seq1 = pF1KB7621.tfa, 939 bp
seq2 = pF1KB7621/gi568815585r_27863118.tfa (gi568815585r:27863118_28069006), 205889 bp

>pF1KB7621 939
>gi568815585r:27863118_28069006 (Chr13)

(complement)

1-541  (100001-100541)   100% ->
542-687  (103992-104137)   100% ->
688-939  (105638-105889)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTACGTGAGCTACCTCCTGGACAAGGACGTGAGCATGTACCCTAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTACGTGAGCTACCTCCTGGACAAGGACGTGAGCATGTACCCTAGCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGTGCGCCACTCTGGCGGCCTCAACCTGGCGCCGCAGAACTTCGTCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGTGCGCCACTCTGGCGGCCTCAACCTGGCGCCGCAGAACTTCGTCAGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCCGCAGTACCCGGACTACGGCGGTTACCACGTGGCGGCCGCAGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCCGCAGTACCCGGACTACGGCGGTTACCACGTGGCGGCCGCAGCTGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCGGCAGCGAACTTGGACAGCGCGCAGTCCCCGGGGCCATCCTGGCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCGGCAGCGAACTTGGACAGCGCGCAGTCCCCGGGGCCATCCTGGCCGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGCGTATGGCGCCCCACTCCGGGAGGACTGGAATGGCTACGCGCCCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGCGTATGGCGCCCCACTCCGGGAGGACTGGAATGGCTACGCGCCCGGAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCGCCGCGGCCGCCGCCAACGCCGTGGCTCACGGCCTCAACGGTGGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCGCCGCGGCCGCCGCCAACGCCGTGGCTCACGGCCTCAACGGTGGCTCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCGGCCGCAGCCATGGGCTACAGCAGCCCCGCAGACTACCATCCGCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCGGCCGCAGCCATGGGCTACAGCAGCCCCGCAGACTACCATCCGCACCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCACCCGCATCACCACCCGCACCACCCGGCCGCCGCGCCTTCCTGCGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCACCCGCATCACCACCCGCACCACCCGGCCGCCGCGCCTTCCTGCGCTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CTGGGCTGCTGCAAACGCTCAACCCCGGCCCTCCTGGGCCCGCCGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CTGGGCTGCTGCAAACGCTCAACCCCGGCCCTCCTGGGCCCGCCGCCACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCTGCCGCCGAGCAGCTGTCTCCCGGCGGCCAGCGGCGGAACCTGTGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCTGCCGCCGAGCAGCTGTCTCCCGGCGGCCAGCGGCGGAACCTGTGCGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GTGGATGCGGAAGCCGGCGCAGCAGTCCCTCGGCAGCCAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100501 GTGGATGCGGAAGCCGGCGCAGCAGTCCCTCGGCAGCCAAGGTA...CAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TGAAAACCAGGACGAAAGACAAATATCGAGTGGTGTACACGGACCACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103992 TGAAAACCAGGACGAAAGACAAATATCGAGTGGTGTACACGGACCACCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CGGCTGGAGCTGGAGAAGGAGTTTCACTACAGTCGCTACATCACCATCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104042 CGGCTGGAGCTGGAGAAGGAGTTTCACTACAGTCGCTACATCACCATCCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GAGGAAAGCCGAGCTAGCCGCCACGCTGGGGCTCTCTGAGAGGCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 104092 GAGGAAAGCCGAGCTAGCCGCCACGCTGGGGCTCTCTGAGAGGCAGGTG.

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688      GTTAAAATCTGGTTTCAGAACCGCAGAGCAAAGGAGAGGAAAATC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104142 ..TAGGTTAAAATCTGGTTTCAGAACCGCAGAGCAAAGGAGAGGAAAATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 AACAAGAAGAAGTTGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAGCCACCACAGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105683 AACAAGAAGAAGTTGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAGCCACCACAGCCGCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 TCCGCCGCCACCACAGCCTCCCCAGCCTCAGCCAGGTCCTCTGAGAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105733 TCCGCCGCCACCACAGCCTCCCCAGCCTCAGCCAGGTCCTCTGAGAAGTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 TCCCAGAGCCCTTGAGTCCGGTGTCTTCCCTGCAAGCCTCAGTGTCTGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
 105783 TCCCAGAGCCCTTGAGTCCGGTGTCTTCCCTGCAAGCCTCAGTGCCTGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 TCTGTCCCTGGGGTTCTGGGGCCAACTGGGGGGGTGCTAAACCCCACCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105833 TCTGTCCCTGGGGTTCTGGGGCCAACTGGGGGGGTGCTAAACCCCACCGT

    950     .
    933 CACCCAG
        |||||||
 105883 CACCCAG