seq1 = pF1KB7723.tfa, 1290 bp
seq2 = pF1KB7723/gi568815592r_32086385.tfa (gi568815592r:32086385_32289834), 203450 bp

>pF1KB7723 1290
>gi568815592r:32086385_32289834 (Chr6)

(complement)

1-221  (99920-100140)   100% ->
222-295  (101039-101112)   100% ->
296-543  (101331-101578)   100% ->
544-734  (101679-101869)   100% ->
735-870  (102053-102188)   100% ->
871-1024  (102440-102593)   100% ->
1025-1113  (102934-103022)   100% ->
1114-1200  (103145-103231)   100% ->
1201-1290  (103361-103450)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACGAACGGCTACTGGGGCCGCCCCCTCCAGGCGGGGGCCGGGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99920 ATGGACGAACGGCTACTGGGGCCGCCCCCTCCAGGCGGGGGCCGGGGGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGGGATTGGTGAGTGGGGAGCCTGGGGGCCCTGGCGAGCCTCCCGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99970 CCTGGGATTGGTGAGTGGGGAGCCTGGGGGCCCTGGCGAGCCTCCCGGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGGAGACCCCGGTGGGGGTAGCGGGGGGGTCCCGGGAGGCCGAGGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100020 GCGGAGACCCCGGTGGGGGTAGCGGGGGGGTCCCGGGAGGCCGAGGGAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAAGACATCGGGGACATTCTGCAGCAGATAATGACCATCACCGACCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100070 CAAGACATCGGGGACATTCTGCAGCAGATAATGACCATCACCGACCAGAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTGGACGAGGCCCAGGCCAA         GAAACACGCCCTAAACTGCC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100120 CCTGGACGAGGCCCAGGCCAAGTG...AAGGAAACACGCCCTAAACTGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACCGAATGAAGCCTGCTCTCTTTAGCGTCCTGTGTGAAATCAAGGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101059 ACCGAATGAAGCCTGCTCTCTTTAGCGTCCTGTGTGAAATCAAGGAGAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ACTG         GCCTCAGCATTCGGAGCTCCCAGGAGGAGGAGCCGGT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101109 ACTGGTA...TAGGCCTCAGCATTCGGAGCTCCCAGGAGGAGGAGCCGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGACCCACAGCTGATGCGCTTGGACAACATGCTTCTGGCAGAGGGTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101368 GGACCCACAGCTGATGCGCTTGGACAACATGCTTCTGGCAGAGGGTGTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CTGGGCCCGAGAAAGGGGGCGGCTCAGCAGCAGCAGCTGCAGCCGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101418 CTGGGCCCGAGAAAGGGGGCGGCTCAGCAGCAGCAGCTGCAGCCGCTGCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GCCTCTGGTGGTGGTGTGTCCCCTGACAACTCCATCGAACACTCGGACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101468 GCCTCTGGTGGTGGTGTGTCCCCTGACAACTCCATCGAACACTCGGACTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TCGCAGCAAACTTGCCCAGATCCGTCACATATACCACTCGGAGCTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101518 TCGCAGCAAACTTGCCCAGATCCGTCACATATACCACTCGGAGCTGGAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AGTATGAGCAG         GCATGTAATGAGTTCACGACCCATGTCATG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 101568 AGTATGAGCAGGTA...CAGGCATGTAATGAGTTCACGACCCATGTCATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AACCTGCTGAGGGAGCAGAGCCGCACCAGGCCCGTGGCCCCCAAAGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101709 AACCTGCTGAGGGAGCAGAGCCGCACCAGGCCCGTGGCCCCCAAAGAGAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GGAACGCATGGTGAGCATCATCCATCGAAAGTTCAGCGCCATCCAGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101759 GGAACGCATGGTGAGCATCATCCATCGAAAGTTCAGCGCCATCCAGATGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AGCTGAAGCAGAGCACCTGCGAGGCTGTGATGATCCTGCGCTCCCGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101809 AGCTGAAGCAGAGCACCTGCGAGGCTGTGATGATCCTGCGCTCCCGTTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CTGGATGCCAG         ACGAAAGCGCCGTAACTTCAGCAAACAGGC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 101859 CTGGATGCCAGGTG...TAGACGAAAGCGCCGTAACTTCAGCAAACAGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CACTGAGGTCCTAAATGAGTATTTCTACTCCCACCTGAGTAACCCATATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102083 CACTGAGGTCCTAAATGAGTATTTCTACTCCCACCTGAGTAACCCATATC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 CTAGTGAGGAGGCCAAGGAGGAGCTTGCCAAGAAGTGTGGCATCACCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102133 CTAGTGAGGAGGCCAAGGAGGAGCTTGCCAAGAAGTGTGGCATCACCGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 TCTCAG         GTCTCCAACTGGTTTGGCAACAAGAGGATTCGCTA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102183 TCTCAGGTA...CAGGTCTCCAACTGGTTTGGCAACAAGAGGATTCGCTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 TAAGAAAAACATCGGAAAGTTCCAAGAGGAGGCAAACATCTATGCTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102475 TAAGAAAAACATCGGAAAGTTCCAAGAGGAGGCAAACATCTATGCTGTCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 AGACCGCCGTGTCAGTCACCCAGGGGGGCCACAGCCGCACCAGCTCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102525 AGACCGCCGTGTCAGTCACCCAGGGGGGCCACAGCCGCACCAGCTCCCCG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 ACACCCCCTTCCTCTGCAG         GCTCTGGCGGCTCTTTCAATCT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 102575 ACACCCCCTTCCTCTGCAGGTG...AAGGCTCTGGCGGCTCTTTCAATCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CTCAGGATCTGGAGACATGTTTCTGGGGATGCCTGGGCTCAACGGAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102956 CTCAGGATCTGGAGACATGTTTCTGGGGATGCCTGGGCTCAACGGAGATT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 CCTATTCTGCTTCCCAG         GTGGAATCACTCCGACACTCGATG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 103006 CCTATTCTGCTTCCCAGGTC...CAGGTGGAATCACTCCGACACTCGATG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GGGCCAGGGGGCTATGGGGATAACCTCGGGGGAGGCCAGATGTACAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103169 GGGCCAGGGGGCTATGGGGATAACCTCGGGGGAGGCCAGATGTACAGCCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 ACGGGAAATGAGG         GCAAATGGCAGCTGGCAAGAGGCTGTGA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 103219 ACGGGAAATGAGGGTG...CAGGCAAATGGCAGCTGGCAAGAGGCTGTGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 CCCCCTCTTCAGTGACATCCCCAACGGAGGGACCAGGGAGTGTTCACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103389 CCCCCTCTTCAGTGACATCCCCAACGGAGGGACCAGGGAGTGTTCACTCT

   1350     .    :
   1279 GATACCTCCAAC
        ||||||||||||
 103439 GATACCTCCAAC