seq1 = pF1KB7622.tfa, 1104 bp
seq2 = pF1KB7622/gi568815580r_35237235.tfa (gi568815580r:35237235_35440650), 203416 bp

>pF1KB7622 1104
>gi568815580r:35237235_35440650 (Chr18)

(complement)

1-420  (100001-100420)   100% ->
421-568  (100675-100822)   100% ->
569-1104  (102881-103416)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTGCACAGTCAGTGGAAGAAGATTCAATACTTATCATCCCAACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTGCACAGTCAGTGGAAGAAGATTCAATACTTATCATCCCAACTCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGATGAAGAGGAAAAAATTCTGAGAGTGAAGTTGGAGGAGGATCCTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGATGAAGAGGAAAAAATTCTGAGAGTGAAGTTGGAGGAGGATCCTGATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGAAGAGGGATCAAGTATCCCCTGGAACCATCTCCCAGACCCAGAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGAAGAGGGATCAAGTATCCCCTGGAACCATCTCCCAGACCCAGAGATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTCCGACAGCGATTCAGGCAGTTTGGATACCAGGATTCACCTGGGCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTCCGACAGCGATTCAGGCAGTTTGGATACCAGGATTCACCTGGGCCCCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGAGGCTGTGAGCCAGCTCCGAGAACTTTGCCGTCTGTGGCTCAGGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGAGGCTGTGAGCCAGCTCCGAGAACTTTGCCGTCTGTGGCTCAGGCCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGACGCACACAAAAGAACAAATCTTGGAGCTGGTAGTGCTGGAGCAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGACGCACACAAAAGAACAAATCTTGGAGCTGGTAGTGCTGGAGCAGTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTTGCCATCCTACCCAAAGAGCTACAGACTTGGGTTCGAGATCATCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTTGCCATCCTACCCAAAGAGCTACAGACTTGGGTTCGAGATCATCATCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGAGAATGGAGAGGAGGCAGTGACAGTGCTGGAGGATTTGGAGAGTGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AGAGAATGGAGAGGAGGCAGTGACAGTGCTGGAGGATTTGGAGAGTGAAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTGATGACCCTGGACAACCG         GTTTCTCTCCGTCGACGAAAA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100401 TTGATGACCCTGGACAACCGGTG...CAGGTTTCTCTCCGTCGACGAAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CGGGAAGTACTAGTAGAAGACATGGTATCTCAAGAAGAAGCTCAGGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100696 CGGGAAGTACTAGTAGAAGACATGGTATCTCAAGAAGAAGCTCAGGGATT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 ACCAAGTTCTGAGCTTGATGCTGTGGAGAACCAGCTCAAGTGGGCATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100746 ACCAAGTTCTGAGCTTGATGCTGTGGAGAACCAGCTCAAGTGGGCATCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GGGAGCTCCATTCCCTAAGGCACTGTG         ATGATGATGGTAGG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100796 GGGAGCTCCATTCCCTAAGGCACTGTGGTG...CAGATGATGATGGTAGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 ACTGAAAATGGAGCACTAGCTCCAAAGCAGGAGCTTCCTTCAGCATTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102895 ACTGAAAATGGAGCACTAGCTCCAAAGCAGGAGCTTCCTTCAGCATTAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 ATCCCATGAAGTTCCTGGCACTCTCAGTATGGGTGTTCCTCAAATTTTTA
        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
 102945 ATCCCATGAAGTTCCTGGCACTCTCAATATGGGTGTTCCTCAAATTTTTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 AATATGGAGAAACCTGTTTCCCCAAGGGCAGGTTTGAAAGAAAGAGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102995 AATATGGAGAAACCTGTTTCCCCAAGGGCAGGTTTGAAAGAAAGAGAAAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 CCCTCTCGAAAGAAACAACATATATGTGATGAATGTGGAAAACACTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103045 CCCTCTCGAAAGAAACAACATATATGTGATGAATGTGGAAAACACTTCAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 TCAGGGCTCAGCCCTTATTCTTCATCAAAGAATTCACAGTGGGGAGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103095 TCAGGGCTCAGCCCTTATTCTTCATCAAAGAATTCACAGTGGGGAGAAAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 CTTATGGATGTGTTGAGTGTGGGAAAGCATTCAGCCGAAGTTCCATTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103145 CTTATGGATGTGTTGAGTGTGGGAAAGCATTCAGCCGAAGTTCCATTCTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 GTGCAACACCAGAGAGTCCACACTGGAGAAAAACCTTACAAATGTCTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103195 GTGCAACACCAGAGAGTCCACACTGGAGAAAAACCTTACAAATGTCTTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 ATGTGGGAAAGCCTTTAGCCAGAATTCGGGGCTTATTAATCATCAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103245 ATGTGGGAAAGCCTTTAGCCAGAATTCGGGGCTTATTAATCATCAGAGAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 TCCATACTGGGGAGAAACCTTATGAATGCGTTCAGTGTGGGAAATCGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103295 TCCATACTGGGGAGAAACCTTATGAATGCGTTCAGTGTGGGAAATCGTAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 AGTCAAAGCTCAAATCTTTTTAGACATCAGAGAAGACACAATGCAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103345 AGTCAAAGCTCAAATCTTTTTAGACATCAGAGAAGACACAATGCAGAAAA

   1100     .    :    .    :
   1083 ACTTCTGAATGTTGTGAAAGTT
        ||||||||||||||||||||||
 103395 ACTTCTGAATGTTGTGAAAGTT