seq1 = pF1KB7695.tfa, 1161 bp
seq2 = pF1KB7695/gi568815579r_38112066.tfa (gi568815579r:38112066_38322710), 210645 bp

>pF1KB7695 1161
>gi568815579r:38112066_38322710 (Chr19)

(complement)

1-29  (98569-98597)   100% ->
30-190  (100003-100163)   100% ->
191-298  (100247-100354)   100% ->
299-426  (103653-103780)   100% ->
427-516  (104049-104138)   100% ->
517-595  (104835-104913)   100% ->
596-727  (105120-105251)   100% ->
728-778  (106308-106358)   100% ->
779-898  (106452-106571)   100% ->
899-1011  (108955-109067)   100% ->
1012-1093  (110350-110431)   100% ->
1094-1161  (110578-110645)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCACTGTCATCCCTGGCCCCCTGAG         CCTAGGCGAGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
  98569 ATGGCCACTGTCATCCCTGGCCCCCTGAGGTG...TAGCCTAGGCGAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CTTCTACCGCGAGGCCATCGAGCACTGCCGCAGTTACAACGCGCGCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100015 CTTCTACCGCGAGGCCATCGAGCACTGCCGCAGTTACAACGCGCGCCTGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCGCCGAGCGCAGCCTGCGACTGCCCTTCCTCGACTCGCAGACCGGCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100065 GCGCCGAGCGCAGCCTGCGACTGCCCTTCCTCGACTCGCAGACCGGCGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCCCAGAACAACTGCTACATCTGGATGGAGAAGACCCACCGCGGGCCGG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100115 GCCCAGAACAACTGCTACATCTGGATGGAGAAGACCCACCGCGGGCCGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    191         GTTTGGCCCCGGGACAGATTTACACGTACCCCGCCCGCTGTT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100165 TA...CAGGTTTGGCCCCGGGACAGATTTACACGTACCCCGCCCGCTGTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGAGGAAGAAACGGAGACTCAACATCCTGGAGGACCCCAGACTCAGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100289 GGAGGAAGAAACGGAGACTCAACATCCTGGAGGACCCCAGACTCAGGCCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TGCGAGTACAAGATCG         ACTGTGAAGCACCCCTGAAGAAGGA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100339 TGCGAGTACAAGATCGGTG...CAGACTGTGAAGCACCCCTGAAGAAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGGTGGCCTCCCGGAAGGGCCGGTCCTCGAGGCTCTACTGTGTGCAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103678 GGGTGGCCTCCCGGAAGGGCCGGTCCTCGAGGCTCTACTGTGTGCAGAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CGGGGGAGAAGAAGATTGAGCTGAAGGAGGAGGAGACCATTATGGACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103728 CGGGGGAGAAGAAGATTGAGCTGAAGGAGGAGGAGACCATTATGGACTGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CAG         AAACAGCAGTTGCTGGAGTTTCCGCATGACCTCGAGGT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103778 CAGGTG...CAGAAACAGCAGTTGCTGGAGTTTCCGCATGACCTCGAGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GGAAGACTTGGAGGATGACATTCCCAGGAGGAAGAACAGGGCCAAAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104087 GGAAGACTTGGAGGATGACATTCCCAGGAGGAAGAACAGGGCCAAAGGAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AG         GCATATGGCATCGGGGGTCTCCGGAAACGCCAGGACACC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104137 AGGTA...CAGGCATATGGCATCGGGGGTCTCCGGAAACGCCAGGACACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GCTTCCCTGGAGGACCGAGACAAGCCGTATGTCTGTGATA         T
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 104874 GCTTCCCTGGAGGACCGAGACAAGCCGTATGTCTGTGATAGTG...CAGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 CTGTGGGAAACGGTATAAGAACCGGCCGGGGCTCAGCTACCACTACACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105121 CTGTGGGAAACGGTATAAGAACCGGCCGGGGCTCAGCTACCACTACACCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 ACACCCACCTGGCCGAGGAGGAGGGGGAGGAGAACGCCGAACGCCACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105171 ACACCCACCTGGCCGAGGAGGAGGGGGAGGAGAACGCCGAACGCCACGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CTGCCCTTCCACCGGAAAAACAACCATAAAC         AGTTTTACAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 105221 CTGCCCTTCCACCGGAAAAACAACCATAAACGTG...CAGAGTTTTACAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 AGAATTGGCCTGGGTCCCTGAGGCACAAAGGAAACACACAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 106318 AGAATTGGCCTGGGTCCCTGAGGCACAAAGGAAACACACAGGTA...CAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 CCAAGAAGGCGCCCGACGGCACTGTCATCCCCAACGGCTACTGTGACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106452 CCAAGAAGGCGCCCGACGGCACTGTCATCCCCAACGGCTACTGTGACTTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 TGCCTGGGGGGCTCCAAGAAGACGGGGTGTCCCGAGGACCTCATCTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106502 TGCCTGGGGGGCTCCAAGAAGACGGGGTGTCCCGAGGACCTCATCTCCTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 TGCGGACTGTGGGCGATCAG         GACACCCCTCGTGTTTACAAT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 106552 TGCGGACTGTGGGCGATCAGGTG...CAGGACACCCCTCGTGTTTACAAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 TCACGGTGAACATGACGGCAGCCGTGCGGACCTACCGCTGGCAGTGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108976 TCACGGTGAACATGACGGCAGCCGTGCGGACCTACCGCTGGCAGTGCATC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 GAGTGCAAATCCTGCAGCCTGTGCGGAACCTCCGAGAACGAC        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 109026 GAGTGCAAATCCTGCAGCCTGTGCGGAACCTCCGAGAACGACGTG...CA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1012  GACCAGCTGCTGTTTTGTGATGACTGCGATCGGGGTTACCACATGTACT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110349 GGACCAGCTGCTGTTTTGTGATGACTGCGATCGGGGTTACCACATGTACT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 GCCTGAGTCCCCCCATGGCGGAGCCCCCGGAAG         GGAGCTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 110399 GCCTGAGTCCCCCCATGGCGGAGCCCCCGGAAGGTG...CAGGGAGCTGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 AGCTGTCACCTCTGTCTCCGGCACCTGAAGGAAAAGGCTTCTGCTTACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110586 AGCTGTCACCTCTGTCTCCGGCACCTGAAGGAAAAGGCTTCTGCTTACAT

   1250     .    :
   1152 CACCCTCACC
        ||||||||||
 110636 CACCCTCACC