seq1 = pF1KB7711.tfa, 1263 bp
seq2 = pF1KB7711/gi568815581r_76037356.tfa (gi568815581r:76037356_76240318), 202963 bp

>pF1KB7711 1263
>gi568815581r:76037356_76240318 (Chr17)

(complement)

1-498  (99924-100421)   100% ->
499-1263  (102199-102963)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGAGAGCTGGCTGCGCCTCTCGGGAGCCGGGCCGGCGGAGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99924 ATGGCGGAGAGCTGGCTGCGCCTCTCGGGAGCCGGGCCGGCGGAGGAGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGGCCGGAGGGCGGCCTGGAGGAGCCCGACGCCCTGGATGACAGCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99974 CGGGCCGGAGGGCGGCCTGGAGGAGCCCGACGCCCTGGATGACAGCCTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCAGCCTGCAGTGGCTGCAGGAATTCTCCATTCTCAACGCCAAGGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100024 CCAGCCTGCAGTGGCTGCAGGAATTCTCCATTCTCAACGCCAAGGCCCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCCTGCCCCCGGGGGGCACCGACCCCCACGGCTACCACCAGGTGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100074 GCCCTGCCCCCGGGGGGCACCGACCCCCACGGCTACCACCAGGTGCCAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTCAGCGGCGCCCGGGTCCCCCCTGGCGGCCGACCCCGCCTGCCTGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100124 TTCAGCGGCGCCCGGGTCCCCCCTGGCGGCCGACCCCGCCTGCCTGGGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGCCACACACGCCGGGCAAGCCCACGTCGTCGTGCACGTCGCGGAGCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100174 AGCCACACACGCCGGGCAAGCCCACGTCGTCGTGCACGTCGCGGAGCGCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCCCCGGGGCTGCAGGCCCCACCCCCCGACGACGTGGACTACGCCACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100224 CCCCCGGGGCTGCAGGCCCCACCCCCCGACGACGTGGACTACGCCACCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TCCGCACGTGAAGCCTCCCTACTCGTATGCCACGCTCATCTGCATGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100274 TCCGCACGTGAAGCCTCCCTACTCGTATGCCACGCTCATCTGCATGGCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGCAGGCCAGCAAGGCCACCAAGATCACCCTGTCGGCCATCTACAAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100324 TGCAGGCCAGCAAGGCCACCAAGATCACCCTGTCGGCCATCTACAAGTGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATCACGGACAACTTCTGCTACTTCCGCCACGCAGATCCCACCTGGCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100374 ATCACGGACAACTTCTGCTACTTCCGCCACGCAGATCCCACCTGGCAGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    499        AATTCAATCCGCCACAACCTGTCTCTGAACAAGTGCTTCATCA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100424 A...CAGAATTCAATCCGCCACAACCTGTCTCTGAACAAGTGCTTCATCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 AAGTGCCTCGGGAGAAGGACGAACCAGGCAAGGGGGGCTTCTGGCGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102242 AAGTGCCTCGGGAGAAGGACGAACCAGGCAAGGGGGGCTTCTGGCGCATT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GACCCCCAGTACGCGGAGCGGCTACTGAGCGGCGCTTTCAAGAAGCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102292 GACCCCCAGTACGCGGAGCGGCTACTGAGCGGCGCTTTCAAGAAGCGGCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 ACTGCCCCCTGTCCACATCCACCCAGCCTTTGCCCGCCAGGCCGCGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102342 ACTGCCCCCTGTCCACATCCACCCAGCCTTTGCCCGCCAGGCCGCGCAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 AGCCCAGCGCTGTCCCCCGGGCCGGGCCGCTGACGGTGAATACCGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102392 AGCCCAGCGCTGTCCCCCGGGCCGGGCCGCTGACGGTGAATACCGAGGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CAGCAGCTGCTGCGGGAGTTCGAGGAGGCCACCGGGGAGGCGGGCTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102442 CAGCAGCTGCTGCGGGAGTTCGAGGAGGCCACCGGGGAGGCGGGCTGGGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TGCAGGCGAGGGCAGGCTGGGGCATAAGCGCAAACAGCCGCTGCCCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102492 TGCAGGCGAGGGCAGGCTGGGGCATAAGCGCAAACAGCCGCTGCCCAAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 GGGTGGCCAAGGTCCCGCGGCCCCCCAGCACCCTGCTGCCCACCCCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102542 GGGTGGCCAAGGTCCCGCGGCCCCCCAGCACCCTGCTGCCCACCCCGGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 GAGCAGGGTGAGCTGGAACCCCTCAAAGGCAACTTTGACTGGGAGGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102592 GAGCAGGGTGAGCTGGAACCCCTCAAAGGCAACTTTGACTGGGAGGCCAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 CTTCGACGCCGGCACTCTGGGCGGGGAGCTGGGTGCACTGGAGGCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102642 CTTCGACGCCGGCACTCTGGGCGGGGAGCTGGGTGCACTGGAGGCCCTGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 AGCTGAGCCCGCCTCTGAGCCCCGCCTCACACGTGGACGTGGACCTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102692 AGCTGAGCCCGCCTCTGAGCCCCGCCTCACACGTGGACGTGGACCTCACC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 ATCCACGGCCGCCACATCGACTGCCCTGCCACCTGGGGGCCTTCGGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102742 ATCCACGGCCGCCACATCGACTGCCCTGCCACCTGGGGGCCTTCGGTGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 GCAGGCTGCCGACAGCCTGGACTTCGATGAGACCTTCCTGGCCACATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102792 GCAGGCTGCCGACAGCCTGGACTTCGATGAGACCTTCCTGGCCACATCCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 TCCTGCAGCACCCCTGGGACGAGAGCGGCAGTGGCTGCCTGCCCCCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102842 TCCTGCAGCACCCCTGGGACGAGAGCGGCAGTGGCTGCCTGCCCCCGGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 CCCCTCTTTGAGGCTGGGGATGCCACCCTGGCCTCCGACCTGCAGGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102892 CCCCTCTTTGAGGCTGGGGATGCCACCCTGGCCTCCGACCTGCAGGACTG

   1250     .    :    .    :
   1242 GGCCAGCGTGGGGGCCTTCTTG
        ||||||||||||||||||||||
 102942 GGCCAGCGTGGGGGCCTTCTTG