seq1 = pF1KB7660.tfa, 1185 bp
seq2 = pF1KB7660/gi568815591r_100366962.tfa (gi568815591r:100366962_100578038), 211077 bp

>pF1KB7660 1185
>gi568815591r:100366962_100578038 (Chr7)

(complement)

1-762  (100001-100762)   100% ->
763-929  (103599-103765)   100% ->
930-978  (110439-110487)   100% ->
979-1185  (110871-111077)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCGGGGGCAAGAAGAAGAGTAGTTTCCAAATCACCAGCGTCACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCGGGGGCAAGAAGAAGAGTAGTTTCCAAATCACCAGCGTCACCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGACTATGAGGGCCCTGGGAGCCCAGGGGCTTCGGATCCCCCTACCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGACTATGAGGGCCCTGGGAGCCCAGGGGCTTCGGATCCCCCTACCCCAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCCCCCAACCGGGCCCCCGCCCCGCCTGCCCAATGGGGAGCCCAGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGCCCCCAACCGGGCCCCCGCCCCGCCTGCCCAATGGGGAGCCCAGCCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GATCCGGGGGGCAAGGGCACCCCCCGGAATGGCTCCCCACCACCTGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GATCCGGGGGGCAAGGGCACCCCCCGGAATGGCTCCCCACCACCTGGGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCCTTCCTCCCGTTTCCGGGTGGTGAAGCTGCCCCACGGCCTGGGAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCCTTCCTCCCGTTTCCGGGTGGTGAAGCTGCCCCACGGCCTGGGAGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTTATCGCCGCGGTCGCTGGACGTGTGTGGATGTTTATGAGCGAGACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTTATCGCCGCGGTCGCTGGACGTGTGTGGATGTTTATGAGCGAGACCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAGCCCCACAGCTTCGGCGGACTCCTGGAGGGAATTCGAGGGGCCTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAGCCCCACAGCTTCGGCGGACTCCTGGAGGGAATTCGAGGGGCCTCAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGGCGCCGGGGGCAGATCTTTGGATTCCAGGTTGGAGCTGGCCAGCCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGGCGCCGGGGGCAGATCTTTGGATTCCAGGTTGGAGCTGGCCAGCCTCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCCTGGGCGCCCCCACCCCACCGTCAGGCCTGTCTCAGGGCCCCACCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCCTGGGCGCCCCCACCCCACCGTCAGGCCTGTCTCAGGGCCCCACCTCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TGGCTCCGTCCACCCCCCACCTCTCCTGGACCTCAGGCCCGCTCCTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TGGCTCCGTCCACCCCCCACCTCTCCTGGACCTCAGGCCCGCTCCTTCAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGGGGGACTGGGCCAGCTGGTGGTGCCCAGCAAAGCCAAGGCAGAGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGGGGGACTGGGCCAGCTGGTGGTGCCCAGCAAAGCCAAGGCAGAGAAAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCCCACTGTCGGCCTCCTCACCCCAGCAGCGCCCCCCAGAGCCTGAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCCCACTGTCGGCCTCCTCACCCCAGCAGCGCCCCCCAGAGCCTGAGACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GGTGAGAGTGCGGGCACATCCCGGGCTGCCACGCCCCTGCCCTCTCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GGTGAGAGTGCGGGCACATCCCGGGCTGCCACGCCCCTGCCCTCTCTGAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGTGGAAGCGGAGGCTGGGGGCTCAGGGGCCAGGACCCCTCCACTGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGTGGAAGCGGAGGCTGGGGGCTCAGGGGCCAGGACCCCTCCACTGTCCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGAGGAAAGCTGTAGACATGCGGCTGCGGATGGAGTTGGGTGCTCCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GGAGGAAAGCTGTAGACATGCGGCTGCGGATGGAGTTGGGTGCTCCAGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GAGATGGGGCAG         GTGCCCCCACTTGACTCTCGCCCCAGCTC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GAGATGGGGCAGGTA...CAGGTGCCCCCACTTGACTCTCGCCCCAGCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CCCAGCCCTCTACTTCACCCACGATGCCAGCCTGGTTCACAAATCTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103628 CCCAGCCCTCTACTTCACCCACGATGCCAGCCTGGTTCACAAATCTCCAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 ACCCCTTCGGAGCAGTAGCAGCTCAGAAGTTCAGCCTGGCCCACTCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103678 ACCCCTTCGGAGCAGTAGCAGCTCAGAAGTTCAGCCTGGCCCACTCCATG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 TTGGCCATCAGTGGTCACCTAGACAGCGACGATGATAG         TGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 103728 TTGGCCATCAGTGGTCACCTAGACAGCGACGATGATAGGTA...CAGTGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 CTCCGGAAGCCTGGTTGGCATTGACAACAAAATCGAGCAAGCCATG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 110442 CTCCGGAAGCCTGGTTGGCATTGACAACAAAATCGAGCAAGCCATGGTA.

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979      GACTTGGTGAAGTCCCACCTCATGTTTGCGGTCCGGGAGGAGGTG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110492 ..CAGGACTTGGTGAAGTCCCACCTCATGTTTGCGGTCCGGGAGGAGGTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 GAGGTGCTGAAGGAGCAGATCCGGGAATTGGCGGAGCGGAACGCTGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110916 GAGGTGCTGAAGGAGCAGATCCGGGAATTGGCGGAGCGGAACGCTGCGCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 GGAGCAGGAGAATGGGCTGCTGCGCGCCCTGGCCAGCCCGGAGCAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110966 GGAGCAGGAGAATGGGCTGCTGCGCGCCCTGGCCAGCCCGGAGCAGCTGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 CTCAGCTGCCCTCCTCGGGGGTCCCACGGCTTGGGCCCCCTGCGCCCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111016 CTCAGCTGCCCTCCTCGGGGGTCCCACGGCTTGGGCCCCCTGCGCCCAAT

   1200     .    :
   1174 GGGCCCTCCGTC
        ||||||||||||
 111066 GGGCCCTCCGTC