seq1 = pF1KB7687.tfa, 1044 bp
seq2 = pF1KB7687/gi568815597r_23284341.tfa (gi568815597r:23284341_23524633), 240293 bp

>pF1KB7687 1044
>gi568815597r:23284341_23524633 (Chr1)

(complement)

1-69  (100001-100069)   100% ->
70-132  (105495-105557)   100% ->
133-238  (106625-106730)   100% ->
239-380  (107244-107385)   100% ->
381-443  (115908-115970)   100% ->
444-607  (126679-126842)   100% ->
608-666  (127033-127091)   100% ->
667-819  (130603-130755)   100% ->
820-966  (137215-137361)   100% ->
967-1044  (140217-140293)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCCAGGAAGAGGAGCTGCTGAGGATCGCCAAAAAGCTGGAGAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCCAGGAAGAGGAGCTGCTGAGGATCGCCAAAAAGCTGGAGAAGAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTGGCCAGGAAGAACACG         GAAGGGGCCCTGGACCTTCTGA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100051 GGTGGCCAGGAAGAACACGGTG...CAGGAAGGGGCCCTGGACCTTCTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGAAGCTGCACAGCTGCCAGATGTCCATCCAGCTACTACAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 105517 AGAAGCTGCACAGCTGCCAGATGTCCATCCAGCTACTACAGGTG...CAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 ACAACCAGGATTGGAGTTGCTGTTAATGGGGTCCGCAAGCACTGCTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106625 ACAACCAGGATTGGAGTTGCTGTTAATGGGGTCCGCAAGCACTGCTCAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CAAGGAGGTGGTGTCCTTGGCCAAAGTCCTTATCAAAAACTGGAAGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106675 CAAGGAGGTGGTGTCCTTGGCCAAAGTCCTTATCAAAAACTGGAAGCGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGCTAG         ACTCCCCTGGACCCCCAAAAGGAGAAAAAGGAGAG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106725 TGCTAGGTG...CAGACTCCCCTGGACCCCCAAAAGGAGAAAAAGGAGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GAAAGAGAAAAGGCAAAGAAGAAGGAAAAAGGGCTTGAGTGTTCAGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107279 GAAAGAGAAAAGGCAAAGAAGAAGGAAAAAGGGCTTGAGTGTTCAGACTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GAAGCCAGAAGCAGGCCTTTCTCCACCAAGGAAAAAACGAGAAGACCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107329 GAAGCCAGAAGCAGGCCTTTCTCCACCAAGGAAAAAACGAGAAGACCCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AAACCAG         GAGAGACTCTGTGGACTCCAAGTCTTCTGCCTCC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107379 AAACCAGGTA...CAGGAGAGACTCTGTGGACTCCAAGTCTTCTGCCTCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TCCTCTCCAAAAAGACCATCGGTGGAAAG         ATCAAACAGCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 115942 TCCTCTCCAAAAAGACCATCGGTGGAAAGGTA...CAGATCAAACAGCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 CAAATCAAAAGCGGAGAGCCCCAAAACACCTAGCAGCCCCTTGACCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126691 CAAATCAAAAGCGGAGAGCCCCAAAACACCTAGCAGCCCCTTGACCCCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CGTTTGCCTCTTCCATGTGTCTCCTGGCCCCCTGCTATCTCACAGGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126741 CGTTTGCCTCTTCCATGTGTCTCCTGGCCCCCTGCTATCTCACAGGGGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TCTGTCCGGGACAAGTGTGTGGAGATGCTGTCAGCAGCCCTGAAGGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126791 TCTGTCCGGGACAAGTGTGTGGAGATGCTGTCAGCAGCCCTGAAGGCGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CG         ATGATTACAAGGACTATGGAGTCAACTGTGACAAGATGG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126841 CGGTG...TAGATGATTACAAGGACTATGGAGTCAACTGTGACAAGATGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CATCAGAAATCGAAGATCAT         ATCTACCAAGAGCTCAAGAGC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 127072 CATCAGAAATCGAAGATCATATC...CATATCTACCAAGAGCTCAAGAGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 ACGGACATGAAGTACCGGAACCGCGTGCGCAGCCGCATAAGCAACCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130624 ACGGACATGAAGTACCGGAACCGCGTGCGCAGCCGCATAAGCAACCTCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 GGACCCCAGGAACCCCGGCCTGCGGCGGAACGTGCTCAGTGGGGCCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130674 GGACCCCAGGAACCCCGGCCTGCGGCGGAACGTGCTCAGTGGGGCCATCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 CCGCAGGGCTTATAGCCAAGATGACGGCAGAG         GAAATGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 130724 CCGCAGGGCTTATAGCCAAGATGACGGCAGAGGTG...CAGGAAATGGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 AGTGATGAACTGAGGGAGTTGAGGAATGCCATGACCCAGGAGGCCATCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137224 AGTGATGAACTGAGGGAGTTGAGGAATGCCATGACCCAGGAGGCCATCCG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 TGAGCACCAGATGGCCAAGACTGGCGGCACCACCACTGACCTCTTCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137274 TGAGCACCAGATGGCCAAGACTGGCGGCACCACCACTGACCTCTTCCAGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 GCAGCAAATGCAAGAAGAAGAACTGCACCTATAACCAG         GTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 137324 GCAGCAAATGCAAGAAGAAGAACTGCACCTATAACCAGGTA...CAGGTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 CAGACACGCAGTGCTGATGAGCCCATGACTACCTTTGTCTTATGCAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140220 CAGACACGCAGTGCTGATGAGCCCATGACTACCTTTGTCTTATGCAATGA

   1100     .    :    .    :    .
   1020 ATGTGGCAATCGCTGGAAGTTCTGC
        ||||||||||||||||||| ||||-
 140270 ATGTGGCAATCGCTGGAAGGTCTG