seq1 = pF1KB7749.tfa, 1329 bp
seq2 = pF1KB7749/gi568815591r_27007918.tfa (gi568815591r:27007918_27210640), 202723 bp

>pF1KB7749 1329
>gi568815591r:27007918_27210640 (Chr7)

(complement)

1-526  (100001-100526)   100% ->
527-1329  (101921-102723)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAAAAAGCGACCTACTACGACAGCTCGGCGATCTACGGTGGCTACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAAAAAGCGACCTACTACGACAGCTCGGCGATCTACGGTGGCTACCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTACCAGGCAGCCAACGGGTTCGCTTATAATGCCAATCAGCAGCCGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTACCAGGCAGCCAACGGGTTCGCTTATAATGCCAATCAGCAGCCGTACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGCGTCCGCCGCTTTGGGCGCCGACGGCGAGTACCACCGACCCGCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGGCGTCCGCCGCTTTGGGCGCCGACGGCGAGTACCACCGACCCGCCTGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCCCTCCAGTCTCCCTCCAGCGCCGGGGGCCACCCCAAGGCACACGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCCCTCCAGTCTCCCTCCAGCGCCGGGGGCCACCCCAAGGCACACGAACT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAGTGAGGCGTGCCTGCGCACCCTGAGCGCCCCACCTAGCCAGCCTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAGTGAGGCGTGCCTGCGCACCCTGAGCGCCCCACCTAGCCAGCCTCCAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCCTGGGAGAGCCGCCCCTGCACCCGCCGCCGCCCCAGGCCGCGCCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCCTGGGAGAGCCGCCCCTGCACCCGCCGCCGCCCCAGGCCGCGCCCCCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCCCCACAGCCGCCTCAGCCCGCACCTCAGCCCCCTGCACCTACCCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCCCCACAGCCGCCTCAGCCCGCACCTCAGCCCCCTGCACCTACCCCTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGCGCCCCCGCCTCCCTCTTCTGCCTCCCCTCCTCAGAATGCCAGCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGCGCCCCCGCCTCCCTCTTCTGCCTCCCCTCCTCAGAATGCCAGCAACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACCCTACCCCTGCCAACGCGGCCAAGAGCCCCCTGCTCAACTCACCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACCCTACCCCTGCCAACGCGGCCAAGAGCCCCCTGCTCAACTCACCCACA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTGGCCAAACAAATCTTCCCCTGGATGAAAGAGTCTCGACAAAACACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTGGCCAAACAAATCTTCCCCTGGATGAAAGAGTCTCGACAAAACACAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCAGAAAACCAGCAGCTCCAGCTCAG         GCGAAAGCTGCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100501 GCAGAAAACCAGCAGCTCCAGCTCAGGTA...CAGGCGAAAGCTGCGCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GCGACAAGAGCCCGCCGGGGCAGGCTTCGTCCAAGCGCGCGCGCACGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101936 GCGACAAGAGCCCGCCGGGGCAGGCTTCGTCCAAGCGCGCGCGCACGGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 TACACGAGCGCGCAGCTGGTGGAGCTGGAGAAAGAGTTCCACTTCAACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101986 TACACGAGCGCGCAGCTGGTGGAGCTGGAGAAAGAGTTCCACTTCAACCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CTACCTGTGCCGGCCGCGCCGGGTGGAGATGGCCAATCTGCTGAACCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102036 CTACCTGTGCCGGCCGCGCCGGGTGGAGATGGCCAATCTGCTGAACCTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CTGAGCGCCAGATCAAGATCTGGTTCCAGAATCGCCGCATGAAGTACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102086 CTGAGCGCCAGATCAAGATCTGGTTCCAGAATCGCCGCATGAAGTACAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 AAGGATCAGAAGGGCAAGGGCATGCTAACGTCATCGGGGGGCCAGTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102136 AAGGATCAGAAGGGCAAGGGCATGCTAACGTCATCGGGGGGCCAGTCTCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 AAGTCGCAGCCCCGTGCCCCCCGGAGCCGGTGGCTATCTGAACTCTATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102186 AAGTCGCAGCCCCGTGCCCCCCGGAGCCGGTGGCTATCTGAACTCTATGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 ATTCGCTGGTCAACAGCGTCCCGTATGAGCCCCAGTCGCCCCCGCCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102236 ATTCGCTGGTCAACAGCGTCCCGTATGAGCCCCAGTCGCCCCCGCCCTTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 TCCAAGCCCCCCCAGGGTACCTACGGGCTGCCCCCCGCCTCCTACCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102286 TCCAAGCCCCCCCAGGGTACCTACGGGCTGCCCCCCGCCTCCTACCCTGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 GTCCCTGCCCAGCTGCGCACCCCCGCCACCCCCACAGAAGCGCTACACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102336 GTCCCTGCCCAGCTGCGCACCCCCGCCACCCCCACAGAAGCGCTACACGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 CGGCAGGGGCGGGCGCAGGGGGCACCCCCGACTATGACCCGCACGCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102386 CGGCAGGGGCGGGCGCAGGGGGCACCCCCGACTATGACCCGCACGCTCAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 GGCCTGCAGGGCAACGGCAGCTATGGGACCCCACACATACAGGGAAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102436 GGCCTGCAGGGCAACGGCAGCTATGGGACCCCACACATACAGGGAAGCCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 CGTCTTCGTGGGGGGCAGCTATGTGGAGCCCATGAGCAACTCCGGGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102486 CGTCTTCGTGGGGGGCAGCTATGTGGAGCCCATGAGCAACTCCGGGCCAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 CCCTCTTTGGTCTAACTCACCTCCCCCACGCTGCCTCGGGCGCCATGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102536 CCCTCTTTGGTCTAACTCACCTCCCCCACGCTGCCTCGGGCGCCATGGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 TATGGGGGTGCCGGGCCGCTGGGCAGCGGCCACCACCACGGGCCGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102586 TATGGGGGTGCCGGGCCGCTGGGCAGCGGCCACCACCACGGGCCGGGGCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 TGGGGAGCCGCACCCCACCTACACGGACCTTACCGGCCACCATCCTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102636 TGGGGAGCCGCACCCCACCTACACGGACCTTACCGGCCACCATCCTTCTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .
   1292 AGGGAAGAATTCAGGAAGCACCCAAGCTCACCCACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102686 AGGGAAGAATTCAGGAAGCACCCAAGCTCACCCACCTG