seq1 = pF1KB7639.tfa, 978 bp
seq2 = pF1KB7639/gi568815579r_42099441.tfa (gi568815579r:42099441_42317007), 217567 bp

>pF1KB7639 978
>gi568815579r:42099441_42317007 (Chr19)

(complement)

1-328  (100001-100328)   100% ->
329-448  (101756-101875)   100% ->
449-589  (107168-107308)   100% ->
590-978  (117179-117567)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGCTATCCGGGTCGACCCCGGCCCCGTGCTGGGAGGAGGATGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGCTATCCGGGTCGACCCCGGCCCCGTGCTGGGAGGAGGATGAGTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGGACTACTACGGGATGCTGTCGCTTCACCGTATGTTCGAGGTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGGACTACTACGGGATGCTGTCGCTTCACCGTATGTTCGAGGTGGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGGGCAACTGACCGAGTGCGAGCTGGAGCTCCTGGCCTTTCTGCTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGGGCAACTGACCGAGTGCGAGCTGGAGCTCCTGGCCTTTCTGCTGGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGGCTCCTGGCGCCGCCGGAGGCTTAGCCCGGGCCCGCAGCGGCCTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGGCTCCTGGCGCCGCCGGAGGCTTAGCCCGGGCCCGCAGCGGCCTAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTCCTGCTGGAGCTGGAGCGCCGCGGGCAGTGCGACGAGAGCAACCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCTCCTGCTGGAGCTGGAGCGCCGCGGGCAGTGCGACGAGAGCAACCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGCTGCTGGGGCAACTCCTGCGCGTGCTGGCCCGCCACGACCTGCTGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGCTGCTGGGGCAACTCCTGCGCGTGCTGGCCCGCCACGACCTGCTGCCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CACCTGGCGCGCAAGCGGCGCCGGCCAG         TGTCTCCAGAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100301 CACCTGGCGCGCAAGCGGCGCCGGCCAGGTA...CAGTGTCTCCAGAACG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CTATAGCTATGGCACCTCCAGCTCTTCAAAGAGGACAGAGGGTAGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101769 CTATAGCTATGGCACCTCCAGCTCTTCAAAGAGGACAGAGGGTAGCTGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GTCGCCGTCGGCAGTCAAGCAGTTCTGCAAATTCTCAGCAGGGTCAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101819 GTCGCCGTCGGCAGTCAAGCAGTTCTGCAAATTCTCAGCAGGGTCAGTGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GAGACAG         GCTCCCCCCCAACCAAGCGGCAGCGGCGGAGTCG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101869 GAGACAGGTG...CAGGCTCCCCCCCAACCAAGCGGCAGCGGCGGAGTCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGGCCGGCCCAGTGGTGGTGCCAGACGGCGGCGGAGAGGGGCCCCAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107202 GGGCCGGCCCAGTGGTGGTGCCAGACGGCGGCGGAGAGGGGCCCCAGCCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CACCCCAGCAGCAGTCAGAGCCCGCCAGACCTTCCTCTGAAGGCAAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107252 CACCCCAGCAGCAGTCAGAGCCCGCCAGACCTTCCTCTGAAGGCAAAGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 ACCTGTG         ACATCCGGCTCCGGGTTCGAGCAGAGTACTGCGA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107302 ACCTGTGGTA...CAGACATCCGGCTCCGGGTTCGAGCAGAGTACTGCGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GCATGGGCCAGCCTTGGAGCAGGGCGTGGCATCCCGGCGGCCCCAGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117213 GCATGGGCCAGCCTTGGAGCAGGGCGTGGCATCCCGGCGGCCCCAGGCGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TGGCGCGGCAGCTGGACGTGTTTGGGCAGGCCACCGCAGTGCTGCGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117263 TGGCGCGGCAGCTGGACGTGTTTGGGCAGGCCACCGCAGTGCTGCGCTCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 AGGGACCTGGGCTCTGTGGTTTGTGACATCAAGTTCTCAGAGCTCTCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117313 AGGGACCTGGGCTCTGTGGTTTGTGACATCAAGTTCTCAGAGCTCTCCTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 TCTGGACGCCTTCTGGGGCGACTACCTGAGTGGCGCCCTGCTGCAGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117363 TCTGGACGCCTTCTGGGGCGACTACCTGAGTGGCGCCCTGCTGCAGGCCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 TGCGGGGCGTGTTCCTGACTGAGGCCCTGCGAGAGGCTGTGGGCCGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117413 TGCGGGGCGTGTTCCTGACTGAGGCCCTGCGAGAGGCTGTGGGCCGGGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 GCTGTTCGCCTGCTGGTCAGTGTGGATGAGGCTGACTATGAGGCTGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117463 GCTGTTCGCCTGCTGGTCAGTGTGGATGAGGCTGACTATGAGGCTGGCCG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 GCGCCGCCTGTTGCTGATGGAGGAGGAAGGGGGGCGGCGCCCGACAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117513 GCGCCGCCTGTTGCTGATGGAGGAGGAAGGGGGGCGGCGCCCGACAGAGG

   1000     .
    974 CCTCC
        |||||
 117563 CCTCC