 1404
>gi568815584r:89062417_89512476 (Chr14)

(complement)

1-543  (100001-100543)   100% ->
544-680  (161669-161805)   100% ->
681-745  (231463-231527)   100% ->
746-851  (331671-331776)   100% ->
852-1404  (349508-350060)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGTCCAGTCATGCCTCCCAGTAAGAAGCCAGAAAGCTCAGGAATTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGTCCAGTCATGCCTCCCAGTAAGAAGCCAGAAAGCTCAGGAATTAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTCTCCAGTGGACTGAGTCAGTGTTACGGGGGCAGCGGTTTCTCCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTCTCCAGTGGACTGAGTCAGTGTTACGGGGGCAGCGGTTTCTCCAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCTTCAGGAAGACGATGACCTCGACTTTTCTCTGCCTGACATCCGATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCTTCAGGAAGACGATGACCTCGACTTTTCTCTGCCTGACATCCGATTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAAGAGGGGGCCATGGAAGATGAAGAGCTGACCAACCTGAACTGGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAAGAGGGGGCCATGGAAGATGAAGAGCTGACCAACCTGAACTGGCTGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGAGAGCAAGAACTTGCTGAAGAGCTTTGGGGAGTCGGTCCTCAGGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGAGAGCAAGAACTTGCTGAAGAGCTTTGGGGAGTCGGTCCTCAGGAGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCAGCCCCGTCCAGGACCTGGACGATGACACCCCCCCATCCCCTGCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCAGCCCCGTCCAGGACCTGGACGATGACACCCCCCCATCCCCTGCCCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TCTGACATGCCCTACGATGCCAGGCAGAACCCCAACTGCAAACCCCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TCTGACATGCCCTACGATGCCAGGCAGAACCCCAACTGCAAACCCCCCTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTCCTTCAGCTGCCTCATATTTATGGCCATCGAGGACTCTCCAACCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTCCTTCAGCTGCCTCATATTTATGGCCATCGAGGACTCTCCAACCAAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCCTGCCAGTGAAGGATATCTACAACTGGATCTTGGAACATTTTCCGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCCTGCCAGTGAAGGATATCTACAACTGGATCTTGGAACATTTTCCGTAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTTGCAAATGCACCTACTGGGTGGAAAAACTCAGTGAGACACAATTTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTTGCAAATGCACCTACTGGGTGGAAAAACTCAGTGAGACACAATTTATC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ATTGAATAAGTGTTTTAAGAAAGTGGACAAAGAGAGGAGTCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100501 ATTGAATAAGTGTTTTAAGAAAGTGGACAAAGAGAGGAGTCAGGTA...C

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    544   AGTATTGGGAAAGGGTCGTTGTGGTGCATAGACCCAGAGTATAGACAA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161667 AGAGTATTGGGAAAGGGTCGTTGTGGTGCATAGACCCAGAGTATAGACAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 AATCTAATTCAGGCTTTGAAAAAGACACCTTATCACCCACACCCACACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161717 AATCTAATTCAGGCTTTGAAAAAGACACCTTATCACCCACACCCACACGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GTTCAATACACCTCCCACCTGTCCTCAGGCATATCAAAG         CA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 161767 GTTCAATACACCTCCCACCTGTCCTCAGGCATATCAAAGGTA...CAGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 CATCAGGTCCACCCATCTGGCCGGGCAGTACCTTCTTCAAGAGAAATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231465 CATCAGGTCCACCCATCTGGCCGGGCAGTACCTTCTTCAAGAGAAATGGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 GCCCTTCTCCAAG         TTCCTCCAGGAGTGATCCAAAATGGAGC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 231515 GCCCTTCTCCAAGGTA...CAGTTCCTCCAGGAGTGATCCAAAATGGAGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GCGGGTCCTGAGCCGAGGGCTGTTTCCTGGCGTGCGGCCGCTGCCAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 331699 GCGGGTCCTGAGCCGAGGGCTGTTTCCTGGCGTGCGGCCGCTGCCAATCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 CTCCCATTGGGGTGACAGCGGCCATGAG         GAATGGCATCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 331749 CTCCCATTGGGGTGACAGCGGCCATGAGGTA...CAGGAATGGCATCACC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 AGCTGCCGGATGCGGACTGAGAGTGAGCCATCTTGTGGCTCCCCAGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 349521 AGCTGCCGGATGCGGACTGAGAGTGAGCCATCTTGTGGCTCCCCAGTGGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CAGCGGAGACCCCAAGGAGGATCACAACTACAGCAGTGCCAAGTCCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 349571 CAGCGGAGACCCCAAGGAGGATCACAACTACAGCAGTGCCAAGTCCTCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 ACGCCCGGAGCACCTCGCCCACCAGCGACTCCATCTCCTCCTCCTCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 349621 ACGCCCGGAGCACCTCGCCCACCAGCGACTCCATCTCCTCCTCCTCCTCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 TCAGCCGACGACCACTATGAGTTTGCCACCAAGGGGAGCCAGGAGGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 349671 TCAGCCGACGACCACTATGAGTTTGCCACCAAGGGGAGCCAGGAGGGCAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 CGAGGGCAGCGAGGGGAGCTTCCGGAGCCACGAGAGCCCCAGCGACACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 349721 CGAGGGCAGCGAGGGGAGCTTCCGGAGCCACGAGAGCCCCAGCGACACGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 AAGAGGACGACAGGAAGCACAGCCAGAAGGAGCCCAAGGATTCTCTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 349771 AAGAGGACGACAGGAAGCACAGCCAGAAGGAGCCCAAGGATTCTCTGGGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 GACAGCGGGTACGCATCCCAGCACAAGAAGCGCCAGCACTTCGCCAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 349821 GACAGCGGGTACGCATCCCAGCACAAGAAGCGCCAGCACTTCGCCAAGGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 CAGGAAGGTCCCCAGCGACACACTGCCCCTCAAAAAGAGACGCACCGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 349871 CAGGAAGGTCCCCAGCGACACACTGCCCCTCAAAAAGAGACGCACCGAAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 AGCCCCCCGAGAGCGATGATGAGGAGATGAAAGAAGCGGCAGGGTCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 349921 AGCCCCCCGAGAGCGATGATGAGGAGATGAAAGAAGCGGCAGGGTCCCTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 CTGCACTTAGCAGGGATCCGGTCCTGTTTGAATAACATCACCAATCGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 349971 CTGCACTTAGCAGGGATCCGGTCCTGTTTGAATAACATCACCAATCGGAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 GGCAAAGGGGCAGAAAGAGCAAAAGGAAACCACAAAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 350021 GGCAAAGGGGCAGAAAGAGCAAAAGGAAACCACAAAAAAT