seq1 = pF1KB7614.tfa, 1080 bp
seq2 = pF1KB7614/gi568815597f_155333180.tfa (gi568815597f:155333180_155534259), 201080 bp

>pF1KB7614 1080
>gi568815597f:155333180_155534259 (Chr1)

1-1080  (100001-101080)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGGACACCTGGCTTCGGATTTC GCCTTCTCGCCCCCTCCAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||  |-||||||| |||||||||||| |
 100001 ATGGCGGGACACCTGGCTTCGGATGCCTGCCTTCTTGCCCCCTCCAGGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     50 GTGGAGGTGATGGGCCAGGGGGGCCGGAGCCGGGCTGGGTTGATCCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTGGAGGTGATGGGCCAGGGGGGCCGGAGCCGGGCTGGGTTGATCCTCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    100 ACCTGGCTAAGCTTCCAAGGCCCTCCTGGAGGGCCAGGAATCGGGCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACCTGGCTAAGCTTCCAAGGCCCTCCTGGAGGGCCAGGAATCGGGCCGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    150 GGTTGGGCCAGGCTCTGAGGTGTGGGGGATTCCCCCATGCCCCCCGCCGT
         |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 100151 AGTTGGGTCAGGCTCTGAGGTGTGGGGGATTCCCCCATGCCCCCCGCTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    200 ATGAGTTCTGTGGGGGGATGGCGTACTGTGGGCCCCAGGTTGGAGTGGGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||
 100201 ATGAGTTCTGTGGGGGGATGGCGTACTGTGGGCCTCAGGTTGGAGTGCGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    250 CTAGTGCCCCAAGGCGGCTTGGAGACCTCTCAGCCTGAGGGCGAAGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTAGTGCCCCAAGGCGGCTTGGAGACCTCTCAGCCTGAGGGCGAAGCAGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    300 AGTCGGGGTGGAGAGCAACTCCGATGGGGCCTCCCCGGAGCCCTGCACCG
        |||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||
 100301 AGTCAGGGTGGAGAGCAACTCCGATGGCACCTCCCTGGAGCCCTGCACCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    350 TCACCCCTGGTGCCGTGAAGCTGGAGAAGGAGAAGCTGGAGCAAAACCCG
        || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TCCCCCCTGGTGCCGTGAAACTGGAGAAGGAGAAGCTGGAGCAAAACCCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    400 GAGGAGTCCCAGGACATCAAAGCTCTGCAGAAAGAACTCGAGCAATTTGC
         ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 100401 CAGGAGTCCCAGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAGAACTCGAACAATTTGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    450 CAAGCTCCTGAAGCAGAAGAGGATCACCCTGGGATATACACAGGCCGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CAAGCTCCTGAAGCAGAAGAGGATCACCCTGGGATATACACAGGCCGATG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    500 TGGGGCTCACCCTGGGGGTTCTATTTGGGAAGGTATTCAGCCAAACGACC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
 100501 TGGGGCTCACCCTGGGGGTTCTATTTGGGAAGGTGTTCAGCCAAACGACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    550 ATCTGCCGCTTTGAGGCTCTGCAGCTTAGCTTCAAGAACATGTGTAAGCT
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ATCTGCCGCTTTGAGGGTCTGCAGCTTAGCTTCAAGAACATGTGTAAGCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    600 GCGGCCCTTGCTGCAGAAGTGGGTGGAGGAAGCTGACAACAATGAAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCGGCCCTTGCTGCAGAAGTGGGTGGAGGAAGCTGACAACAATGAAAATC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    650 TTCAGGAGATATGCAAAGCAGAAACCCTCGTGCAGGCCCGAAAGAGAAAG
        ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||
 100651 TTCAGGAGACATGCAAAGCAGAAACCCTCTTGCAGGCTCGAAAGAGAAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    700 CGAACCAGTATCGAGAACCGAGTGAGAGGCAACCTGGAGAATTTGTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CGAACCAGTATCGAGAACCGAGTGAGAGGCAACCTGGAGAATTTGTTCCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    750 GCAGTGCCCGAAACCCACACTGCAGCAGATCAGCCACATCGCCCAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GCAGTGCCCGAAACCCACACTGCAGCAGATCAGCCACATCGCCCAGCAGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    800 TTGGGCTCGAGAAGGATGTGGTCCGAGTGTGGTTCTGTAACCGGCGCCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
 100801 TTGGGCTCGAGAAGGATGTGGTCCGAGTGTGGTTCTGTAACCGGTGCCAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    850 AAGGGCAAGCGATCAAGCAGCGACTATGCACAACGAGAGGATTTTGAGGC
        || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
 100851 AAAGGCAAGCAATCAAGCAGCGACTATGCATAACGAGAGGATTTTGAGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    900 TGCTGGGTCTCCTTTCTCAGGGGGACCAGTGTCCTTTCCTCTGGCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||
 100901 TGCTGGGTCTCCTTTCTCAGGGGTACCAGTATCCTTTCCTCTGGCCCCAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    950 GGCCCCATTTTGGTACCCCAGGCTATGGGAGCCCTCACTTCACTGCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GGCCCCATTTTGGTACCCCAGGCTATGGGAGCCCTCACTTCACTGCACTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1000 TACTCCTCGGTCCCTTTCCCTGAGGGGGAAGCCTTTCCCCCTGTCTCCGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||
 101001 TACTCCTCGGTCCCTTTCCCTGAGGGGGAAGCCTTTCCCCC GTCTCCGT

   1050     .    :    .    :    .    :
   1050 CACCACTCTGGGCTCTCCCATGCATTCAAAC
        |||||| ||||||||||||||||||||||||
 101050 CACCACCCTGGGCTCTCCCATGCATTCAAAC