seq1 = pF1KB7743.tfa, 1311 bp
seq2 = pF1KB7743/gi568815578r_33576735.tfa (gi568815578r:33576735_33786264), 209530 bp

>pF1KB7743 1311
>gi568815578r:33576735_33786264 (Chr20)

(complement)

1-261  (100001-100261)   100% ->
262-352  (105849-105939)   100% ->
353-572  (106291-106510)   100% ->
573-725  (107912-108064)   100% ->
726-840  (108725-108839)   100% ->
841-1066  (108935-109160)   100% ->
1067-1311  (109286-109530)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCTTGGCCGGGGCCCCTGCGGGCGGCCCATGCGCGCCGGCGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCTTGGCCGGGGCCCCTGCGGGCGGCCCATGCGCGCCGGCGCTGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCCTGCTCGGGGCCGGCGCGCTGCGGCTGCTCGACTCCTCGCAGATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCCTGCTCGGGGCCGGCGCGCTGCGGCTGCTCGACTCCTCGCAGATCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCATCATCTCCGCCGCGCAGGACGCCAGCGCCCCGCCGGCTCCCACCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCATCATCTCCGCCGCGCAGGACGCCAGCGCCCCGCCGGCTCCCACCGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCGCGGCGCCCGCCGCCGGCCCCTGCGACCCTGACCTGCTGCTCTTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCCGCGGCGCCCGCCGCCGGCCCCTGCGACCCTGACCTGCTGCTCTTCGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CACACCGCAGGCGCCCCGGCCCACACCCAGTGCGCCGCGGCCCGCGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CACACCGCAGGCGCCCCGGCCCACACCCAGTGCGCCGCGGCCCGCGCTCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCCGCCCGCCG         GTGAAGCGGAGGCTGGACCTGGAAACTGAC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCCGCCCGCCGGTA...CAGGTGAAGCGGAGGCTGGACCTGGAAACTGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CATCAGTACCTGGCCGAGAGCAGTGGGCCAGCTCGGGGCAGAGGCCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105879 CATCAGTACCTGGCCGAGAGCAGTGGGCCAGCTCGGGGCAGAGGCCGCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TCCAGGAAAAG         GTGTGAAATCCCCGGGGGAGAAGTCACGCT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 105929 TCCAGGAAAAGGTA...CAGGTGTGAAATCCCCGGGGGAGAAGTCACGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATGAGACCTCACTGAATCTGACCACCAAGCGCTTCCTGGAGCTGCTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106321 ATGAGACCTCACTGAATCTGACCACCAAGCGCTTCCTGGAGCTGCTGAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CACTCGGCTGACGGTGTCGTCGACCTGAACTGGGCTGCCGAGGTGCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106371 CACTCGGCTGACGGTGTCGTCGACCTGAACTGGGCTGCCGAGGTGCTGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGTGCAGAAGCGGCGCATCTATGACATCACCAACGTCCTTGAGGGCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106421 GGTGCAGAAGCGGCGCATCTATGACATCACCAACGTCCTTGAGGGCATCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AGCTCATTGCCAAGAAGTCCAAGAACCACATCCAGTGGCT         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 106471 AGCTCATTGCCAAGAAGTCCAAGAACCACATCCAGTGGCTGTA...CAGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GGCAGCCACACCACAGTGGGCGTCGGCGGACGGCTTGAGGGGTTGACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107913 GGCAGCCACACCACAGTGGGCGTCGGCGGACGGCTTGAGGGGTTGACCCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GGACCTCCGACAGCTGCAGGAGAGCGAGCAGCAGCTGGACCACCTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107963 GGACCTCCGACAGCTGCAGGAGAGCGAGCAGCAGCTGGACCACCTGATGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 ATATCTGTACTACGCAGCTGCGCCTGCTCTCCGAGGACACTGACAGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108013 ATATCTGTACTACGCAGCTGCGCCTGCTCTCCGAGGACACTGACAGCCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CG         CCTGGCCTACGTGACGTGTCAGGACCTTCGTAGCATTGC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108063 CGATA...AACCCTGGCCTACGTGACGTGTCAGGACCTTCGTAGCATTGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 AGACCCTGCAGAGCAGATGGTTATGGTGATCAAAGCCCCTCCTGAGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108764 AGACCCTGCAGAGCAGATGGTTATGGTGATCAAAGCCCCTCCTGAGACCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 AGCTCCAAGCCGTGGACTCTTCGGAG         AACTTTCAGATCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 108814 AGCTCCAAGCCGTGGACTCTTCGGAGGTG...CAGAACTTTCAGATCTCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CTTAAGAGCAAACAAGGCCCGATCGATGTTTTCCTGTGCCCTGAGGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108950 CTTAAGAGCAAACAAGGCCCGATCGATGTTTTCCTGTGCCCTGAGGAGAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CGTAGGTGGGATCAGCCCTGGGAAGACCCCATCCCAGGAGGTCACTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109000 CGTAGGTGGGATCAGCCCTGGGAAGACCCCATCCCAGGAGGTCACTTCTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 AGGAGGAGAACAGGGCCACTGACTCTGCCACCATAGTGTCACCACCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109050 AGGAGGAGAACAGGGCCACTGACTCTGCCACCATAGTGTCACCACCACCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 TCATCTCCCCCCTCATCCCTCACCACAGATCCCAGCCAGTCTCTACTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109100 TCATCTCCCCCCTCATCCCTCACCACAGATCCCAGCCAGTCTCTACTCAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 CCTGGAGCAAG         AACCGCTGTTGTCCCGGATGGGCAGCCTGC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 109150 CCTGGAGCAAGGTG...CAGAACCGCTGTTGTCCCGGATGGGCAGCCTGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 GGGCTCCCGTGGACGAGGACCGCCTGTCCCCGCTGGTGGCGGCCGACTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109316 GGGCTCCCGTGGACGAGGACCGCCTGTCCCCGCTGGTGGCGGCCGACTCG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 CTCCTGGAGCATGTGCGGGAGGACTTCTCCGGCCTCCTCCCTGAGGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109366 CTCCTGGAGCATGTGCGGGAGGACTTCTCCGGCCTCCTCCCTGAGGAGTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 CATCAGCCTTTCCCCACCCCACGAGGCCCTCGACTACCACTTCGGCCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109416 CATCAGCCTTTCCCCACCCCACGAGGCCCTCGACTACCACTTCGGCCTCG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 AGGAGGGCGAGGGCATCAGAGACCTCTTCGACTGTGACTTTGGGGACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109466 AGGAGGGCGAGGGCATCAGAGACCTCTTCGACTGTGACTTTGGGGACCTC

   1350     .    :    .
   1297 ACCCCCCTGGATTTC
        |||||||||||||||
 109516 ACCCCCCTGGATTTC