seq1 = pF1KB7710.tfa, 1395 bp
seq2 = pF1KB7710/gi568815592f_30063685.tfa (gi568815592f:30063685_30272346), 208662 bp

>pF1KB7710 1395
>gi568815592f:30063685_30272346 (Chr6)

1-381  (100001-100381)   100% ->
382-477  (103492-103587)   100% ->
478-708  (104616-104846)   100% ->
709-731  (105557-105579)   100% ->
732-847  (106817-106932)   100% ->
848-880  (107292-107324)   100% ->
881-1395  (108148-108662)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCGCAACCCCGTCCCTGAAGGTGGTCCATGAGCTGCCTGCCTGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCGCAACCCCGTCCCTGAAGGTGGTCCATGAGCTGCCTGCCTGTAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTCTGTGCGGGGCCGCTGGAGGATGCGGTGACCATTCCCTGTGGACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTCTGTGCGGGGCCGCTGGAGGATGCGGTGACCATTCCCTGTGGACACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTTCTGCCGGCTCTGCCTCCCCGCGCTCTCCCAGATGGGGGCCCAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCTTCTGCCGGCTCTGCCTCCCCGCGCTCTCCCAGATGGGGGCCCAATCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCGGGCAAGATCCTGCTCTGCCCGCTCTGCCAAGAGGAGGAGCAGGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCGGGCAAGATCCTGCTCTGCCCGCTCTGCCAAGAGGAGGAGCAGGCAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GACTCCCATGGCCCCTGTGCCCCTGGGCCCGCTGGGAGAAACTTACTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GACTCCCATGGCCCCTGTGCCCCTGGGCCCGCTGGGAGAAACTTACTGCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGGAGCACGGCGAGAAGATCTACTTCTTCTGCGAGAACGATGCCGAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGGAGCACGGCGAGAAGATCTACTTCTTCTGCGAGAACGATGCCGAGTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTCTGTGTGTTCTGCAGGGAGGGTCCCACGCACCAGGCGCACACCGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTCTGTGTGTTCTGCAGGGAGGGTCCCACGCACCAGGCGCACACCGTGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GTTCCTGGACGAGGCCATTCAGCCCTACCGG         GATCGTCTCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100351 GTTCCTGGACGAGGCCATTCAGCCCTACCGGGTA...CAGGATCGTCTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GGAGTCGACTGGAAGCTCTGAGCACGGAGAGAGATGAGATTGAGGATGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103502 GGAGTCGACTGGAAGCTCTGAGCACGGAGAGAGATGAGATTGAGGATGTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AAGTGTCAAGAAGACCAGAAGCTTCAAGTGCTGCTG         ACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 103552 AAGTGTCAAGAAGACCAGAAGCTTCAAGTGCTGCTGGTA...AAGACTCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GATCGAAAGCAAGAAGCATCAGGTGGAAACAGCTTTTGAGAGGCTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104621 GATCGAAAGCAAGAAGCATCAGGTGGAAACAGCTTTTGAGAGGCTGCAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AGGAGCTGGAGCAGCAGCGATGTCTCCTGCTGGCCAGGCTGAGGGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104671 AGGAGCTGGAGCAGCAGCGATGTCTCCTGCTGGCCAGGCTGAGGGAGCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GAGCAGCAGATTTGGAAGGAGAGGGATGAATATATCACAAAGGTCTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104721 GAGCAGCAGATTTGGAAGGAGAGGGATGAATATATCACAAAGGTCTCTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GGAAGTCACCCGGCTTGGAGCCCAGGTCAAGGAGCTGGAGGAGAAGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104771 GGAAGTCACCCGGCTTGGAGCCCAGGTCAAGGAGCTGGAGGAGAAGTGTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 AGCAGCCAGCAAGTGAGCTTCTACAA         GATGTCAGAGTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 104821 AGCAGCCAGCAAGTGAGCTTCTACAAGTG...CAGGATGTCAGAGTCAAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CAGAGCAG         GTGTGAGATGAAGACTTTTGTGAGTCCTGAGGC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 105572 CAGAGCAGGTA...CAGGTGTGAGATGAAGACTTTTGTGAGTCCTGAGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CATTTCTCCTGACCTTGTCAAGAAGATCCGTGATTTCCACAGGAAAATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106850 CATTTCTCCTGACCTTGTCAAGAAGATCCGTGATTTCCACAGGAAAATAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TCACCCTCCCAGAGATGATGAGGATGTTCTCAG         AAAACTTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 106900 TCACCCTCCCAGAGATGATGAGGATGTTCTCAGGTA...CAGAAAACTTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GCGCATCATCTGGAAATAGATTCAG         GGGTCATCACTCTGGA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 107300 GCGCATCATCTGGAAATAGATTCAGGTA...TAGGGGTCATCACTCTGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CCCTCAGACCGCCAGCCGGAGCCTGGTTCTCTCGGAAGACAGGAAGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108164 CCCTCAGACCGCCAGCCGGAGCCTGGTTCTCTCGGAAGACAGGAAGTCAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TGAGGTACACCCGGCAGAAGAAGAGCCTGCCAGACAGCCCCCTGCGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108214 TGAGGTACACCCGGCAGAAGAAGAGCCTGCCAGACAGCCCCCTGCGCTTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GACGGCCTCCCGGCGGTTCTGGGCTTCCCGGGCTTCTCCTCCGGGCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108264 GACGGCCTCCCGGCGGTTCTGGGCTTCCCGGGCTTCTCCTCCGGGCGCCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CCGCTGGCAGGTTGACCTGCAGCTGGGCGACGGCGGCGGCTGCACGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108314 CCGCTGGCAGGTTGACCTGCAGCTGGGCGACGGCGGCGGCTGCACGGTGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 GGGTGGCCGGGGAGGGGGTGAGGAGGAAGGGAGAGATGGGACTCAGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108364 GGGTGGCCGGGGAGGGGGTGAGGAGGAAGGGAGAGATGGGACTCAGCGCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 GAGGACGGCGTCTGGGCCGTGATCATCTCGCACCAGCAGTGCTGGGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108414 GAGGACGGCGTCTGGGCCGTGATCATCTCGCACCAGCAGTGCTGGGCCAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 CACCTCCCCGGGCACCGACCTGCCGCTGAGCGAGATCCCGCGCGGCGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108464 CACCTCCCCGGGCACCGACCTGCCGCTGAGCGAGATCCCGCGCGGCGTGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 GAGTCGCCCTGGACTACGAGGCGGGGCAGGTGACCCTCCACAACGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108514 GAGTCGCCCTGGACTACGAGGCGGGGCAGGTGACCCTCCACAACGCCCAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 ACCCAGGAGCCCATCTTCACCTTCACTGCCTCTTTCTCCGGCAAAGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108564 ACCCAGGAGCCCATCTTCACCTTCACTGCCTCTTTCTCCGGCAAAGTCTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1347 CCCTTTCTTTGCCGTCTGGAAAAAAGGTTCCTGCCTTACGCTGAAAGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108614 CCCTTTCTTTGCCGTCTGGAAAAAAGGTTCCTGCCTTACGCTGAAAGGC