seq1 = pF1KB7748.tfa, 1464 bp
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>pF1KB7748 1464
>gi568815597f:220779858_220984701 (Chr1)

1-592  (100001-100592)   100% ->
593-772  (101337-101516)   100% ->
773-957  (102307-102491)   100% ->
958-1464  (104338-104844)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTCGCAGCCGGGCTGGCTCCCTTCTACGCCTCCAACTTCAGCCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTCGCAGCCGGGCTGGCTCCCTTCTACGCCTCCAACTTCAGCCTCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTCGGCCGCTTACTGCTCCTCGGCCGGCCCAGGCGGCTGCTCCTTCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTCGGCCGCTTACTGCTCCTCGGCCGGCCCAGGCGGCTGCTCCTTCCCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGACCCCGCCGCCGTCAAAAAGCCCTCCTTCTGCATCGCAGACATTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGACCCCGCCGCCGTCAAAAAGCCCTCCTTCTGCATCGCAGACATTCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CACGCCGGCGTGGGGGATCTGGGGGCGGCCCCGGAGGGCCTGGCAGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CACGCCGGCGTGGGGGATCTGGGGGCGGCCCCGGAGGGCCTGGCAGGGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTCGGCCGCCGCCCTCACCGCGCACTTGGGCTCGGTTCACCCGCACGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTCGGCCGCCGCCCTCACCGCGCACTTGGGCTCGGTTCACCCGCACGCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTTTCCAAGCGGCGGCCAGATCCCCGCTTCGACCCACCCCAGTGGTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTTTCCAAGCGGCGGCCAGATCCCCGCTTCGACCCACCCCAGTGGTGGCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCCTCCGAAGTCCCGGCTGGCTTCCCGCAGCGGCTGTCTCCGCTCTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCCTCCGAAGTCCCGGCTGGCTTCCCGCAGCGGCTGTCTCCGCTCTCAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGCCTACCACCACCATCACCCGCAACAACAACAGCAGCAGCAACAGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGCCTACCACCACCATCACCCGCAACAACAACAGCAGCAGCAACAGCCGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGCAGCAACAGCCTCCGCCTCCGCCCCGGGCTGGCGCCCTGCAGCCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGCAGCAACAGCCTCCGCCTCCGCCCCGGGCTGGCGCCCTGCAGCCCCCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCCTCGGGGACGCGAGTGGTTCCGAACCCCCACCACAGTGGCTCTGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCCTCGGGGACGCGAGTGGTTCCGAACCCCCACCACAGTGGCTCTGCCCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGCCCCCTCCAGCAAAGACCTCAAATTTGGAATTGACCGCATTTTATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGCCCCCTCCAGCAAAGACCTCAAATTTGGAATTGACCGCATTTTATCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CAGAATTTGACCCAAAAGTCAAAGAAGGCAACACGCTGAGAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100551 CAGAATTTGACCCAAAAGTCAAAGAAGGCAACACGCTGAGAGGTA...CA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    593  ATCTCACTTCCCTGCTAACCGGTGGGCGGCCCGCCGGGGTGCACCTCTC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101336 GATCTCACTTCCCTGCTAACCGGTGGGCGGCCCGCCGGGGTGCACCTCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 AGGCCTGCAGCCCTCGGCCGGCCAGTTCTTCGCATCTCTAGATCCCATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101386 AGGCCTGCAGCCCTCGGCCGGCCAGTTCTTCGCATCTCTAGATCCCATTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 ACGAGGCTTCTGCAATCCTGAGTCCCTTAAACTCGAACCCAAGAAATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101436 ACGAGGCTTCTGCAATCCTGAGTCCCTTAAACTCGAACCCAAGAAATTCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GTTCAGCATCAGTTCCAAGACACGTTTCCAG         GTCCCTATGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 101486 GTTCAGCATCAGTTCCAAGACACGTTTCCAGGTA...CAGGTCCCTATGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 TGTGCTCACGAAGGACACCATGCCGCAGACGTACAAAAGGAAGCGTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102317 TGTGCTCACGAAGGACACCATGCCGCAGACGTACAAAAGGAAGCGTTCAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 GGTCGCGCGCTGTGTTCTCCAACCTGCAGAGGAAAGGCCTGGAGAAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102367 GGTCGCGCGCTGTGTTCTCCAACCTGCAGAGGAAAGGCCTGGAGAAAAGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 TTTGAGATTCAGAAGTACGTGACCAAGCCGGACCGAAAGCAGCTGGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102417 TTTGAGATTCAGAAGTACGTGACCAAGCCGGACCGAAAGCAGCTGGCGGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 GATGCTGGGCCTCACGGACGCACAG         GTGAAGGTGTGGTTCC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 102467 GATGCTGGGCCTCACGGACGCACAGGTA...CAGGTGAAGGTGTGGTTCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 AGAACCGGCGGATGAAGTGGCGGCACTCCAAGGAGGCCCAGGCCCAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104354 AGAACCGGCGGATGAAGTGGCGGCACTCCAAGGAGGCCCAGGCCCAAAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 GACAAGGACAAGGAGGCTGGCGAGAAGCCATCAGGTGGAGCCCCGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104404 GACAAGGACAAGGAGGCTGGCGAGAAGCCATCAGGTGGAGCCCCGGCTGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 GGATGGCGAGCAGGACGAGAGGAGCCCCAGCCGTTCTGAAGGCGAGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104454 GGATGGCGAGCAGGACGAGAGGAGCCCCAGCCGTTCTGAAGGCGAGGCTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 AGAGCGAGAGCAGCGACTCCGAGTCCCTGGACATGGCCCCCAGCGACACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104504 AGAGCGAGAGCAGCGACTCCGAGTCCCTGGACATGGCCCCCAGCGACACG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 GAGCGGACTGAGGGGAGTGAGCGTTCTCTGCACCAAACAACAGTTATTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104554 GAGCGGACTGAGGGGAGTGAGCGTTCTCTGCACCAAACAACAGTTATTAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 GGCCCCGGTCACTGGCGCCCTCATTACCGCCAGCAGTGCTGGGAGTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104604 GGCCCCGGTCACTGGCGCCCTCATTACCGCCAGCAGTGCTGGGAGTGGTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 GGAGCAGCGGCGGCGGCGGCAATAGTTTCAGCTTCAGCAGCGCCAGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104654 GGAGCAGCGGCGGCGGCGGCAATAGTTTCAGCTTCAGCAGCGCCAGCAGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 CTTAGTAGCAGCAGCACCAGTGCGGGTTGCGCCAGCAGCCTTGGCGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104704 CTTAGTAGCAGCAGCACCAGTGCGGGTTGCGCCAGCAGCCTTGGCGGCGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 CGGCGCCTCGGAGCTTCTCCCTGCAACACAGCCCACAGCCAGCAGCGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104754 CGGCGCCTCGGAGCTTCTCCCTGCAACACAGCCCACAGCCAGCAGCGCTC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 CCAAAAGCCCCGAGCCAGCCCAAGGCGCGCTTGGCTGCTTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104804 CCAAAAGCCCCGAGCCAGCCCAAGGCGCGCTTGGCTGCTTA