seq1 = pF1KB7649.tfa, 987 bp
seq2 = pF1KB7649/gi568815588r_95137928.tfa (gi568815588r:95137928_95390915), 252988 bp

>pF1KB7649 987
>gi568815588r:95137928_95390915 (Chr10)

(complement)

1-96  (100001-100096)   100% ->
97-248  (119132-119283)   100% ->
249-333  (122054-122138)   100% ->
334-533  (126853-127052)   100% ->
534-685  (143550-143701)   100% ->
686-803  (152231-152348)   100% ->
804-987  (152805-152988)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCACCCAGCAGATAGACCTCCAGGGCCCGGGGCCGTGGGGCTTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCACCCAGCAGATAGACCTCCAGGGCCCGGGGCCGTGGGGCTTCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTCGTGGGCGGCAAGGACTTCGAGCAGCCTCTCGCCATTTCCCGG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100051 CCTCGTGGGCGGCAAGGACTTCGAGCAGCCTCTCGCCATTTCCCGGGTA.

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     97      GTCACTCCTGGAAGCAAGGCGGCTCTAGCTAATTTATGTATTGGA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ..TAGGTCACTCCTGGAAGCAAGGCGGCTCTAGCTAATTTATGTATTGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GATGTAATCACAGCCATTGATGGGGAAAATACTAGCAATATGACACACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119177 GATGTAATCACAGCCATTGATGGGGAAAATACTAGCAATATGACACACTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGAAGCTCAGAACAGAATCAAAGGCTGCACAGACAACTTGACTCTCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119227 GGAAGCTCAGAACAGAATCAAAGGCTGCACAGACAACTTGACTCTCACTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TAGCCAG         ATCTGAACATAAAGTCTGGTCTCCTCTGGTGACG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119277 TAGCCAGGTG...CAGATCTGAACATAAAGTCTGGTCTCCTCTGGTGACG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAGGAAGGGAAGCGTCATCCATACAAGATGAATTTAGCCTCTGAACCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122088 GAGGAAGGGAAGCGTCATCCATACAAGATGAATTTAGCCTCTGAACCCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 G         GAGGTCCTGCACATAGGAAGCGCCCACAACCGAAGTGCCA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122138 GGTA...CAGGAGGTCCTGCACATAGGAAGCGCCCACAACCGAAGTGCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGCCCTTTACCGCCTCGCCTGCCTCCAGCACTACTGCCAGGGTCATCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126893 TGCCCTTTACCGCCTCGCCTGCCTCCAGCACTACTGCCAGGGTCATCACA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AACCAGTACAACAACCCAGCTGGCCTCTACTCTTCTGAAAATATCTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126943 AACCAGTACAACAACCCAGCTGGCCTCTACTCTTCTGAAAATATCTCCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CTTCAACAATGCCCTGGAGTCAAAGACTGCTGCCAGCGGGGTGGAGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126993 CTTCAACAATGCCCTGGAGTCAAAGACTGCTGCCAGCGGGGTGGAGGCGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ACAGCAGACC         CTTAGACCATGCTCAGCCTCCAAGCAGCCTT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 127043 ACAGCAGACCGTA...CAGCTTAGACCATGCTCAGCCTCCAAGCAGCCTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GTCATCGACAAAGAATCTGAAGTTTACAAGATGCTTCAGGAGAAACAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143581 GTCATCGACAAAGAATCTGAAGTTTACAAGATGCTTCAGGAGAAACAGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GTTGAATGAGCCCCCGAAACAGTCCACGTCTTTCTTGGTTTTGCAGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143631 GTTGAATGAGCCCCCGAAACAGTCCACGTCTTTCTTGGTTTTGCAGGAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TCCTGGAGTCTGAAGAAAAAG         GGGATCCCAACAAGCCCTCA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 143681 TCCTGGAGTCTGAAGAAAAAGGTA...CAGGGGATCCCAACAAGCCCTCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GGATTCAGAAGTGTTAAAGCTCCTGTCACTAAAGTGGCTGCGTCGATTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152251 GGATTCAGAAGTGTTAAAGCTCCTGTCACTAAAGTGGCTGCGTCGATTGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 AAATGCTCAGAAGTTGCCTATGTGTGACAAATGTGGCACTGGGATTGT  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 152301 AAATGCTCAGAAGTTGCCTATGTGTGACAAATGTGGCACTGGGATTGTGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    804        TGGTGTGTTTGTGAAGCTGCGGGACCGTCACCGCCACCCTGAG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152351 G...TAGTGGTGTGTTTGTGAAGCTGCGGGACCGTCACCGCCACCCTGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TGTTATGTGTGCACTGACTGTGGCACCAACCTGAAACAGAAGGGCCATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152848 TGTTATGTGTGCACTGACTGTGGCACCAACCTGAAACAGAAGGGCCATTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CTTTGTGGAGGATCAAATCTACTGTGAGAAGCATGCCCGGGAGCGAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152898 CTTTGTGGAGGATCAAATCTACTGTGAGAAGCATGCCCGGGAGCGAGTCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CACCACCTGAGGGTTATGAAGTGGTCACTGTGTTCCCCAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152948 CACCACCTGAGGGTTATGAAGTGGTCACTGTGTTCCCCAAG