seq1 = pF1KB7673.tfa, 1020 bp
seq2 = pF1KB7673/gi568815586r_79492610.tfa (gi568815586r:79492610_79790244), 297635 bp

>pF1KB7673 1020
>gi568815586r:79492610_79790244 (Chr12)

(complement)

1-516  (100001-100516)   99% ->
517-648  (169038-169169)   99% ->
649-683  (176636-176670)   100% ->
684-831  (193587-193734)   100% ->
832-936  (195812-195916)   100% ->
937-1020  (197552-197635)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGACCGGTGGCTACCGGACCAGCAGCGGCCTCGGCGGCAGCACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGACCGGTGGCTACCGGACCAGCAGCGGCCTCGGCGGCAGCACCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGACTTCCTGGAGGAGTGGAAGGCGAAACGCGAGAAGATGCGCGCCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGACTTCCTGGAGGAGTGGAAGGCGAAACGCGAGAAGATGCGCGCCAAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGAACCCCCCGGGCCCGGCCCCCCCGGGAGGGGGCAGCAGCGACGCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGAACCCCCCGGGCCCGGCCCCCCCGGGAGGGGGCAGCAGCGACGCCGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGGAAGCCCCCCGCGGGGGCTCTGGGCACCCCGGCGGCCGCCGCTGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGGAAGCCCCCCGCGGGGGCTCTGGGCACCCCGGCGGCCGCCGCTGCCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGAGCTCAACAACAACCTCCCGGGCGGCGCGCGGGCCGCACCTGCCGTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 100201 CGAGCTCAACAACAACCTCCCGGGCGGCGCGCCGGCCGCACCTGCCGTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCGGTCCCGGGGGCGTGAACTGCGCGGTCGGCTCCGCCATGCTGACGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCGGTCCCGGGGGCGTGAACTGCGCGGTCGGCTCCGCCATGCTGACGCGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCGGCCCCCGGCCCGCGGCGGTCGGAGGACGAGCCCCCAGCCGCCTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCGGCCCCCGGCCCGCGGCGGTCGGAGGACGAGCCCCCAGCCGCCTCTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTCGGCTGCACCGCCGCCCCAGCGTGACGAGGAGGAGCCGGACGGCGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTCGGCTGCACCGCCGCCCCAGCGTGACGAGGAGGAGCCGGACGGCGTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CAGAGAAGGGCAAGAGCTCGGGCCCCAGTGCCAGGAAAGGCAAGGGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CAGAGAAGGGCAAGAGCTCGGGCCCCAGTGCCAGGAAAGGCAAGGGGCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATCGAGAAGAGGAAGCTGCGGGAGAAGCGGCGCTCCACCGGCGTGGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATCGAGAAGAGGAAGCTGCGGGAGAAGCGGCGCTCCACCGGCGTGGTCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CATCCCTGCCGCAGAG         TGCTTAGATGAGTACGAAGATGATG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100501 CATCCCTGCCGCAGAGGTG...CAGTGCTTAGATGAGTACGAAGATGATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 AAGCAGGGCAGAAAGAGCGGAAACGAGAAGATGCAATTACACAACAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169063 AAGCAGGGCAGAAAGAGCGGAAACGAGAAGATGCAATTACACAACAGAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 ACTATGCAGAATGAAGCTGTAAACTTACTAGATCCAGGCAGTTCCTATCT
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169113 ACTATTCAGAATGAAGCTGTAAACTTACTAGATCCAGGCAGTTCCTATCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GCTACAG         GAGCCACCTAGAACAGTTTCAGGCAGATATAAAA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169163 GCTACAGGTG...CAGGAGCCACCTAGAACAGTTTCAGGCAGATATAAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 G         CACAACCAGTGTCTCTGAAGAAGATGTCTCAAGTAGATAT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176670 GGTA...CAGCACAACCAGTGTCTCTGAAGAAGATGTCTCAAGTAGATAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 TCTCGAACAGATAGAAGTGGGTTCCCTAGATATAACAGGGATGCAAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193627 TCTCGAACAGATAGAAGTGGGTTCCCTAGATATAACAGGGATGCAAATGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 TTCAGGTACTCTGGTTTCAAGTAGCACACTGGAAAAGAAAATTGAAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193677 TTCAGGTACTCTGGTTTCAAGTAGCACACTGGAAAAGAAAATTGAAGATC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 TTGAAAAG         GAAGTAGTAAGAGAAAGACAAGAAAACCTAAGA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 193727 TTGAAAAGGTA...CAGGAAGTAGTAAGAGAAAGACAAGAAAACCTAAGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 CTTGTGAGACTGATGCAAGATAAAGAGGAAATGATTGGAAAACTCAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195845 CTTGTGAGACTGATGCAAGATAAAGAGGAAATGATTGGAAAACTCAAAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 AGAAATTGATTTATTAAATAGA         GACCTAGATGACATAGAAG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 195895 AGAAATTGATTTATTAAATAGAGTA...AAGGACCTAGATGACATAGAAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 ATGAAAATGAACAGCTAAAGCAGGAAAATAAAACTCTTTTGAAAGTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197571 ATGAAAATGAACAGCTAAAGCAGGAAAATAAAACTCTTTTGAAAGTTGTG

   1050     .    :    .
   1006 GGTCAGCTGACCAGG
        |||||||||||||||
 197621 GGTCAGCTGACCAGG