seq1 = pF1KB7618.tfa, 1086 bp
seq2 = pF1KB7618/gi568815579r_12784888.tfa (gi568815579r:12784888_12987140), 202253 bp

>pF1KB7618 1086
>gi568815579r:12784888_12987140 (Chr19)

(complement)

1-87  (100001-100087)   100% ->
88-913  (100999-101824)   100% ->
914-1086  (102081-102253)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCACAGCCGAGACCGCCTTGCCCTCCATCAGCACACTGACCGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCACAGCCGAGACCGCCTTGCCCTCCATCAGCACACTGACCGCCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGCCCCTTCCCGGACACACAGGATGACTTCCTCAAG         TGGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100051 GGGCCCCTTCCCGGACACACAGGATGACTTCCTCAAGGTG...CAGTGGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGCGCTCCGAAGAGGCGCAGGACATGGGCCCGGGTCCTCCTGACCCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101003 GGCGCTCCGAAGAGGCGCAGGACATGGGCCCGGGTCCTCCTGACCCCACG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGCCGCCCCTCCACGTGAAGTCTGAGGACCAGCCCGGGGAGGAAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101053 GAGCCGCCCCTCCACGTGAAGTCTGAGGACCAGCCCGGGGAGGAAGAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGATGAGAGGGGCGCGGACGCCACCTGGGACCTGGATCTCCTCCTCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101103 CGATGAGAGGGGCGCGGACGCCACCTGGGACCTGGATCTCCTCCTCACCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACTTCTCGGGCCCGGAGCCCGGTGGCGCGCCCCAGACCTGCGCTCTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101153 ACTTCTCGGGCCCGGAGCCCGGTGGCGCGCCCCAGACCTGCGCTCTGGCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCCAGCGAGGCCTCCGGGGCGCAATATCCGCCGCCGCCCGAGACTCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101203 CCCAGCGAGGCCTCCGGGGCGCAATATCCGCCGCCGCCCGAGACTCTGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CGCATATGCTGGCGGCCCGGGGCTGGTGGCTGGGCTTTTGGGTTCGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101253 CGCATATGCTGGCGGCCCGGGGCTGGTGGCTGGGCTTTTGGGTTCGGAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ATCACTCGGGTTGGGTGCGCCCTGCCCTGCGAGCCCGGGCTCCCGACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101303 ATCACTCGGGTTGGGTGCGCCCTGCCCTGCGAGCCCGGGCTCCCGACGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TTCGTGGGCCCAGCCCTGGCTCCAGCCCCGGCCCCCGAGCCCAAGGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101353 TTCGTGGGCCCAGCCCTGGCTCCAGCCCCGGCCCCCGAGCCCAAGGCGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GGCGCTGCAACCGGTGTACCCGGGGCCCGGCGCCGGCTCCTCGGGTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101403 GGCGCTGCAACCGGTGTACCCGGGGCCCGGCGCCGGCTCCTCGGGTGGCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 ACTTCCCGCGGACCGGGCTTTCAGTGCCTGCGGCGTCGGGCGCCCCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101453 ACTTCCCGCGGACCGGGCTTTCAGTGCCTGCGGCGTCGGGCGCCCCCTAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GGGCTACTGTCCGGGTACCCCGCGATGTACCCGGCGCCTCAGTACCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101503 GGGCTACTGTCCGGGTACCCCGCGATGTACCCGGCGCCTCAGTACCAAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GCACTTCCAGCTCTTCCGCGGGCTCCAGGGACCCGCGCCCGGTCCCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101553 GCACTTCCAGCTCTTCCGCGGGCTCCAGGGACCCGCGCCCGGTCCCGCCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CGTCCCCCTCCTTCCTGAGTTGTTTGGGACCCGGGACGGTGGGCACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101603 CGTCCCCCTCCTTCCTGAGTTGTTTGGGACCCGGGACGGTGGGCACTGGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CTCGGGGGGACTGCAGAGGATCCAGGTGTGATAGCCGAGACCGCGCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101653 CTCGGGGGGACTGCAGAGGATCCAGGTGTGATAGCCGAGACCGCGCCATC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CAAGCGAGGCCGACGTTCGTGGGCGCGCAAGAGGCAGGCAGCGCACACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101703 CAAGCGAGGCCGACGTTCGTGGGCGCGCAAGAGGCAGGCAGCGCACACGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 GCGCGCACCCGGGTTGCGGCAAGAGCTACACCAAGAGCTCCCACCTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101753 GCGCGCACCCGGGTTGCGGCAAGAGCTACACCAAGAGCTCCCACCTGAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 GCGCATCTGCGCACGCACACAG         GGGAGAAGCCATACGCCTG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 101803 GCGCATCTGCGCACGCACACAGGTG...TAGGGGAGAAGCCATACGCCTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 CACGTGGGAAGGCTGCGGCTGGAGATTCGCGCGCTCGGACGAGCTGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102100 CACGTGGGAAGGCTGCGGCTGGAGATTCGCGCGCTCGGACGAGCTGACCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 GCCACTACCGGAAACACACGGGGCAGCGCCCCTTCCGCTGCCAGCTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102150 GCCACTACCGGAAACACACGGGGCAGCGCCCCTTCCGCTGCCAGCTCTGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 CCACGTGCTTTTTCGCGCTCTGACCACCTGGCCTTGCACATGAAGCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102200 CCACGTGCTTTTTCGCGCTCTGACCACCTGGCCTTGCACATGAAGCGCCA

   1100 
   1083 CCTT
        ||||
 102250 CCTT