seq1 = pF1KB7665.tfa, 1011 bp
seq2 = pF1KB7665/gi568815592f_125649777.tfa (gi568815592f:125649777_125859799), 210023 bp

>pF1KB7665 1011
>gi568815592f:125649777_125859799 (Chr6)

1-83  (100001-100083)   100% ->
84-162  (102025-102103)   100% ->
163-246  (102231-102314)   100% ->
247-328  (104689-104770)   100% ->
329-1011  (109341-110023)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGCGCCCCTGCGAGGAGACGACCTCCGAGAGCGACATGGACGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGCGCCCCTGCGAGGAGACGACCTCCGAGAGCGACATGGACGAGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATCGACGTGGGGAGCGAGAACAATTACTCGGG         GCAAAGTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100051 CATCGACGTGGGGAGCGAGAACAATTACTCGGGGTG...TAGGCAAAGTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CTAGCTCTGTGATTAGATTGAATTCTCCAACAACAACATCTCAGATTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102033 CTAGCTCTGTGATTAGATTGAATTCTCCAACAACAACATCTCAGATTATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCAAGAAAGAAAAGGAGAGGG         ATTATAGAGAAAAGGCGTCG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 102083 GCAAGAAAGAAAAGGAGAGGGGTA...TAGATTATAGAGAAAAGGCGTCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GGATCGGATAAATAACAGTTTATCTGAGTTGAGAAGACTTGTGCCAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102251 GGATCGGATAAATAACAGTTTATCTGAGTTGAGAAGACTTGTGCCAACTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTTTTGAAAAACAA         GGATCTGCAAAGTTAGAAAAAGCTGAA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 102301 CTTTTGAAAAACAAGTA...AAGGGATCTGCAAAGTTAGAAAAAGCTGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 ATATTGCAAATGACAGTGGATCATTTGAAGATGCTTCAGGCAACAGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104716 ATATTGCAAATGACAGTGGATCATTTGAAGATGCTTCAGGCAACAGGGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TAAAG         GCTACTTTGACGCACACGCTCTTGCCATGGACTTCA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104766 TAAAGGTA...TAGGCTACTTTGACGCACACGCTCTTGCCATGGACTTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TGAGCATAGGATTCCGAGAGTGCCTAACAGAAGTTGCGCGGTACCTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109377 TGAGCATAGGATTCCGAGAGTGCCTAACAGAAGTTGCGCGGTACCTGAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TCCGTGGAAGGCCTGGACTCCTCGGATCCGCTGCGGGTGCGGCTTGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109427 TCCGTGGAAGGCCTGGACTCCTCGGATCCGCTGCGGGTGCGGCTTGTGTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TCATCTCAGCACTTGCGCCACCCAGCGGGAGGCGGCGGCCATGACATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109477 TCATCTCAGCACTTGCGCCACCCAGCGGGAGGCGGCGGCCATGACATCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CCATGGCCCACCACCATCATCCGCTCCACCCGCATCACTGGGCCGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109527 CCATGGCCCACCACCATCATCCGCTCCACCCGCATCACTGGGCCGCCGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TTCCACCACCTGCCCGCAGCCCTGCTCCAGCCCAACGGCCTCCATGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109577 TTCCACCACCTGCCCGCAGCCCTGCTCCAGCCCAACGGCCTCCATGCCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AGAGTCAACCCCTTGTCGCCTCTCCACAACTTCAGAAGTGCCTCCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109627 AGAGTCAACCCCTTGTCGCCTCTCCACAACTTCAGAAGTGCCTCCTGCCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ACGGCTCTGCTCTCCTCACGGCCACGTTTGCCCATGCGGATTCAGCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109677 ACGGCTCTGCTCTCCTCACGGCCACGTTTGCCCATGCGGATTCAGCCCTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CGAATGCCATCCACGGGCAGCGTCGCCCCCTGCGTGCCACCTCTCTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109727 CGAATGCCATCCACGGGCAGCGTCGCCCCCTGCGTGCCACCTCTCTCCAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CTCTCTCTTGTCCCTCTCTGCCACCGTCCACGCCGCAGCCGCAGCAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109777 CTCTCTCTTGTCCCTCTCTGCCACCGTCCACGCCGCAGCCGCAGCAGCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 CCGCGGCTGCACACAGCTTCCCTCTGTCCTTCGCGGGGGCATTCCCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109827 CCGCGGCTGCACACAGCTTCCCTCTGTCCTTCGCGGGGGCATTCCCCATG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 CTTCCCCCAAACGCAGCAGCAGCAGTGGCCGCGGCCACAGCCATCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109877 CTTCCCCCAAACGCAGCAGCAGCAGTGGCCGCGGCCACAGCCATCAGCCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 GCCCTTGTCAGTATCAGCCACGTCCAGTCCTCAGCAGACCAGCAGTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109927 GCCCTTGTCAGTATCAGCCACGTCCAGTCCTCAGCAGACCAGCAGTGGAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    965 CAAACAATAAACCTTACCGACCCTGGGGGACAGAAGTTGGAGCTTTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109977 CAAACAATAAACCTTACCGACCCTGGGGGACAGAAGTTGGAGCTTTT