seq1 = pF1KB7587.tfa, 672 bp
seq2 = pF1KB7587/gi568815597r_202983913.tfa (gi568815597r:202983913_203185961), 202049 bp

>pF1KB7587 672
>gi568815597r:202983913_203185961 (Chr1)

(complement)

1-471  (100001-100471)   99% ->
472-553  (101234-101315)   100% ->
554-672  (101931-102049)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCTGTATGAGACATCCCCCTACTTCTACCAGGAACCCCGCTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCTGTATGAGACATCCCCCTACTTCTACCAGGAACCCCGCTTCTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGATGGGGAAAACTACCTGCCTGTCCACCTCCAGGGCTTCGAACCACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGATGGGGAAAACTACCTGCCTGTCCACCTCCAGGGCTTCGAACCACCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTACGAGCGGACGGAGCTCACCCTGAGCCCCGAGGCCCCAGGGCCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCTACGAGCGGACGGAGCTCACCCTGAGCCCCGAGGCCCCAGGGCCCCTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGGACAAGGGGCTGGGGACCCCCGAGCACTGTCCAGGCCAGTGCCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGGACAAGGGGCTGGGGACCCCCGAGCACTGTCCAGGCCAGTGCCTGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GTGGGCGTGTAAGGTGTGTAAGAGGAAGTCGGTGTCCGTGGACCGGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GTGGGCGTGTAAGGTGTGTAAGAGGAAGTCGGTGTCCGTGGACCGGCGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGGCGGCCACACTGAGGGAGAAGCGCAGGCTCAAGAAGGTGAATGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGGCGGCCACACTGAGGGAGAAGCGCAGGCTCAAGAAGGTGAATGAGGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTCGAGGCTCTGAAGAGAAGCACCCTGCTCAACCCCAACCAGCGGCTGCC
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTCGAGGCCCTGAAGAGAAGCACCCTGCTCAACCCCAACCAGCGGCTGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAAGGTGGAGATCCTGCGCAGTGCCATCCAGTACATCGAGCGCCTCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAAGGTGGAGATCCTGCGCAGTGCCATCCAGTACATCGAGCGCCTCCAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCCTGCTCAGCTCCCTCAACCAGGAGGAGCGTGACCTCCGCTACCGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCCTGCTCAGCTCCCTCAACCAGGAGGAGCGTGACCTCCGCTACCGGGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGGGGCGGGCCCCAGCCAGGG         GTGCCCAGCGAATGCAGCTC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100451 GGGGGCGGGCCCCAGCCAGGGGTA...CAGGTGCCCAGCGAATGCAGCTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TCACAGCGCCTCCTGCAGTCCAGAGTGGGGCAGTGCACTGGAGTTCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101254 TCACAGCGCCTCCTGCAGTCCAGAGTGGGGCAGTGCACTGGAGTTCAGCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CCAACCCAGGGG         ATCATCTGCTCACGGCTGACCCTACAGAT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 101304 CCAACCCAGGGGGTA...CAGATCATCTGCTCACGGCTGACCCTACAGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GCCCACAACCTGCACTCCCTCACCTCCATCGTGGACAGCATCACAGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101960 GCCCACAACCTGCACTCCCTCACCTCCATCGTGGACAGCATCACAGTGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :
    633 AGATGTGTCTGTGGCCTTCCCAGATGAAACCATGCCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102010 AGATGTGTCTGTGGCCTTCCCAGATGAAACCATGCCCAAC