seq1 = pF1KB7630.tfa, 1125 bp
seq2 = pF1KB7630/gi568815588r_102008096.tfa (gi568815588r:102008096_102211301), 203206 bp

>pF1KB7630 1125
>gi568815588r:102008096_102211301 (Chr10)

(complement)

1-20  (99849-99868)   100% ->
21-65  (100002-100046)   100% ->
66-141  (100158-100233)   100% ->
142-244  (100331-100433)   100% ->
245-417  (100601-100773)   100% ->
418-540  (101259-101381)   100% ->
541-624  (101619-101702)   100% ->
625-748  (101795-101918)   100% ->
749-897  (102125-102273)   100% ->
898-1125  (102979-103206)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGGATAGGGATGTGGG         CCCAACTCCCATGTATCCGCC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
  99849 ATGCTGGATAGGGATGTGGGGTA...CAGCCCAACTCCCATGTATCCGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TACATACCTGGAGCCAGGGATTGG         GAGGCACACACCATATG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100023 TACATACCTGGAGCCAGGGATTGGGTA...CAGGAGGCACACACCATATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     83 GCAACCAAACTGACTACAGAATATTTGAGCTTAACAAACGGCTTCAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100175 GCAACCAAACTGACTACAGAATATTTGAGCTTAACAAACGGCTTCAGAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 TGGACAGAG         GAGTGTGACAATCTCTGGTGGGATGCATTCAC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100225 TGGACAGAGGTA...TAGGAGTGTGACAATCTCTGGTGGGATGCATTCAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    174 GACTGAGTTCTTTGAGGATGATGCCATGTTGACCATCACTTTCTGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100363 GACTGAGTTCTTTGAGGATGATGCCATGTTGACCATCACTTTCTGCCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 AGGATGGACCAAAGAGATATA         CCATTGGCCGGACCCTGATC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100413 AGGATGGACCAAAGAGATATAGTA...CAGCCATTGGCCGGACCCTGATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    265 CCACGCTACTTCCGCAGCATCTTTGAGGGGGGTGCTACGGAGCTGTACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100621 CCACGCTACTTCCGCAGCATCTTTGAGGGGGGTGCTACGGAGCTGTACTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 TGTTCTTAAGCACCCCAAGGAGGCATTCCACAGCAACTTTGTGTCCCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100671 TGTTCTTAAGCACCCCAAGGAGGCATTCCACAGCAACTTTGTGTCCCTCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 ACTGTGACCAGGGCAGCATGGTGACCCAGCATGGCAAGCCCATGTTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100721 ACTGTGACCAGGGCAGCATGGTGACCCAGCATGGCAAGCCCATGTTCACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CAG         GTGTGTGTGGAGGGCCGGTTGTACCTGGAGTTCATGTT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100771 CAGGTC...CAGGTGTGTGTGGAGGGCCGGTTGTACCTGGAGTTCATGTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 TGACGACATGATGCGGATAAAGACGTGGCACTTCAGCATCCGGCAGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101297 TGACGACATGATGCGGATAAAGACGTGGCACTTCAGCATCCGGCAGCACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 GAGAGCTCATCCCCCGCAGCATCCTTGCCATGCAT         GCCCAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 101347 GAGAGCTCATCCCCCGCAGCATCCTTGCCATGCATGTG...TAGGCCCAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 GACCCCCAGATGTTGGATCAGCTCTCCAAAAACATCACTCGGTGTGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101625 GACCCCCAGATGTTGGATCAGCTCTCCAAAAACATCACTCGGTGTGGGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 GTCCAATTCCACTCTCAACTACCTCCGA         CTCTGTGTGATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 101675 GTCCAATTCCACTCTCAACTACCTCCGAGTG...TAGCTCTGTGTGATAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 TCGAGCCCATGCAAGAGCTCATGTCACGCCACAAGACCTACAGCCTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101808 TCGAGCCCATGCAAGAGCTCATGTCACGCCACAAGACCTACAGCCTCAGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 CCCCGCGACTGCCTCAAGACCTGCCTTTTCCAGAAGTGGCAGCGCATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101858 CCCCGCGACTGCCTCAAGACCTGCCTTTTCCAGAAGTGGCAGCGCATGGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 AGCACCCCCTG         CGGAGCCCACACGTCAGCAGCCCAGCAAAC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 101908 AGCACCCCCTGGTG...CAGCGGAGCCCACACGTCAGCAGCCCAGCAAAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 GGCGGAAACGGAAGATGTCAGGGGGCAGCACCATGAGCTCTGGTGGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102155 GGCGGAAACGGAAGATGTCAGGGGGCAGCACCATGAGCTCTGGTGGTGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 AACACCAACAACAGCAACAGCAAGAAGAAGAGCCCAGCTAGCACCTTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102205 AACACCAACAACAGCAACAGCAAGAAGAAGAGCCCAGCTAGCACCTTCGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 CCTCTCCAGCCAGGTACCT         GATGTGATGGTGGTGGGGGAGC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 102255 CCTCTCCAGCCAGGTACCTGTA...CAGGATGTGATGGTGGTGGGGGAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 CCACCCTGATGGGCGGGGAGTTCGGGGACGAGGACGAGAGGCTCATCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103001 CCACCCTGATGGGCGGGGAGTTCGGGGACGAGGACGAGAGGCTCATCACC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 CGGCTGGAGAACACCCAGTTTGACGCAGCCAACGGCATTGACGACGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103051 CGGCTGGAGAACACCCAGTTTGACGCAGCCAACGGCATTGACGACGAGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 CAGCTTTAACAACTCCCCTGCACTGGGCGCTAACAGCCCCTGGAACAGCA
        |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
 103101 CAGCTTTAACAACTCCCCTGCACTGGGCGCCAACAGCCCCTGGAACAGCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 AGCCTCCGTCCAGCCAAGAAAGCAAATCGGAGAACCCCACGTCACAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103151 AGCCTCCGTCCAGCCAAGAAAGCAAATCGGAGAACCCCACGTCACAGGCC

   1200     .
   1120 TCCCAG
        ||||||
 103201 TCCCAG