seq1 = pF1KB7671.tfa, 1014 bp
seq2 = pF1KB7671/gi568815582r_4158058.tfa (gi568815582r:4158058_4372746), 214689 bp

>pF1KB7671 1014
>gi568815582r:4158058_4372746 (Chr16)

(complement)

1-89  (100001-100089)   100% ->
90-255  (110046-110211)   100% ->
256-354  (110325-110423)   100% ->
355-525  (110798-110968)   100% ->
526-666  (112152-112292)   99% ->
667-822  (112502-112657)   100% ->
823-1014  (114498-114689)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGTATTTCATGGTGCCCACTCAGAAGGTGCCCTCTTTGCAACATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGTATTTCATGGTGCCCACTCAGAAGGTGCCCTCTTTGCAACATTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGGAAAACAGAGAAAGAAGTGATAGGAGGGCTCTGTAG         CC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100051 CAGGAAAACAGAGAAAGAAGTGATAGGAGGGCTCTGTAGGTG...CAGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTGCCAACATTCCACTAACCCCCGAGACTCAGCGGGACCAGGAGCGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110048 TTGCCAACATTCCACTAACCCCCGAGACTCAGCGGGACCAGGAGCGGCGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATTCGGCGGGAGATCGCCAACAGCAACGAGCGGAGACGCATGCAGAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110098 ATTCGGCGGGAGATCGCCAACAGCAACGAGCGGAGACGCATGCAGAGCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAACGCGGGATTCCAGTCCCTCAAGACCCTCATCCCCCACACAGACGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110148 CAACGCGGGATTCCAGTCCCTCAAGACCCTCATCCCCCACACAGACGGAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGAAGCTCAGCAAG         GCAGCCATTCTCCAGCAGACAGCCGAG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 110198 AGAAGCTCAGCAAGGTG...CAGGCAGCCATTCTCCAGCAGACAGCCGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TACATCTTCTCCCTGGAGCAGGAGAAGACCAGGCTCTTGCAGCAGAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110352 TACATCTTCTCCCTGGAGCAGGAGAAGACCAGGCTCTTGCAGCAGAACAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 ACAGCTCAAGCGCTTCATCCAG         GAGCTGAGCGGCTCGTCCC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 110402 ACAGCTCAAGCGCTTCATCCAGGTG...CAGGAGCTGAGCGGCTCGTCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCAAGCGACGGCGGGCAGAGGACAAGGACGAAGGCATAGGCTCCCCGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110817 CCAAGCGACGGCGGGCAGAGGACAAGGACGAAGGCATAGGCTCCCCGGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ATCTGGGAGGACGAGAAGGCGGAGGACCTGCGGCGGGAGATGATTGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110867 ATCTGGGAGGACGAGAAGGCGGAGGACCTGCGGCGGGAGATGATTGAGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GCGGCAGCAGCTGGACAAGGAGCGCTCGGTGCGCATGATGCTGGAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110917 GCGGCAGCAGCTGGACAAGGAGCGCTCGGTGCGCATGATGCTGGAGGAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AG         GTGCGCTCGCTGGAGGCCCACATGTACCCGGAAAAGCTC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110967 AGGTG...CAGGTGCGCTCGCTGGAGGCCCACATGTACCCGGAAAAGCTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AAGGTGATTGCGCAGCAGGTGCAGCTGCAGCAGCAGCAGGAACAGGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112191 AAGGTGATTGCGCAGCAGGTGCAGCTGCAGCAGCAGCAGGAACAGGTGAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GCTGCTGCACCAGGAGAAGCTGGAGCGGGAACAGCAGCACCTGCGGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
 112241 GCTGCTGCACCAGGAGAAGCTGGAGCGGGAACAGCAGCAGCTGCGGACCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AG         CTTCTGCCCCCTCCGGCCCCCACCCACCACCCCACGGTG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112291 AGGTG...CAGCTTCTGCCCCCTCCGGCCCCCACCCACCACCCCACGGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 ATCGTGCCAGCACCGCCTCCTCCTCCCTCCCACCACATCAATGTCGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112541 ATCGTGCCAGCACCGCCTCCTCCTCCCTCCCACCACATCAATGTCGTCAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CATGGGCCCCTCCTCGGTCATCAACTCTGTTTCCACATCCCGGCAAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112591 CATGGGCCCCTCCTCGGTCATCAACTCTGTTTCCACATCCCGGCAAAATC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TGGACACCATCGTGCAG         GCAATCCAGCACATCGAGGGCACC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 112641 TGGACACCATCGTGCAGGTA...CAGGCAATCCAGCACATCGAGGGCACC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CAGGAAAAGCAGGAGCTGGAGGAGGAGCAGCGGCGAGCTGTCATCGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114522 CAGGAAAAGCAGGAGCTGGAGGAGGAGCAGCGGCGAGCTGTCATCGTGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GCCTGTCCGCAGCTGCCCGGAGGCCCCCACCTCTGACACCGCCTCCGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114572 GCCTGTCCGCAGCTGCCCGGAGGCCCCCACCTCTGACACCGCCTCCGACT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CCGAGGCCTCAGACAGTGACGCCATGGACCAGAGCCGGGAGGAGCCGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114622 CCGAGGCCTCAGACAGTGACGCCATGGACCAGAGCCGGGAGGAGCCGTCG

   1050     .    :    .
    997 GGGGACGGGGAGCTTCCC
        ||||||||||||||||||
 114672 GGGGACGGGGAGCTTCCC