seq1 = pF1KB7661.tfa, 1005 bp
seq2 = pF1KB7661/gi568815592r_34438277.tfa (gi568815592r:34438277_34644455), 206179 bp

>pF1KB7661 1005
>gi568815592r:34438277_34644455 (Chr6)

(complement)

1-436  (100001-100436)   100% ->
437-634  (103275-103472)   100% ->
635-682  (104894-104941)   100% ->
683-829  (105060-105206)   100% ->
830-1005  (106004-106179)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCAGCGCCAGCCCGGGTCTGAGCAGCGTATCCCCCAGCCACCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCAGCGCCAGCCCGGGTCTGAGCAGCGTATCCCCCAGCCACCTCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGCCCCCCGACACGGTGTCGCGGACAGGCTTGGAGAAGGCGGCAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGCCCCCCGACACGGTGTCGCGGACAGGCTTGGAGAAGGCGGCAGCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGGCAGTGGGTCTCGAGAGACGGGACTGGAGTCCCAGTCCACCCGCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGGCAGTGGGTCTCGAGAGACGGGACTGGAGTCCCAGTCCACCCGCCACG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCGAGCAGGGCCTGTCCGCCTTCTACCTCTCCTACTTTGACATGCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCCGAGCAGGGCCTGTCCGCCTTCTACCTCTCCTACTTTGACATGCTGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCCTGAGGACAGCAGCTGGGCAGCCAAGGCCCCTGGGGCCAGCAGTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCCTGAGGACAGCAGCTGGGCAGCCAAGGCCCCTGGGGCCAGCAGTCGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGGAGCCACCTGAGGAGCCTGAGCAGTGCCCGGTCATTGACAGCCAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGGAGCCACCTGAGGAGCCTGAGCAGTGCCCGGTCATTGACAGCCAAGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCAGCGGGCAGCCTGGACTTGGTGCCCGGCGGGCTGACCTTGGAGGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCAGCGGGCAGCCTGGACTTGGTGCCCGGCGGGCTGACCTTGGAGGAGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTCGCTGGAGCAGGTGCAGTCCATGGTGGTGGGCGAAGTGCTCAAGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTCGCTGGAGCAGGTGCAGTCCATGGTGGTGGGCGAAGTGCTCAAGGACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCGAGACGGCCTGCAAGCTGCTCAACATCACCGCAG         ATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100401 TCGAGACGGCCTGCAAGCTGCTCAACATCACCGCAGGTG...CAGATCCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 ATGGACTGGAGCCCCAGCAATGTGCAGAAGTGGCTCCTGTGGACAGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103280 ATGGACTGGAGCCCCAGCAATGTGCAGAAGTGGCTCCTGTGGACAGAGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CCAATACCGGCTGCCCCCCATGGGCAAGGCCTTCCAGGAGCTGGCGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103330 CCAATACCGGCTGCCCCCCATGGGCAAGGCCTTCCAGGAGCTGGCGGGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 AGGAGCTGTGCGCCATGTCGGAGGAGCAGTTCCGCCAGCGCTCGCCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103380 AGGAGCTGTGCGCCATGTCGGAGGAGCAGTTCCGCCAGCGCTCGCCCCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GGTGGGGATGTGCTGCACGCCCACCTGGACATCTGGAAGTCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 103430 GGTGGGGATGTGCTGCACGCCCACCTGGACATCTGGAAGTCAGGTA...C

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    635   CGGCCTGGATGAAAGAGCGGACTTCACCTGGGGCGATTCACTACTGTG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104892 AGCGGCCTGGATGAAAGAGCGGACTTCACCTGGGGCGATTCACTACTGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683          CCTCGACCAGTGAGGAGAGCTGGACCGACAGCGAGGTGGAC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104942 GTG...CAGCCTCGACCAGTGAGGAGAGCTGGACCGACAGCGAGGTGGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 TCATCATGCTCCGGGCAGCCCATCCACCTGTGGCAGTTCCTCAAGGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105101 TCATCATGCTCCGGGCAGCCCATCCACCTGTGGCAGTTCCTCAAGGAGTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GCTACTCAAGCCCCACAGCTATGGCCGCTTCATTAGGTGGCTCAACAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105151 GCTACTCAAGCCCCACAGCTATGGCCGCTTCATTAGGTGGCTCAACAAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 AGAAGG         GCATCTTCAAAATTGAGGACTCAGCCCAGGTGGCC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105201 AGAAGGGTG...TAGGCATCTTCAAAATTGAGGACTCAGCCCAGGTGGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 CGGCTGTGGGGCATCCGCAAGAACCGTCCCGCCATGAACTACGACAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106039 CGGCTGTGGGGCATCCGCAAGAACCGTCCCGCCATGAACTACGACAAGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 GAGCCGCTCCATCCGCCAGTATTACAAGAAGGGCATCATCCGGAAGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106089 GAGCCGCTCCATCCGCCAGTATTACAAGAAGGGCATCATCCGGAAGCCAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :
    965 ACATCTCCCAGCGCCTCGTCTACCAGTTCGTGCACCCCATC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106139 ACATCTCCCAGCGCCTCGTCTACCAGTTCGTGCACCCCATC