seq1 = pF1KB7668.tfa, 1206 bp
seq2 = pF1KB7668/gi568815586r_113363193.tfa (gi568815586r:113363193_113571498), 208306 bp

>pF1KB7668 1206
>gi568815586r:113363193_113571498 (Chr12)

(complement)

1-173  (100001-100173)   100% ->
174-397  (102154-102377)   100% ->
398-675  (103095-103372)   100% ->
676-841  (104078-104243)   100% ->
842-1206  (107942-108306)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGGTGCACTGCGCCGGTTGCGAGCGGCCCATCCTCGACCGCTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGGTGCACTGCGCCGGTTGCGAGCGGCCCATCCTCGACCGCTTTCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGAACGTGCTGGACCGCGCGTGGCACATCAAATGTGTTCAGTGCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGAACGTGCTGGACCGCGCGTGGCACATCAAATGTGTTCAGTGCTGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGTGCAAAACCAACCTCTCGGAGAAGTGCTTCTCGCGCGAGGGCAAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGTGCAAAACCAACCTCTCGGAGAAGTGCTTCTCGCGCGAGGGCAAGCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TACTGCAAAAATGACTTTTTCAG         GCGCTTTGGCACGAAATG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100151 TACTGCAAAAATGACTTTTTCAGGTA...CAGGCGCTTTGGCACGAAATG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGCCGGCTGCGCGCAAGGCATCTCGCCCAGCGACCTGGTGCGCAAGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102172 CGCCGGCTGCGCGCAAGGCATCTCGCCCAGCGACCTGGTGCGCAAGGCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GGAGCAAAGTCTTTCACCTCAACTGTTTCACCTGCATGGTGTGTAACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102222 GGAGCAAAGTCTTTCACCTCAACTGTTTCACCTGCATGGTGTGTAACAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CAGCTGTCCACCGGCGAGGAGCTCTACGTCATCGACGAGAACAAGTTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102272 CAGCTGTCCACCGGCGAGGAGCTCTACGTCATCGACGAGAACAAGTTCGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GTGCAAAGACGACTACCTGAGCTCATCCAGCCTCAAGGAGGGCAGCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102322 GTGCAAAGACGACTACCTGAGCTCATCCAGCCTCAAGGAGGGCAGCCTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ACTCAG         TGTCATCCTGTACGGACCGCAGTTTGTCCCCGGAC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102372 ACTCAGGTA...CAGTGTCATCCTGTACGGACCGCAGTTTGTCCCCGGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CTCCAGGACGCACTGCAGGACGACCCCAAAGAGACGGACAACTCGACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103130 CTCCAGGACGCACTGCAGGACGACCCCAAAGAGACGGACAACTCGACCTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GTCGGACAAGGAGACGGCCAACAACGAGAACGAGGAGCAGAACTCGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103180 GTCGGACAAGGAGACGGCCAACAACGAGAACGAGGAGCAGAACTCGGGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CCAAGCGGCGCGGCCCCCGCACCACCATCAAGGCCAAGCAGCTGGAGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103230 CCAAGCGGCGCGGCCCCCGCACCACCATCAAGGCCAAGCAGCTGGAGACG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CTCAAGGCTGCCTTCGCCGCCACGCCCAAGCCCACGCGCCACATCCGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103280 CTCAAGGCTGCCTTCGCCGCCACGCCCAAGCCCACGCGCCACATCCGCGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GCAGCTGGCGCAGGAGACCGGCCTCAACATGCGCGTCATCCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 103330 GCAGCTGGCGCAGGAGACCGGCCTCAACATGCGCGTCATCCAGGTG...C

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    676   GTGTGGTTTCAGAACCGACGGTCCAAAGAACGCCGGATGAAACAGCTG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104076 AGGTGTGGTTTCAGAACCGACGGTCCAAAGAACGCCGGATGAAACAGCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 AGCGCCCTAGGCGCCCGGAGGCACGCCTTCTTCCGGAGTCCGCGGCGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104126 AGCGCCCTAGGCGCCCGGAGGCACGCCTTCTTCCGGAGTCCGCGGCGCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GCGTCCGCTGGGCGGCCGCTTGGACGAGTCTGAGATGTTGGGGTCCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104176 GCGTCCGCTGGGCGGCCGCTTGGACGAGTCTGAGATGTTGGGGTCCACCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 CGTACACCTACTACGGAG         ACTACCAAGGCGACTACTACGCG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 104226 CGTACACCTACTACGGAGGTA...CAGACTACCAAGGCGACTACTACGCG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 CCGGGAAGCAACTACGACTTCTTCGCGCACGGCCCGCCTTCGCAGGCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107965 CCGGGAAGCAACTACGACTTCTTCGCGCACGGCCCGCCTTCGCAGGCGCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 GTCCCCGGCCGACTCCAGCTTCCTGGCGGCCTCTGGCCCCGGCTCGACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108015 GTCCCCGGCCGACTCCAGCTTCCTGGCGGCCTCTGGCCCCGGCTCGACGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 CGCTGGGAGCGCTGGAACCGCCGCTCGCCGGCCCGCACGCCGCGGACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108065 CGCTGGGAGCGCTGGAACCGCCGCTCGCCGGCCCGCACGCCGCGGACAAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 CCCAGGTTCACCGACATGATCTCGCACCCGGACACACCGAGCCCCGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108115 CCCAGGTTCACCGACATGATCTCGCACCCGGACACACCGAGCCCCGAGCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 AGGCCTGCCGGGCACGCTGCACCCCATGCCCGGCGAGGTATTCAGCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108165 AGGCCTGCCGGGCACGCTGCACCCCATGCCCGGCGAGGTATTCAGCGGCG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 GGCCCAGCCCGCCCTTCCCAATGAGCGGCACCAGCGGCTACAGCGGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108215 GGCCCAGCCCGCCCTTCCCAATGAGCGGCACCAGCGGCTACAGCGGACCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 CTGTCGCATCCCAACCCCGAGCTCAACGAAGCCGCCGTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108265 CTGTCGCATCCCAACCCCGAGCTCAACGAAGCCGCCGTGTGG