seq1 = pF1KB7608.tfa, 1071 bp
seq2 = pF1KB7608/gi568815597r_161129800.tfa (gi568815597r:161129800_161336565), 206766 bp

>pF1KB7608 1071
>gi568815597r:161129800_161336565 (Chr1)

(complement)

1-107  (100001-100107)   100% ->
108-238  (100589-100719)   100% ->
239-408  (103228-103397)   100% ->
409-548  (103620-103759)   100% ->
549-694  (105092-105237)   100% ->
695-823  (105321-105449)   100% ->
824-944  (105633-105753)   100% ->
945-1071  (106640-106766)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCAGTAGGGAAGATGAGCTGAGGAACTGTGTGGTATGTGGGGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCAGTAGGGAAGATGAGCTGAGGAACTGTGTGGTATGTGGGGACCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGCCACAGGCTACCACTTTAATGCGCTGACTTGTGAGGGCTGCAAGGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGCCACAGGCTACCACTTTAATGCGCTGACTTGTGAGGGCTGCAAGGGTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTTCAG         GAGAACAGTCAGCAAAAGCATTGGTCCCACCTGC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTTCAGGTG...CAGGAGAACAGTCAGCAAAAGCATTGGTCCCACCTGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCCTTTGCTGGAAGCTGTGAAGTCAGCAAGACTCAGAGGCGCCACTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100623 CCCTTTGCTGGAAGCTGTGAAGTCAGCAAGACTCAGAGGCGCCACTGCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGCCTGCAGGTTGCAGAAGTGCTTAGATGCTGGCATGAGGAAAGACA   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100673 AGCCTGCAGGTTGCAGAAGTGCTTAGATGCTGGCATGAGGAAAGACAGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    239       TGATACTGTCGGCAGAAGCCCTGGCATTGCGGCGAGCAAAGCAG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100723 ...CAGTGATACTGTCGGCAGAAGCCCTGGCATTGCGGCGAGCAAAGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCCCAGCGGCGGGCACAGCAAACACCTGTGCAACTGAGTAAGGAGCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103272 GCCCAGCGGCGGGCACAGCAAACACCTGTGCAACTGAGTAAGGAGCAAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGAGCTGATCCGGACACTCCTGGGGGCCCACACCCGCCACATGGGCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103322 AGAGCTGATCCGGACACTCCTGGGGGCCCACACCCGCCACATGGGCACCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGTTTGAACAGTTTGTGCAGTTTAGG         CCTCCAGCTCATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 103372 TGTTTGAACAGTTTGTGCAGTTTAGGGTG...CAGCCTCCAGCTCATCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TTCATCCATCACCAGCCCTTGCCCACCCTGGCCCCTGTGCTGCCTCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103635 TTCATCCATCACCAGCCCTTGCCCACCCTGGCCCCTGTGCTGCCTCTGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CACACACTTCGCAGACATCAACACTTTCATGGTACTGCAAGTCATCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103685 CACACACTTCGCAGACATCAACACTTTCATGGTACTGCAAGTCATCAAGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TTACTAAGGACCTGCCCGTCTTCCG         TTCCCTGCCCATTGAA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 103735 TTACTAAGGACCTGCCCGTCTTCCGGTG...CAGTTCCCTGCCCATTGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GACCAGATCTCCCTTCTCAAGGGAGCAGCTGTGGAAATCTGTCACATCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105108 GACCAGATCTCCCTTCTCAAGGGAGCAGCTGTGGAAATCTGTCACATCGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 ACTCAATACCACTTTCTGTCTCCAAACACAAAACTTCCTCTGCGGGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105158 ACTCAATACCACTTTCTGTCTCCAAACACAAAACTTCCTCTGCGGGCCTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TTCGCTACACAATTGAAGATGGAGCCCGTG         TATCTCCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 105208 TTCGCTACACAATTGAAGATGGAGCCCGTGGTG...TAGTATCTCCCACA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GTGGGGTTCCAGGTAGAGTTTTTGGAGTTGCTCTTTCACTTCCATGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105332 GTGGGGTTCCAGGTAGAGTTTTTGGAGTTGCTCTTTCACTTCCATGGAAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 ACTACGAAAACTGCAGCTCCAAGAGCCTGAGTATGTGCTCTTGGCTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105382 ACTACGAAAACTGCAGCTCCAAGAGCCTGAGTATGTGCTCTTGGCTGCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TGGCCCTCTTCTCTCCTG         CTCCCTATCTTACAGACCGACCT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 105432 TGGCCCTCTTCTCTCCTGGTG...CAGCTCCCTATCTTACAGACCGACCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GGAGTTACCCAGAGAGATGAGATTGATCAGCTGCAAGAGGAGATGGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105656 GGAGTTACCCAGAGAGATGAGATTGATCAGCTGCAAGAGGAGATGGCACT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GACTCTGCAAAGCTACATCAAGGGCCAGCAGCGAAGGCCCCGGGATCG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 105706 GACTCTGCAAAGCTACATCAAGGGCCAGCAGCGAAGGCCCCGGGATCGGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    945        GTTTCTGTATGCGAAGTTGCTAGGCCTGCTGGCTGAGCTCCGG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105756 A...AAGGTTTCTGTATGCGAAGTTGCTAGGCCTGCTGGCTGAGCTCCGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 AGCATTAATGAGGCCTACGGGTACCAAATCCAGCACATCCAGGGCCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106683 AGCATTAATGAGGCCTACGGGTACCAAATCCAGCACATCCAGGGCCTGTC

   1100     .    :    .    :    .    :
   1038 TGCCATGATGCCGCTGCTCCAGGAGATCTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106733 TGCCATGATGCCGCTGCTCCAGGAGATCTGCAGC