seq1 = pF1KB7600.tfa, 1302 bp
seq2 = pF1KB7600/gi568815579r_4739195.tfa (gi568815579r:4739195_4961394), 222200 bp

>pF1KB7600 1302
>gi568815579r:4739195_4961394 (Chr19)

(complement)

1-66  (100001-100066)   100% ->
67-265  (101371-101569)   100% ->
266-348  (101723-101805)   100% ->
349-634  (109094-109379)   99% ->
635-834  (113505-113704)   99% ->
835-960  (116602-116727)   100% ->
961-1302  (121859-122200)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTGCCGACGGGGCAGAGGCTGATGGCAGCACCCAGGTGACAGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTGCCGACGGGGCAGAGGCTGATGGCAGCACCCAGGTGACAGTGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGAACCGGTACAGCAG         CCCAGTGTGGTGGACCGTGTGGCCA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100051 AGAACCGGTACAGCAGGTG...TAGCCCAGTGTGGTGGACCGTGTGGCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCATGCCTCTGATCAGCTCCACCTGCGACATGGTGTCCGCAGCCTATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101396 GCATGCCTCTGATCAGCTCCACCTGCGACATGGTGTCCGCAGCCTATGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCCACCAAGGAGAGCTACCCGCACATCAAGACTGTCTGCGACGCAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101446 TCCACCAAGGAGAGCTACCCGCACATCAAGACTGTCTGCGACGCAGCAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAAGGGAGTGAGGACCCTCACGGCGGCTGCTGTCAGCGGGGCTCAGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101496 GAAGGGAGTGAGGACCCTCACGGCGGCTGCTGTCAGCGGGGCTCAGCCGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCCTCTCCAAGCTGGAGCCCCAGA         TTGCATCAGCCAGCGAA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 101546 TCCTCTCCAAGCTGGAGCCCCAGAGTG...CAGTTGCATCAGCCAGCGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TACGCCCACAGGGGGCTGGACAAGTTGGAGGAGAACCTCCCCATCCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101740 TACGCCCACAGGGGGCTGGACAAGTTGGAGGAGAACCTCCCCATCCTGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCAGCCCACGGAGAAG         GTCCTGGCGGACACCAAGGAGCTTG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 101790 GCAGCCCACGGAGAAGGTA...TAGGTCCTGGCGGACACCAAGGAGCTTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGTCGTCTAAGGTGTCGGGGGCCCAAGAGATGGTGTCTAGCGCCAAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109119 TGTCGTCTAAGGTGTCGGGGGCCCAAGAGATGGTGTCTAGCGCCAAGGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ACGGTGGCCACCCAATTGTCGGAGGCGGTGGACGCGACCCGCGGTGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109169 ACGGTGGCCACCCAATTGTCGGAGGCGGTGGACGCGACCCGCGGTGCTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GCAGAGCGGCGTGGACAAGACAAAGTCCGTAGTGACCGGCGGCGTCCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109219 GCAGAGCGGCGTGGACAAGACAAAGTCCGTAGTGACCGGCGGCGTCCAAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CAGTCATGGGCTCCCGCTTGGGCCAGATGGTGCTGAGTGGGGTCGACACG
        | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 109269 CGGTCATGGGCTCCCGCTTGGGCCAGATGGTGTTGAGTGGGGTCGACACG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GTGCTGGGGAAGTCGGAGGAGTGGGCGGACAACCACCTGCCCCTTACGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109319 GTGCTGGGGAAGTCGGAGGAGTGGGCGGACAACCACCTGCCCCTTACGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TGCCGAACTGG         CCCGCATCGCCACATCCCTGGATGGCTTCG
        |||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||| |
 109369 TGCCGAACTGGGTA...CAGCCCGCATCGCCACATCCCTGGATGGCTTTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ACGTCGCGTCCGTGCAGCAGCAGCGGCAGGAACAGAGCTACTTCGTACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113535 ACGTCGCGTCCGTGCAGCAGCAGCGGCAGGAACAGAGCTACTTCGTACGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CTGGGCTCCCTGTCGGAGAGGCTGCGGCAGCACGCCTATGAGCACTCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113585 CTGGGCTCCCTGTCGGAGAGGCTGCGGCAGCACGCCTATGAGCACTCGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GGGCAAGCTTCGAGCCACCAAGCAGAGGGCACAGGAGGCTCTGCTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113635 GGGCAAGCTTCGAGCCACCAAGCAGAGGGCACAGGAGGCTCTGCTGCAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TGTCGCAGGCCCTAAGCCTG         ATGGAAACTGTCAAGCAAGGC
        ||||||||| ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 113685 TGTCGCAGGTCCTAAGCCTGGTG...CAGATGGAAACTGTCAAGCAAGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GTTGATCAGAAGCTGGTGGAAGGCCAGGAGAAGCTGCACCAGATGTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116623 GTTGATCAGAAGCTGGTGGAAGGCCAGGAGAAGCTGCACCAGATGTGGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CAGCTGGAACCAGAAGCAGCTCCAGGGCCCCGAGAAGGAGCCGCCCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116673 CAGCTGGAACCAGAAGCAGCTCCAGGGCCCCGAGAAGGAGCCGCCCAAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CAGAG         CAGGTCGAGTCCCGGGCGCTCACCATGTTCCGGGAC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116723 CAGAGGTA...CAGCAGGTCGAGTCCCGGGCGCTCACCATGTTCCGGGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 ATTGCCCAGCAACTGCAGGCCACCTGTACCTCCCTGGGGTCCAGCATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121895 ATTGCCCAGCAACTGCAGGCCACCTGTACCTCCCTGGGGTCCAGCATTCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GGGCCTCCCCACCAATGTGAAGGACCAGGTGCAGCAGGCCCGCCGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121945 GGGCCTCCCCACCAATGTGAAGGACCAGGTGCAGCAGGCCCGCCGCCAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 TGGAGGACCTCCAGGCCACGTTTTCCAGCATCCACTCCTTCCAGGACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121995 TGGAGGACCTCCAGGCCACGTTTTCCAGCATCCACTCCTTCCAGGACCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 TCCAGCAGCATTCTGGCCCAGAGCCGTGAGCGTGTTGCCAGCGCCCGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 122045 TCCAGCAGCATTCTGGCCCAGAGCCGTGAGCGTGTCGCCAGCGCCCGCGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 GGCCCTGGACCACATGGTGGAATATGTGGCCCAGAACACACCTGTCACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122095 GGCCCTGGACCACATGGTGGAATATGTGGCCCAGAACACACCTGTCACGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 GGCTCGTGGGACCCTTTGCCCCTGGAATCACTGAGAAAGCCCCGGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122145 GGCTCGTGGGACCCTTTGCCCCTGGAATCACTGAGAAAGCCCCGGAGGAG

   1350     .
   1297 AAGAAG
        ||||||
 122195 AAGAAG