seq1 = pF1KB7627.tfa, 891 bp
seq2 = pF1KB7627/gi568815575r_66499487.tfa (gi568815575r:66499487_66716020), 216534 bp

>pF1KB7627 891
>gi568815575r:66499487_66716020 (ChrX)

(complement)

1-87  (100001-100087)   100% ->
88-266  (110795-110973)   99% ->
267-352  (111515-111600)   100% ->
353-517  (113224-113388)   99% ->
518-891  (116161-116534)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATTGCCAAGAAAATGAGTACTGGGACCAATGGGGACGGTGTGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATTGCCAAGAAAATGAGTACTGGGACCAATGGGGACGGTGTGTCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGCCAACGGTGTGGTCCTGGACAGGAGCTATCCAAG         GATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100051 CTGCCAACGGTGTGGTCCTGGACAGGAGCTATCCAAGGTA...CAGGATT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GTGGTTATGGAGAGGGTGGAGATGCCTACTGCACAGCCTGCCCTCCTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110799 GTGGTTATGGAGAGGGTGGAGATGCCTACTGCACAGCCTGCCCTCCTCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGGTACAAAAGCAGCTGGGGCCACCACAAATGTCAGAGTTGCATCACCTG
        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
 110849 AGGTACAAAAGCAGCTGGGGCCACCACAGATGTCAGAGTTGCATCACCTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGCTGTCATCAATCGTGTTCAGAAGGTCAACTGCACAGCTACCTCTAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110899 TGCTGTCATCAATCGTGTTCAGAAGGTCAACTGCACAGCTACCTCTAATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTGTCTGTGGGGACTGTTTGCCCAG         GTTCTACCGAAAGACA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 110949 CTGTCTGTGGGGACTGTTTGCCCAGGTG...CAGGTTCTACCGAAAGACA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CGCATTGGAGGCCTGCAGGACCAAGAGTGCATCCCGTGCACGAAGCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111531 CGCATTGGAGGCCTGCAGGACCAAGAGTGCATCCCGTGCACGAAGCAGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCCCACCTCTGAGGTTCAAT         GTGCCTTCCAGTTGAGCTTAG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 111581 CCCCACCTCTGAGGTTCAATGTG...CAGGTGCCTTCCAGTTGAGCTTAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGGAGGCAGATGCACCCACAGTGCCCCCTCAGGAGGCCACACTTGTTGCA
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113245 TGGAGGCAGATACACCCACAGTGCCCCCTCAGGAGGCCACACTTGTTGCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CTGGTGAGCAGCCTGCTAGTGGTGTTTACCCTGGCCTTCCTGGGGCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113295 CTGGTGAGCAGCCTGCTAGTGGTGTTTACCCTGGCCTTCCTGGGGCTCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CTTCCTCTACTGCAAGCAGTTCTTCAACAGACATTGCCAGCGTG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 113345 CTTCCTCTACTGCAAGCAGTTCTTCAACAGACATTGCCAGCGTGGTA...

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    518    GAGGTTTGCTGCAGTTTGAGGCTGATAAAACAGCAAAGGAGGAATCT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116158 CAGGAGGTTTGCTGCAGTTTGAGGCTGATAAAACAGCAAAGGAGGAATCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CTCTTCCCCGTGCCACCCAGCAAGGAGACCAGTGCTGAGTCCCAAGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116208 CTCTTCCCCGTGCCACCCAGCAAGGAGACCAGTGCTGAGTCCCAAGTGAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGAGAACATCTTTCAGACCCAGCCACTTAACCCTATCCTCGAGGACGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116258 TGAGAACATCTTTCAGACCCAGCCACTTAACCCTATCCTCGAGGACGACT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GCAGCTCGACTAGTGGCTTCCCCACACAGGAGTCCTTTACCATGGCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116308 GCAGCTCGACTAGTGGCTTCCCCACACAGGAGTCCTTTACCATGGCCTCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TGCACCTCAGAGAGCCACTCCCACTGGGTCCACAGCCCCATCGAATGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116358 TGCACCTCAGAGAGCCACTCCCACTGGGTCCACAGCCCCATCGAATGCAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 AGAGCTGGACCTGCAAAAGTTTTCCAGCTCTGCCTCCTATACTGGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116408 AGAGCTGGACCTGCAAAAGTTTTCCAGCTCTGCCTCCTATACTGGAGCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 AGACCTTGGGGGGAAACACAGTCGAAAGCACTGGAGACAGGCTGGAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116458 AGACCTTGGGGGGAAACACAGTCGAAAGCACTGGAGACAGGCTGGAGCTC

    900     .    :    .    :    .
    865 AATGTGCCCTTTGAAGTTCCCAGCCCT
        |||||||||||||||||||||||||||
 116508 AATGTGCCCTTTGAAGTTCCCAGCCCT