seq1 = pF1KB7744.tfa, 1461 bp
seq2 = pF1KB7744/gi568815579f_35614627.tfa (gi568815579f:35614627_35816749), 202123 bp

>pF1KB7744 1461
>gi568815579f:35614627_35816749 (Chr19)

1-881  (100001-100881)   100% ->
882-955  (101131-101204)   100% ->
956-1024  (101313-101381)   100% ->
1025-1189  (101507-101671)   100% ->
1190-1461  (101852-102123)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCCTGCCCCCCATAAGACTGCCCAGCCCCTATGGCTCTGATCGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCCTGCCCCCCATAAGACTGCCCAGCCCCTATGGCTCTGATCGGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTACAGCTAGCAGCCAGGCTCCGGCCAGCACTCTGTGATACTCTGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTACAGCTAGCAGCCAGGCTCCGGCCAGCACTCTGTGATACTCTGATCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCGTAGGGAGCCAGGAGTTCCCCGCCCACAGCCTGGTGCTAGCAGGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCGTAGGGAGCCAGGAGTTCCCCGCCCACAGCCTGGTGCTAGCAGGTGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGCCAGCAGCTGGGCCGCAGGGGCCAGTGGGCTCTGGGAGAAGGCATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGCCAGCAGCTGGGCCGCAGGGGCCAGTGGGCTCTGGGAGAAGGCATCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCCTTCTACCTTTGCCCAGCTCCTGAACTTTGTGTATGGGGAGAGTGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCCTTCTACCTTTGCCCAGCTCCTGAACTTTGTGTATGGGGAGAGTGTAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGCTGCAGCCTGGAGAGCTAAGGCCCCTTCAGGAGGCGGCCAGGGCCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGCTGCAGCCTGGAGAGCTAAGGCCCCTTCAGGAGGCGGCCAGGGCCTTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGAGTGCAGTCCCTGGAAGAGGCATGCTGGAGGGCTCGAGGGGACAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGAGTGCAGTCCCTGGAAGAGGCATGCTGGAGGGCTCGAGGGGACAGGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TAAAAAGCCAGATCCAGGCCTGAAGAAACATCAGGAGGAGCCAGAGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TAAAAAGCCAGATCCAGGCCTGAAGAAACATCAGGAGGAGCCAGAGAAAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCTCAAGGAATCCTGAGAGAGAACTGGGGGACCCTGGAGAGAAGCAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCTCAAGGAATCCTGAGAGAGAACTGGGGGACCCTGGAGAGAAGCAGAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCAGAACAGGTTTCTAGAACTGGTGGGAGAGAACAGGAGATGTTGCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCAGAACAGGTTTCTAGAACTGGTGGGAGAGAACAGGAGATGTTGCACAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCACTCGCCACCAAGAGGCAGACCCGAGATGGCAGGAGCAACGCAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCACTCGCCACCAAGAGGCAGACCCGAGATGGCAGGAGCAACGCAGGAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CTCAGCAGGAACAGACCAGGTCAAAGGAGAAACGCCTCCAAGCCCCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CTCAGCAGGAACAGACCAGGTCAAAGGAGAAACGCCTCCAAGCCCCTGTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GGCCAAAGGGGAGCAGATGGGAAGCATGGAGTGCTCACGTGGTTGAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GGCCAAAGGGGAGCAGATGGGAAGCATGGAGTGCTCACGTGGTTGAGGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AAATCCAGGGGGCTCTGAGGAAAGTCTGCGCAAGCTCCCTGGCCCCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AAATCCAGGGGGCTCTGAGGAAAGTCTGCGCAAGCTCCCTGGCCCCCTTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCCCAGCAGGCTCCCTGCAAACCAGCGTCACCCCTAGGCCCTCGTGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CCCCAGCAGGCTCCCTGCAAACCAGCGTCACCCCTAGGCCCTCGTGGGCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GAGGCCCCTTGGTTGGTGGGGGGCCAGCCTGCCCTGTGGAGCATCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GAGGCCCCTTGGTTGGTGGGGGGCCAGCCTGCCCTGTGGAGCATCCTGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GATGCCGCCCAGATATGGCATTCCCTTCTACCATAGCACCCCCACCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GATGCCGCCCAGATATGGCATTCCCTTCTACCATAGCACCCCCACCACTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GAGCCTGGCAGGAGGTCTGGCGGGAACAGAG         GATCCCACTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100851 GAGCCTGGCAGGAGGTCTGGCGGGAACAGAGGTG...CAGGATCCCACTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 TCCCTAAATGCCCCCAAAGGGCTCTGGAGCCAGAACCAGTTGGCCTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101141 TCCCTAAATGCCCCCAAAGGGCTCTGGAGCCAGAACCAGTTGGCCTCCTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 CAGCCCTACCCCAG         GTTCCCTCCCCCAGGGCCCCGCACAGC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 101191 CAGCCCTACCCCAGGTA...CAGGTTCCCTCCCCCAGGGCCCCGCACAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 TCAGCCCTGGGGAGATGGAAGAGTCTGATCAGGGGCACACAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 101340 TCAGCCCTGGGGAGATGGAAGAGTCTGATCAGGGGCACACAGGTG...CA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1025  GCGCACTTGCAACCTGTGCGGGTCATGAGGACAAGGCAGGCTGCCCACC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101506 GGCGCACTTGCAACCTGTGCGGGTCATGAGGACAAGGCAGGCTGCCCACC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 TCGCCCGCACCCTCCCCCGGCCCCTCCTGCTCGGTCTCGGCCCTATGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101556 TCGCCCGCACCCTCCCCCGGCCCCTCCTGCTCGGTCTCGGCCCTATGCGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 GCTCTGTCTGTGGAAAGAGGTTTTCACTCAAGCATCAGATGGAGACGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101606 GCTCTGTCTGTGGAAAGAGGTTTTCACTCAAGCATCAGATGGAGACGCAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 TACCGAGTCCACACAG         GAGAGAAGCCCTTCTCCTGTAGCCT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 101656 TACCGAGTCCACACAGGTA...TAGGAGAGAAGCCCTTCTCCTGTAGCCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 TTGTCCTCAGCGCTCCCGGGACTTCTCGGCCATGACCAAGCACCTGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101877 TTGTCCTCAGCGCTCCCGGGACTTCTCGGCCATGACCAAGCACCTGCGGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 CACACGGGGCCGCTCCGTACCGCTGCTCCCTGTGCGGGGCCGGCTGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101927 CACACGGGGCCGCTCCGTACCGCTGCTCCCTGTGCGGGGCCGGCTGTCCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 AGCCTAGCCTCCATGCAGGCGCACATGCGCGGTCACTCGCCCAGCCAACT
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101977 AGCCTGGCCTCCATGCAGGCGCACATGCGCGGTCACTCGCCCAGCCAACT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 CCCGCCCGGATGGACCATCCGCTCCACCTTCCTCTACTCCTCCTCGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102027 CCCGCCCGGATGGACCATCCGCTCCACCTTCCTCTACTCCTCCTCGAGGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1415 CGTCTCGGCCCTCGACCTCTCCCTGTTGTCCTTCTTCCTCCACCACC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102077 CGTCTCGGCCCTCGACCTCTCCCTGTTGTCCTTCTTCCTCCACCACC