seq1 = pF1KB7682.tfa, 1218 bp
seq2 = pF1KB7682/gi568815597r_154858782.tfa (gi568815597r:154858782_155061576), 202795 bp

>pF1KB7682 1218
>gi568815597r:154858782_155061576 (Chr1)

(complement)

1-103  (100001-100103)   100% ->
104-153  (100551-100600)   100% ->
154-1218  (101731-102795)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGCCTCGGCGCCGCCCCCACCGGACAAGCTGGAGGGAGGTGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCGCCTCGGCGCCGCCCCCACCGGACAAGCTGGAGGGAGGTGGCGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCCGCACCGCCCCCTGCGCCGCCCAGCACCGGGAGGAAGCAGGGCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCCGCACCGCCCCCTGCGCCGCCCAGCACCGGGAGGAAGCAGGGCAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCG         GTCTGCAAATGAAGAGTCCAGAAAAGAAGCGAAGGAAG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCGGTG...CAGGTCTGCAAATGAAGAGTCCAGAAAAGAAGCGAAGGAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCAAATACTCAG         GGCCCTGCATACTCACATCTGACGGAGTT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100589 TCAAATACTCAGGTG...TAGGGCCCTGCATACTCACATCTGACGGAGTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGCACCACCCCCAACTCCCATGGTGGATCACCTGGTTGCATCCAACCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101760 TGCACCACCCCCAACTCCCATGGTGGATCACCTGGTTGCATCCAACCCTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTGAAGATGACTTCGGAGCCCCCAAAGTGGGGGTTGCAGCCCCTCCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101810 TTGAAGATGACTTCGGAGCCCCCAAAGTGGGGGTTGCAGCCCCTCCATTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTTGGCAGTCCTGTGCCCTTCGGAGGCTTCCGTGTGCAGGGGGGCATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101860 CTTGGCAGTCCTGTGCCCTTCGGAGGCTTCCGTGTGCAGGGGGGCATGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGGCCAGGTACCCCCAGGCTACAGCACTGGAGGTGGAGGGGGCCCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101910 GGGCCAGGTACCCCCAGGCTACAGCACTGGAGGTGGAGGGGGCCCCCAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CACTCCGTCGACAGCCACCCCCCTTCCCTCCCAATCCTATGGGCCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101960 CACTCCGTCGACAGCCACCCCCCTTCCCTCCCAATCCTATGGGCCCTGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TTCAACATGCCCCCCCAGGGTCCTGGCTACCCACCCCCAGGCAACATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102010 TTCAACATGCCCCCCCAGGGTCCTGGCTACCCACCCCCAGGCAACATGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CTTTCCCAGCCAACCCTTCAACCAGCCTCTGGGTCAAAACTTTAGTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102060 CTTTCCCAGCCAACCCTTCAACCAGCCTCTGGGTCAAAACTTTAGTCCTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CCAGTGGGCAGATGATGCCGGGCCCAGTGGGGGGATTTGGTCCCATGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102110 CCAGTGGGCAGATGATGCCGGGCCCAGTGGGGGGATTTGGTCCCATGATC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 TCACCCACCATGGGACAGCCTCCCAGAGCAGAGCTGGGCCCACCTTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102160 TCACCCACCATGGGACAGCCTCCCAGAGCAGAGCTGGGCCCACCTTCTCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GTCCCAACGATTTGCTCAGCCAGGGGCTCCTTTTGGCCCTTCTCCTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102210 GTCCCAACGATTTGCTCAGCCAGGGGCTCCTTTTGGCCCTTCTCCTCTCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 AGAGACCTGGTCAGGGGCTCCCCAGCCTGCCGCCTAACACAAGTCCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102260 AGAGACCTGGTCAGGGGCTCCCCAGCCTGCCGCCTAACACAAGTCCCTTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 CCTGGTCCGGACCCTGGCTTTCCTGGCCCTGGTGGTGAGGATGGGGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102310 CCTGGTCCGGACCCTGGCTTTCCTGGCCCTGGTGGTGAGGATGGGGGGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 GCCCTTGAATCCACCTGCTTCTACTGCTTTTCCCCAGGAGCCCCACTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102360 GCCCTTGAATCCACCTGCTTCTACTGCTTTTCCCCAGGAGCCCCACTCAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 GCTCCCCGGCTGCTGCTGTTAATGGGAACCAGCCCAGTTTCCCCCCGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102410 GCTCCCCGGCTGCTGCTGTTAATGGGAACCAGCCCAGTTTCCCCCCGAAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 AGCAGTGGGCGGGGTGGGGGCACTCCAGATGCCAACAGCTTGGCACCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102460 AGCAGTGGGCGGGGTGGGGGCACTCCAGATGCCAACAGCTTGGCACCCCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 TGGCAAGGCAGGTGGGGGCTCCGGGCCCCAGCCTCCCCCAGGCTTGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102510 TGGCAAGGCAGGTGGGGGCTCCGGGCCCCAGCCTCCCCCAGGCTTGGTGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 ACCCATGTGGTGCCTGTCGGAGTGAGGTGAACGATGACCAGGATGCCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102560 ACCCATGTGGTGCCTGTCGGAGTGAGGTGAACGATGACCAGGATGCCATT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 CTGTGTGAGGCCTCCTGCCAGAAATGGTTCCACCGTGAGTGCACAGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102610 CTGTGTGAGGCCTCCTGCCAGAAATGGTTCCACCGTGAGTGCACAGGCAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 GACTGAGAGCGCCTATGGGCTGCTGACCACTGAAGCTTCTGCCGTCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102660 GACTGAGAGCGCCTATGGGCTGCTGACCACTGAAGCTTCTGCCGTCTGGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 CCTGCGATCTCTGCCTCAAGACCAAGGAGATCCAGTCTGTCTACATCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102710 CCTGCGATCTCTGCCTCAAGACCAAGGAGATCCAGTCTGTCTACATCCGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .
   1183 GAGGGCATGGGGCAGCTGGTGGCTGCTAACGATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102760 GAGGGCATGGGGCAGCTGGTGGCTGCTAACGATGGG