seq1 = pF1KB7666.tfa, 1113 bp
seq2 = pF1KB7666/gi568815594r_107964333.tfa (gi568815594r:107964333_108267767), 303435 bp

>pF1KB7666 1113
>gi568815594r:107964333_108267767 (Chr4)

(complement)

1-213  (100001-100213)   100% ->
214-280  (102605-102671)   100% ->
281-414  (104067-104200)   100% ->
415-547  (178511-178643)   100% ->
548-638  (184322-184412)   100% ->
639-761  (188154-188276)   100% ->
762-924  (189386-189548)   100% ->
925-1032  (196998-197105)   100% ->
1033-1081  (203384-203432)   100% ->
1082-1113  (204105-204136)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCCAACTCTCCGGAGGAGGTGGCGGCGGCGGGGGGGACCCGGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCCAACTCTCCGGAGGAGGTGGCGGCGGCGGGGGGGACCCGGAACT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGCGCCACGGACGAGATGATCCCCTTCAAGGACGAGGGCGATCCTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGCGCCACGGACGAGATGATCCCCTTCAAGGACGAGGGCGATCCTCAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGAAAAGATCTTCGCCGAGATCAGTCATCCCGAAGAGGAAGGCGATTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGAAAAGATCTTCGCCGAGATCAGTCATCCCGAAGAGGAAGGCGATTTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCTGACATCAAGTCTTCCTTGGTGAACGAGTCTGAAATCATCCCGGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCTGACATCAAGTCTTCCTTGGTGAACGAGTCTGAAATCATCCCGGCCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAACGGACACGAG         GTGGCCAGACAAGCACAAACCTCTCAGG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAACGGACACGAGGTG...TAGGTGGCCAGACAAGCACAAACCTCTCAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGCCCTACCACGACAAGGCCAGAGAACACCCCGATGACG         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 102633 AGCCCTACCACGACAAGGCCAGAGAACACCCCGATGACGGTA...CAGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAGCATCCAGATGGAGGCCTCTACAACAAGGGACCCTCCTACTCGAGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104069 AAGCATCCAGATGGAGGCCTCTACAACAAGGGACCCTCCTACTCGAGTTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TTCCGGGTACATAATGATGCCAAATATGAATAACGACCCATACATGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104119 TTCCGGGTACATAATGATGCCAAATATGAATAACGACCCATACATGTCAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATGGATCTCTTTCTCCACCCATCCCGAGAACA         TCAAATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 104169 ATGGATCTCTTTCTCCACCCATCCCGAGAACAGTA...CAGTCAAATAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GTGCCCGTGGTGCAGCCATCCCATGCGGTCCATCCTCTCACCCCCCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178520 GTGCCCGTGGTGCAGCCATCCCATGCGGTCCATCCTCTCACCCCCCTCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CACTTACAGTGACGAGCACTTTTCTCCAGGATCACACCCGTCACACATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178570 CACTTACAGTGACGAGCACTTTTCTCCAGGATCACACCCGTCACACATCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CATCAGATGTCAACTCCAAACAAG         GCATGTCCAGACATCCT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 178620 CATCAGATGTCAACTCCAAACAAGGTG...CAGGCATGTCCAGACATCCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CCAGCTCCTGATATCCCTACTTTTTATCCCTTGTCTCCGGGTGGTGTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184339 CCAGCTCCTGATATCCCTACTTTTTATCCCTTGTCTCCGGGTGGTGTTGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 ACAGATCACCCCACCTCTTGGCTG         GTTTTCCCATCATATGA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 184389 ACAGATCACCCCACCTCTTGGCTGGTA...CAGGTTTTCCCATCATATGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TTCCCGGTCCTCCTGGTCCCCACACAACTGGCATCCCTCATCCAGCTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188171 TTCCCGGTCCTCCTGGTCCCCACACAACTGGCATCCCTCATCCAGCTATT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GTAACACCTCAGGTCAAACAGGAACATCCCCACACTGACAGTGACCTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188221 GTAACACCTCAGGTCAAACAGGAACATCCCCACACTGACAGTGACCTAAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GCACGT         GAAGCCTCAGCATGAACAGAGAAAGGAGCAGGAGC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188271 GCACGTGTA...TAGGAAGCCTCAGCATGAACAGAGAAAGGAGCAGGAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CAAAAAGACCTCACATTAAGAAGCCTCTGAATGCTTTTATGTTATACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189421 CAAAAAGACCTCACATTAAGAAGCCTCTGAATGCTTTTATGTTATACATG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 AAAGAAATGAGAGCGAATGTCGTTGCTGAGTGTACTCTAAAAGAAAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189471 AAAGAAATGAGAGCGAATGTCGTTGCTGAGTGTACTCTAAAAGAAAGTGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 AGCTATCAACCAGATTCTTGGCAGAAGG         TGGCATGCCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 189521 AGCTATCAACCAGATTCTTGGCAGAAGGGTA...TAGTGGCATGCCCTCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CCCGTGAAGAGCAGGCTAAATATTATGAATTAGCACGGAAAGAAAGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197011 CCCGTGAAGAGCAGGCTAAATATTATGAATTAGCACGGAAAGAAAGACAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CTACATATGCAGCTTTATCCAGGCTGGTCTGCAAGAGACAATTAT     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 197061 CTACATATGCAGCTTTATCCAGGCTGGTCTGCAAGAGACAATTATGTA..

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033     GGTAAGAAAAAGAAGAGGAAGAGAGAGAAACTACAGGAATCTGCAT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197111 .CAGGGTAAGAAAAAGAAGAGGAAGAGAGAGAAACTACAGGAATCTGCAT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 CAG         GTACAGGTCCAAGAATGACAGCTGCCTACATC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 203430 CAGGTA...CAGGTACAGGTCCAAGAATGACAGCTGCCTACATC