seq1 = pF1KB7611.tfa, 906 bp
seq2 = pF1KB7611/gi568815588r_102130517.tfa (gi568815588r:102130517_102332080), 201564 bp

>pF1KB7611 906
>gi568815588r:102130517_102332080 (Chr10)

(complement)

1-118  (100001-100118)   100% ->
119-321  (100291-100493)   99% ->
322-906  (100980-101564)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGTTCGGCCTGCTCAGCGAGGCAGAGGCCCGGAGCCCTGCCCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGTTCGGCCTGCTCAGCGAGGCAGAGGCCCGGAGCCCTGCCCTGTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGTCAGACGCTGGCACTCCGCACCCCCAGCTCCCAGAGCACGGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGTCAGACGCTGGCACTCCGCACCCCCAGCTCCCAGAGCACGGCTGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGGCCAGGAGCACAGCG         ACTCAGAAAAGGCCTCGGCTTCG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100101 AGGGCCAGGAGCACAGCGGTA...CAGACTCAGAAAAGGCCTCGGCTTCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGCCCGGCGGCTCCCCAGAGGACGGTTCGCTGAAAAAGAAGCAGCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100314 CTGCCCGGCGGCTCCCCAGAGGACGGTTCGCTGAAAAAGAAGCAGCGGCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCAGCGCACGCACTTCACCAGCCAGCAGCTACAGGAGCTAGAGGCGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100364 GCAGCGCACGCACTTCACCAGCCAGCAGCTACAGGAGCTAGAGGCGACCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCCAGAGGAACCGCTACCCCGACATGAGCACGCGCGAGGAGATTGCCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 100414 TCCAGAGGAACCGCTACCCCGACATGAGCACGCGCGAGGAGATCGCCGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TGGACCAACCTCACCGAGGCCCGCGTGCGG         GTGTGGTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 100464 TGGACCAACCTCACCGAGGCCCGCGTGCGGGTA...CAGGTGTGGTTCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GAACCGGCGCGCCAAATGGCGGAAGCGCGAGCGCAGCCAGCAGGCCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100991 GAACCGGCGCGCCAAATGGCGGAAGCGCGAGCGCAGCCAGCAGGCCGAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TATGCAAAGGCAGCTTCGCGGCGCCGCTCGGGGGGCTGGTGCCGCCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101041 TATGCAAAGGCAGCTTCGCGGCGCCGCTCGGGGGGCTGGTGCCGCCCTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GAGGAGGTGTACCCCGGCTACTCGTACGGCAACTGGCCGCCCAAGGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101091 GAGGAGGTGTACCCCGGCTACTCGTACGGCAACTGGCCGCCCAAGGCTCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TGCCCCGCCGCTCGCCGCCAAGACCTTTCCATTCGCCTTCAACTCGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101141 TGCCCCGCCGCTCGCCGCCAAGACCTTTCCATTCGCCTTCAACTCGGTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ACGTGGGGCCTCTGGCTTCGCAGCCCGTCTTCTCGCCACCCAGCTCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101191 ACGTGGGGCCTCTGGCTTCGCAGCCCGTCTTCTCGCCACCCAGCTCCATC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GCCGCCTCCATGGTGCCCTCCGCCGCGGCTGCCCCGGGCACCGTGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101241 GCCGCCTCCATGGTGCCCTCCGCCGCGGCTGCCCCGGGCACCGTGCCAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GCCTGGGGCCCTGCAGGGCCTGGGCGGGGGCCCCCCCGGGCTGGCTCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101291 GCCTGGGGCCCTGCAGGGCCTGGGCGGGGGCCCCCCCGGGCTGGCTCCGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 CCGCCGTGTCCTCCGGGGCCGTGTCCTGCCCTTATGCCTCGGCCGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101341 CCGCCGTGTCCTCCGGGGCCGTGTCCTGCCCTTATGCCTCGGCCGCCGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 GCCGCCGCGGCTGCCGCCTCTTCCCCCTACGTCTATCGGGACCCGTGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101391 GCCGCCGCGGCTGCCGCCTCTTCCCCCTACGTCTATCGGGACCCGTGTAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 CTCGAGCCTGGCCAGCCTGCGGCTCAAAGCCAAACAGCACGCCTCCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101441 CTCGAGCCTGGCCAGCCTGCGGCTCAAAGCCAAACAGCACGCCTCCTTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 GCTACCCCGCTGTGCACGGGCCGCCCCCGGCAGCCAACCTTAGTCCGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101491 GCTACCCCGCTGTGCACGGGCCGCCCCCGGCAGCCAACCTTAGTCCGTGC

    900     .    :    .    :
    883 CAGTACGCCGTGGAAAGGCCCGTA
        ||||||||||||||||||||||||
 101541 CAGTACGCCGTGGAAAGGCCCGTA