seq1 = pF1KB7719.tfa, 1281 bp
seq2 = pF1KB7719/gi568815586r_47744749.tfa (gi568815586r:47744749_47979113), 234365 bp

>pF1KB7719 1281
>gi568815586r:47744749_47979113 (Chr12)

(complement)

1-146  (100001-100146)   100% ->
147-277  (113937-114067)   100% ->
278-462  (121426-121610)   100% ->
463-583  (121865-121985)   100% ->
584-755  (123313-123484)   100% ->
756-907  (132306-132457)   100% ->
908-1024  (132663-132779)   100% ->
1025-1281  (134109-134365)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGCAATGGCGGCCAGCACTTCCCTGCCTGACCCTGGAGACTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGCAATGGCGGCCAGCACTTCCCTGCCTGACCCTGGAGACTTTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGGAACGTGCCCCGGATCTGTGGGGTGTGTGGAGACCGAGCCACTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGGAACGTGCCCCGGATCTGTGGGGTGTGTGGAGACCGAGCCACTGGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTCACTTCAATGCTATGACCTGTGAAGGCTGCAAAGGCTTCTTCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100101 TTCACTTCAATGCTATGACCTGTGAAGGCTGCAAAGGCTTCTTCAGGTG.

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    147      GCGAAGCATGAAGCGGAAGGCACTATTCACCTGCCCCTTCAACGG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ..CAGGCGAAGCATGAAGCGGAAGGCACTATTCACCTGCCCCTTCAACGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGACTGCCGCATCACCAAGGACAACCGACGCCACTGCCAGGCCTGCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113982 GGACTGCCGCATCACCAAGGACAACCGACGCCACTGCCAGGCCTGCCGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCAAACGCTGTGTGGACATCGGCATGATGAAGGAGT         TCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 114032 TCAAACGCTGTGTGGACATCGGCATGATGAAGGAGTGTG...CAGTCATT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTGACAGATGAGGAAGTGCAGAGGAAGCGGGAGATGATCCTGAAGCGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121431 CTGACAGATGAGGAAGTGCAGAGGAAGCGGGAGATGATCCTGAAGCGGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGAGGAGGAGGCCTTGAAGGACAGTCTGCGGCCCAAGCTGTCTGAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121481 GGAGGAGGAGGCCTTGAAGGACAGTCTGCGGCCCAAGCTGTCTGAGGAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGCAGCGCATCATTGCCATACTGCTGGACGCCCACCATAAGACCTACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121531 AGCAGCGCATCATTGCCATACTGCTGGACGCCCACCATAAGACCTACGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CCCACCTACTCCGACTTCTGCCAGTTCCGG         CCTCCAGTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 121581 CCCACCTACTCCGACTTCTGCCAGTTCCGGGTA...CAGCCTCCAGTTCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGTGAATGATGGTGGAGGGAGCCATCCTTCCAGGCCCAACTCCAGACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121876 TGTGAATGATGGTGGAGGGAGCCATCCTTCCAGGCCCAACTCCAGACACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTCCCAGCTTCTCTGGGGACTCCTCCTCCTCCTGCTCAGATCACTGTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121926 CTCCCAGCTTCTCTGGGGACTCCTCCTCCTCCTGCTCAGATCACTGTATC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ACCTCTTCAG         ACATGATGGACTCGTCCAGCTTCTCCAATCT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 121976 ACCTCTTCAGGTA...CAGACATGATGGACTCGTCCAGCTTCTCCAATCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GGATCTGAGTGAAGAAGATTCAGATGACCCTTCTGTGACCCTAGAGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123344 GGATCTGAGTGAAGAAGATTCAGATGACCCTTCTGTGACCCTAGAGCTGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CCCAGCTCTCCATGCTGCCCCACCTGGCTGACCTGGTCAGTTACAGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123394 CCCAGCTCTCCATGCTGCCCCACCTGGCTGACCTGGTCAGTTACAGCATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CAAAAGGTCATTGGCTTTGCTAAGATGATACCAGGATTCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 123444 CAAAAGGTCATTGGCTTTGCTAAGATGATACCAGGATTCAGGTA...CAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 AGACCTCACCTCTGAGGACCAGATCGTACTGCTGAAGTCAAGTGCCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132306 AGACCTCACCTCTGAGGACCAGATCGTACTGCTGAAGTCAAGTGCCATTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AGGTCATCATGTTGCGCTCCAATGAGTCCTTCACCATGGACGACATGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132356 AGGTCATCATGTTGCGCTCCAATGAGTCCTTCACCATGGACGACATGTCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 TGGACCTGTGGCAACCAAGACTACAAGTACCGCGTCAGTGACGTGACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132406 TGGACCTGTGGCAACCAAGACTACAAGTACCGCGTCAGTGACGTGACCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 AG         CCGGACACAGCCTGGAGCTGATTGAGCCCCTCATCAAGT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132456 AGGTA...CAGCCGGACACAGCCTGGAGCTGATTGAGCCCCTCATCAAGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TCCAGGTGGGACTGAAGAAGCTGAACTTGCATGAGGAGGAGCATGTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132702 TCCAGGTGGGACTGAAGAAGCTGAACTTGCATGAGGAGGAGCATGTCCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CTCATGGCCATCTGCATCGTCTCCCCAG         ATCGTCCTGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 132752 CTCATGGCCATCTGCATCGTCTCCCCAGGTA...CAGATCGTCCTGGGGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GCAGGACGCCGCGCTGATTGAGGCCATCCAGGACCGCCTGTCCAACACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134122 GCAGGACGCCGCGCTGATTGAGGCCATCCAGGACCGCCTGTCCAACACAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TGCAGACGTACATCCGCTGCCGCCACCCGCCCCCGGGCAGCCACCTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134172 TGCAGACGTACATCCGCTGCCGCCACCCGCCCCCGGGCAGCCACCTGCTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 TATGCCAAGATGATCCAGAAGCTAGCCGACCTGCGCAGCCTCAATGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134222 TATGCCAAGATGATCCAGAAGCTAGCCGACCTGCGCAGCCTCAATGAGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GCACTCCAAGCAGTACCGCTGCCTCTCCTTCCAGCCTGAGTGCAGCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134272 GCACTCCAAGCAGTACCGCTGCCTCTCCTTCCAGCCTGAGTGCAGCATGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 AGCTAACGCCCCTTGTGCTCGAAGTGTTTGGCAATGAGATCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134322 AGCTAACGCCCCTTGTGCTCGAAGTGTTTGGCAATGAGATCTCC