seq1 = pF1KB7603.tfa, 891 bp
seq2 = pF1KB7603/gi568815584r_56701738.tfa (gi568815584r:56701738_56905456), 203719 bp

>pF1KB7603 891
>gi568815584r:56701738_56905456 (Chr14)

(complement)

1-97  (100001-100097)   100% ->
98-273  (101094-101269)   100% ->
274-891  (103102-103719)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTTACGCAGTCAATGGGCTGAGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTTACGCAGTCAATGGGCTGAGTCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACCACTTCGGGTATGGACTTGCTGCACCCCTCCGTGGGCTACCCGG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100051 GACCACTTCGGGTATGGACTTGCTGCACCCCTCCGTGGGCTACCCGGGTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     98       GGCCCTGGGCTTCTTGTCCCGCAGCCACCCCCCGGAAACAGCGC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ...AAGGGCCCTGGGCTTCTTGTCCCGCAGCCACCCCCCGGAAACAGCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CGGGAGAGGACGACGTTCACTCGGGCGCAGCTAGATGTGCTGGAAGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101138 CGGGAGAGGACGACGTTCACTCGGGCGCAGCTAGATGTGCTGGAAGCACT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GTTTGCCAAGACCCGGTACCCAGACATCTTCATGCGAGAGGAGGTGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101188 GTTTGCCAAGACCCGGTACCCAGACATCTTCATGCGAGAGGAGGTGGCAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGAAAATCAACTTGCCCGAGTCGAGGGTGCAG         GTATGGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 101238 TGAAAATCAACTTGCCCGAGTCGAGGGTGCAGGTA...AAGGTATGGTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAGAATCGAAGAGCTAAGTGCCGCCAACAACAGCAACAACAGCAGAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103111 AAGAATCGAAGAGCTAAGTGCCGCCAACAACAGCAACAACAGCAGAATGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGGTCAAAACAAAGTGAGACCTGCCAAAAAGAAGACATCTCCAGCTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103161 AGGTCAAAACAAAGTGAGACCTGCCAAAAAGAAGACATCTCCAGCTCGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AAGTGAGTTCAGAGAGTGGAACAAGTGGCCAATTCACTCCCCCCTCTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103211 AAGTGAGTTCAGAGAGTGGAACAAGTGGCCAATTCACTCCCCCCTCTAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ACCTCAGTCCCGACCATTGCCAGCAGCAGTGCTCCTGTGTCTATCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103261 ACCTCAGTCCCGACCATTGCCAGCAGCAGTGCTCCTGTGTCTATCTGGAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CCCAGCTTCCATCTCCCCACTGTCAGATCCCTTGTCCACCTCCTCTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103311 CCCAGCTTCCATCTCCCCACTGTCAGATCCCTTGTCCACCTCCTCTTCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GCATGCAGAGGTCCTATCCCATGACCTATACTCAGGCTTCAGGTTATAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103361 GCATGCAGAGGTCCTATCCCATGACCTATACTCAGGCTTCAGGTTATAGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CAAGGATATGCTGGCTCAACTTCCTACTTTGGGGGCATGGACTGTGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103411 CAAGGATATGCTGGCTCAACTTCCTACTTTGGGGGCATGGACTGTGGATC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 ATATTTGACCCCTATGCATCACCAGCTTCCCGGACCAGGGGCCACACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103461 ATATTTGACCCCTATGCATCACCAGCTTCCCGGACCAGGGGCCACACTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 GTCCCATGGGTACCAATGCAGTCACCAGCCATCTCAATCAGTCCCCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103511 GTCCCATGGGTACCAATGCAGTCACCAGCCATCTCAATCAGTCCCCAGCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 TCTCTTTCCACCCAGGGATATGGAGCTTCAAGCTTGGGTTTTAACTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103561 TCTCTTTCCACCCAGGGATATGGAGCTTCAAGCTTGGGTTTTAACTCAAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 CACTGATTGCTTGGATTATAAGGACCAAACTGCCTCCTGGAAGCTTAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103611 CACTGATTGCTTGGATTATAAGGACCAAACTGCCTCCTGGAAGCTTAACT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 TCAATGCTGACTGCTTGGATTATAAAGATCAGACATCCTCGTGGAAATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103661 TCAATGCTGACTGCTTGGATTATAAAGATCAGACATCCTCGTGGAAATTC

    900     .
    883 CAGGTTTTG
        |||||||||
 103711 CAGGTTTTG