seq1 = pF1KB7677.tfa, 1023 bp
seq2 = pF1KB7677/gi568815592r_36266648.tfa (gi568815592r:36266648_36485671), 219024 bp

>pF1KB7677 1023
>gi568815592r:36266648_36485671 (Chr6)

(complement)

1-142  (99997-100138)   97% ->
143-307  (109637-109801)   100% ->
308-433  (112094-112219)   100% ->
434-664  (114112-114342)   100% ->
665-807  (116601-116743)   100% ->
808-908  (118697-118797)   100% ->
909-1023  (118910-119024)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGGAGGGAGAATTGGCTATTTCTCCTATAAGCCCTGTGGCAGCCAT
         |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99997 CTCTAGGAGGGAGAATTGGCTATTTCTCCTATAAGCCCTGTGGCAGCCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCTCCCCTAGGCACCCACGTGCAAGCCAGATGTGAAGCTCAAATTAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100047 GCCTCCCCTAGGCACCCACGTGCAAGCCAGATGTGAAGCTCAAATTAACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCTGGGTGAAGGGGGGATCTGCAAGCTGCCAGGAAGACTCC        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100097 TGCTGGGTGAAGGGGGGATCTGCAAGCTGCCAGGAAGACTCCGTA...CA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    143  GCATCCAGCCCGCACTGTGGAGCAGGGAGGACGTGCTGCACTGGCTGCG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109636 GGCATCCAGCCCGCACTGTGGAGCAGGGAGGACGTGCTGCACTGGCTGCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTGGGCAGAGCAGGAGTACTCTCTGCCATGCACCGCGGAGCACGGGTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109686 CTGGGCAGAGCAGGAGTACTCTCTGCCATGCACCGCGGAGCACGGGTTCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGATGAACGGACGCGCCCTCTGCATCCTCACCAAGGACGACTTCCGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109736 AGATGAACGGACGCGCCCTCTGCATCCTCACCAAGGACGACTTCCGGCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CGTGCGCCCAGCTCAG         GTGACGTCCTGTATGAGCTGCTCCA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 109786 CGTGCGCCCAGCTCAGGTC...CAGGTGACGTCCTGTATGAGCTGCTCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GTACATCAAGACCCAGCGGCGAGCCCTGGTGTGTGGGCCCTTTTTTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112119 GTACATCAAGACCCAGCGGCGAGCCCTGGTGTGTGGGCCCTTTTTTGGAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GGATCTTCAGGCTGAAGACGCCCACCCAGCACTCTCCAGTCCCCCCGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112169 GGATCTTCAGGCTGAAGACGCCCACCCAGCACTCTCCAGTCCCCCCGGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 G         AGGTGACTGGCCCCTCTCAGATGGACACCCGAAGGGGCCA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112219 GGTG...CAGAGGTGACTGGCCCCTCTCAGATGGACACCCGAAGGGGCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCTGCTGCAGCCACCAGACCCAGGGCTTACCAGCAACTTCGGCCACCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114152 CCTGCTGCAGCCACCAGACCCAGGGCTTACCAGCAACTTCGGCCACCTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ATGACCCTGGCCTGGCAAGGTGGACCCCTGGCAAGGAGGAGTCCCTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114202 ATGACCCTGGCCTGGCAAGGTGGACCCCTGGCAAGGAGGAGTCCCTCAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TTATGTCACTGTGCAGAGCTCGGCTGCAGGACCCAGGGGGTCTGTTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114252 TTATGTCACTGTGCAGAGCTCGGCTGCAGGACCCAGGGGGTCTGTTCCTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CCCCGCGATGCCGCAGGCCCCCATTGACGGCAGGATCGCTG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 114302 CCCCGCGATGCCGCAGGCCCCCATTGACGGCAGGATCGCTGGTG...CAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ACTGCCGCCTGCTGTGGGATTACGTGTATCAGCTGCTCCTTGATACCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116601 ACTGCCGCCTGCTGTGGGATTACGTGTATCAGCTGCTCCTTGATACCCGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TATGAGCCCTACATCAAGTGGGAAGACAAGGACGCCAAGATCTTCCGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116651 TATGAGCCCTACATCAAGTGGGAAGACAAGGACGCCAAGATCTTCCGAGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TGTGGATCCAAATGGGCTCGCCAGACTCTGGGGAAATCACAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 116701 TGTGGATCCAAATGGGCTCGCCAGACTCTGGGGAAATCACAAGGTG...C

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    808   AACCGGGTGAACATGACCTACGAGAAGATGTCTCGTGCCCTGCGCCAC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118695 AGAACCGGGTGAACATGACCTACGAGAAGATGTCTCGTGCCCTGCGCCAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 TATTATAAGCTTAATATCATTAAGAAGGAACCGGGGCAGAAACTCCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118745 TATTATAAGCTTAATATCATTAAGAAGGAACCGGGGCAGAAACTCCTGTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CAG         ATTTCTAAAGACTCCGGGAAAGATGGTCCAGGACAAGC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118795 CAGGTG...TAGATTTCTAAAGACTCCGGGAAAGATGGTCCAGGACAAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 ACAGCCACCTGGAGCCGCTGGAGAGCCAGGAGCAGGACAGAATAGAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118948 ACAGCCACCTGGAGCCGCTGGAGAGCCAGGAGCAGGACAGAATAGAGTTC

   1050     .    :    .    :    .
    997 AAGGACAAGAGGCCAGAAATCTCTCCG
        |||||||||||||||||||||||||||
 118998 AAGGACAAGAGGCCAGAAATCTCTCCG