seq1 = pF1KB7626.tfa, 1116 bp
seq2 = pF1KB7626/gi568815586r_10601291.tfa (gi568815586r:10601291_10823069), 221779 bp

>pF1KB7626 1116
>gi568815586r:10601291_10823069 (Chr12)

(complement)

1-262  (99959-100220)   99% ->
263-326  (103927-103990)   100% ->
327-360  (104949-104982)   100% ->
361-450  (107287-107376)   100% ->
451-573  (109737-109859)   100% ->
574-780  (112956-113162)   100% ->
781-878  (118922-119019)   100% ->
879-1053  (120936-121110)   99% ->
1054-1116  (121717-121779)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTGAGGCGGGCGAGGCCACCACCACCACCACCACCACCCTCCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99959 ATGAGTGAGGCGGGCGAGGCCACCACCACCACCACCACCACCCTCCCGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCTCCGACGGAGGCGGCCGCCGCGGCTCCCCAGGACCCCGCGCCCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100009 GGCTCCGACGGAGGCGGCCGCCGCGGCTCCCCAGGACCCCGCGCCCAAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCCGGTGGGCAGCGGTGCGCCCCAGGCCGCGGCCCCGGCGCCCGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100059 GCCCGGTGGGCAGCGGTGCGCCCCAGGCCGCGGCCCCGGCGCCCGCCGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CACGTCGCAGGAAACCCCGGTGGGGACGCGGCCCCCGCAGCCACGGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100109 CACGTCGCAGGAAACCCCGGTGGGGACGCGGCCCCCGCAGCCACGGGCAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGCGGCCGCCGCCTCTTTAGCCGCCGCCGCCGGCAGCGAAGACGCGGAGA
        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
 100159 CGCGGCCGCCGCCTCTTTAGCCACCGCCGCCGGCAGCGAAGACGCGGAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AAAAAGTTCTCG         CCACCAAAGTCCTTGGCACTGTCAAATGG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100209 AAAAAGTTCTCGGTG...TAGCCACCAAAGTCCTTGGCACTGTCAAATGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTCAACGTCAGAAATGGATATGGATTTATAAATCG         AAATGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 103956 TTCAACGTCAGAAATGGATATGGATTTATAAATCGGTA...CAGAAATGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CACCAAAGAAGATGTATTTGTACATCAG         ACTGCCATCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 104955 CACCAAAGAAGATGTATTTGTACATCAGGTA...CAGACTGCCATCAAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGAATAACCCACGGAAATATCTGCGCAGTGTAGGAGATGGAGAAACTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107300 AGAATAACCCACGGAAATATCTGCGCAGTGTAGGAGATGGAGAAACTGTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAGTTTGATGTGGTTGAAGGAGAGAAG         GGTGCAGAAGCTGC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 107350 GAGTTTGATGTGGTTGAAGGAGAGAAGGTG...CAGGGTGCAGAAGCTGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CAATGTGACTGGCCCGGATGGAGTTCCTGTGGAAGGGAGTCGTTACGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109751 CAATGTGACTGGCCCGGATGGAGTTCCTGTGGAAGGGAGTCGTTACGCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CAGATCGGCGCCGTTACAGACGTGGCTACTATGGAAGGCGCCGTGGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109801 CAGATCGGCGCCGTTACAGACGTGGCTACTATGGAAGGCGCCGTGGCCCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CCCCGGAAT         TACGCTGGGGAGGAGGAGGAGGAAGGGAGCGG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 109851 CCCCGGAATGTA...TAGTACGCTGGGGAGGAGGAGGAGGAAGGGAGCGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CAGCAGTGAAGGATTTGACCCCCCTGCCACTGATAGGCAGTTCTCTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112988 CAGCAGTGAAGGATTTGACCCCCCTGCCACTGATAGGCAGTTCTCTGGGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CCCGGAATCAGCTGCGCCGCCCCCAGTATCGCCCTCAGTACCGGCAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113038 CCCGGAATCAGCTGCGCCGCCCCCAGTATCGCCCTCAGTACCGGCAGCGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CGGTTCCCGCCTTACCACGTGGGACAGACCTTTGACCGTCGCTCACGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113088 CGGTTCCCGCCTTACCACGTGGGACAGACCTTTGACCGTCGCTCACGGGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CTTACCCCATCCCAACAGAATACAG         GCTGGTGAGATTGGAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 113138 CTTACCCCATCCCAACAGAATACAGGTA...CAGGCTGGTGAGATTGGAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AGATGAAGGATGGAGTCCCAGAGGGAGCACAACTTCAGGGACCGGTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118938 AGATGAAGGATGGAGTCCCAGAGGGAGCACAACTTCAGGGACCGGTTCAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CGAAATCCAACTTACCGCCCAAGGTACCGTAG         CAGGGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 118988 CGAAATCCAACTTACCGCCCAAGGTACCGTAGGTA...CAGCAGGGGACC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TCCTCGCCCACGACCTGCCCCAGCAGTTGGAGAGGCTGAAGATAAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120945 TCCTCGCCCACGACCTGCCCCAGCAGTTGGAGAGGCTGAAGATAAAGAAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 ATCAGCAAGCCACCAGTGGTCCAAACCAGCCGTCTGTTCGCCGTGGATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
 120995 ATCAGCAAGCCACCAGTGGTCCAAACCAGCCGTCTGTTCGCCGTGGATAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CGGCGTCCCTACAATTACCGGCGTCGCCCGCGTCCTCCTAACGCTCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121045 CGGCGTCCCTACAATTACCGGCGTCGCCCGCGTCCTCCTAACGCTCCTTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 ACAAGATGGCAAAGAG         GCCAAGGCAGGTGAAGCACCAACTG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 121095 ACAAGATGGCAAAGAGGTA...TAGGCCAAGGCAGGTGAAGCACCAACTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .
   1079 AGAACCCTGCTCCACCCACCCAGCAGAGCAGTGCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121742 AGAACCCTGCTCCACCCACCCAGCAGAGCAGTGCTGAG