seq1 = pF1KB7617.tfa, 921 bp
seq2 = pF1KB7617/gi568815596r_151170696.tfa (gi568815596r:151170696_151382948), 212253 bp

>pF1KB7617 921
>gi568815596r:151170696_151382948 (Chr2)

(complement)

1-81  (100001-100081)   100% ->
82-177  (100906-101001)   98% ->
178-340  (103959-104121)   99% ->
341-447  (107085-107191)   100% ->
448-634  (107279-107465)   100% ->
635-741  (111217-111323)   100% ->
742-921  (112074-112253)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAGCTGATAAAGATGACACACAACAAATTCTTAAGGAGCATTCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAGCTGATAAAGATGACACACAACAAATTCTTAAGGAGCATTCGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGATGAATTTATAAAAGATGAACAAAATAAG         GGACTAATTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100051 AGATGAATTTATAAAAGATGAACAAAATAAGGTA...AAGGGACTAATTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATGAAATTACAAAGAAAAATATTCAGCTAAAGAAGGAGATCCAAAAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 100916 ATGAAATTACAAAGAAAAATATTCAACTAAAGAAGGAGATCCAAAAGCTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAAACGGAGTTACAAGAGGCTACCAAAGAATTCCAG         ATTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100966 GAAACGGAGTTACAAGAGGCTACCAAAGAATTCCAGGTA...TAGATTAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AGAGGATATTCCTGAAACAAAGATGAAATTCTTATCAGTTGAAACTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103964 AGAGGATATTCCTGAAACAAAGATGAAATTCTTATCAGTTGAAACTCCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGAATGACAGCCAGTTGTCAAATATCTCCTGTTCATTTCAAGTGAGCTCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
 104014 AGAATGACAGCCAGTTGTCAAATATCTCCTGTTCGTTTCAAGTGAGCTCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAAGTTCCTTATGAGATACAAAAAGGACAAGCACTTATCACCTTTGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104064 AAAGTTCCTTATGAGATACAAAAAGGACAAGCACTTATCACCTTTGAAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGAAGAAG         TTGCTCAAAATGTGGTAAGCATGAGTAAACATC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 104114 AGAAGAAGGTA...CAGTTGCTCAAAATGTGGTAAGCATGAGTAAACATC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATGTACAGATAAAAGATGTAAATCTGGAGGTTACGGCCAAGCCAGTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107118 ATGTACAGATAAAAGATGTAAATCTGGAGGTTACGGCCAAGCCAGTTCCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TTAAATTCAGGAGTCAGATTCCAG         GTTTATGTAGAAGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 107168 TTAAATTCAGGAGTCAGATTCCAGGTA...CAGGTTTATGTAGAAGTTTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TAAAATGAAAATCAATGTTACTGAAATTCCTGACACATTGCGTGAAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107296 TAAAATGAAAATCAATGTTACTGAAATTCCTGACACATTGCGTGAAGATC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AAATGAGAGACAAACTAGAGCTGAGCTTTTCAAAGTCCCGAAATGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107346 AAATGAGAGACAAACTAGAGCTGAGCTTTTCAAAGTCCCGAAATGGAGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GGAGAGGTGGACCGCGTGGACTATGACAGACAGTCCGGGAGTGCAGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107396 GGAGAGGTGGACCGCGTGGACTATGACAGACAGTCCGGGAGTGCAGTCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CACGTTTGTGGAGATTGGAG         TGGCTGACAAGATTTTGAAAA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 107446 CACGTTTGTGGAGATTGGAGGTA...TAGTGGCTGACAAGATTTTGAAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGAAAGAATACCCTCTTTATATAAATCAAACCTGCCATAGAGTTACTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111238 AGAAAGAATACCCTCTTTATATAAATCAAACCTGCCATAGAGTTACTGTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TCTCCATACACAGAAATACACTTGAAAAAGTATCAG         ATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 111288 TCTCCATACACAGAAATACACTTGAAAAAGTATCAGGTA...TAGATATT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TTCAGGAACATCTAAGAGGACAGTGCTTCTGACAGGAATGGAAGGCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112079 TTCAGGAACATCTAAGAGGACAGTGCTTCTGACAGGAATGGAAGGCATTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AAATGGATGAAGAAATTGTGGAGGATTTAATTAACATTCACTTTCAACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112129 AAATGGATGAAGAAATTGTGGAGGATTTAATTAACATTCACTTTCAACGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GCAAAGAATGGAGGTGGAGAAGTAGATGTGGTCAAGTGTTCTCTAGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112179 GCAAAGAATGGAGGTGGAGAAGTAGATGTGGTCAAGTGTTCTCTAGGTCA

    950     .    :    .    :    .
    897 ACCTCACATAGCATACTTTGAAGAA
        |||||||||||||||||||||||||
 112229 ACCTCACATAGCATACTTTGAAGAA