seq1 = pF1KB7584.tfa, 861 bp
seq2 = pF1KB7584/gi568815581r_49891520.tfa (gi568815581r:49891520_50094998), 203479 bp

>pF1KB7584 861
>gi568815581r:49891520_50094998 (Chr17)

(complement)

1-325  (100001-100325)   100% ->
326-516  (101409-101599)   99% ->
517-861  (103135-103479)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTGGCTCCTTCGATCGCAAGCTCAGCAGCATCCTCACCGACATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTGGCTCCTTCGATCGCAAGCTCAGCAGCATCCTCACCGACATCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGCTCCCTTAGCTGCCATGCGGGCTCCAAGGACTCGCCTACCCTGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGCTCCCTTAGCTGCCATGCGGGCTCCAAGGACTCGCCTACCCTGCCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGTCTTCTGTCACTGACCTGGGCTACTACAGCGCTCCCCAGCACGATTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGTCTTCTGTCACTGACCTGGGCTACTACAGCGCTCCCCAGCACGATTAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TACTCGGGCCAGCCCTATGGCCAGACGGTGAACCCCTACACCTACCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TACTCGGGCCAGCCCTATGGCCAGACGGTGAACCCCTACACCTACCACCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCAATTCAATCTCAATGGGCTTGCAGGCACGGGCGCTTACTCGCCCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCAATTCAATCTCAATGGGCTTGCAGGCACGGGCGCTTACTCGCCCAAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CGGAATATACCTACGGAGCCTCCTACCGGCAATACGGGGCGTATCGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CGGAATATACCTACGGAGCCTCCTACCGGCAATACGGGGCGTATCGGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CAGCCGCTGCCAGCCCAGGACCCAG         TGTCGGTGAAGGAGGA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100301 CAGCCGCTGCCAGCCCAGGACCCAGGTG...CAGTGTCGGTGAAGGAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GCCGGAAGCAGAGGTGCGCATGGTGAATGGGAAGCCCAAGAAGGTCCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101425 GCCGGAAGCAGAGGTGCGCATGGTGAATGGGAAGCCCAAGAAGGTCCGAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AGCCGCGTACAATCTACTCCAGCTACCAGCTGGCCGCCCTGCAGCGCCGC
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101475 AGCCGCGTACGATCTACTCCAGCTACCAGCTGGCCGCCCTGCAGCGCCGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TTCCAGAAGGCCCAGTACCTGGCGCTGCCCGAGCGCGCCGAGCTGGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101525 TTCCAGAAGGCCCAGTACCTGGCGCTGCCCGAGCGCGCCGAGCTGGCCGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GCAGCTGGGCCTCACGCAGACACAG         GTGAAAATCTGGTTCC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 101575 GCAGCTGGGCCTCACGCAGACACAGGTT...CAGGTGAAAATCTGGTTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AGAACCGCCGTTCCAAGTTCAAGAAACTCTACAAGAACGGGGAGGTGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103151 AGAACCGCCGTTCCAAGTTCAAGAAACTCTACAAGAACGGGGAGGTGCCG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CTGGAGCACAGTCCCAATAACAGTGATTCCATGGCCTGCAACTCACCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103201 CTGGAGCACAGTCCCAATAACAGTGATTCCATGGCCTGCAACTCACCACC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 ATCACCCGCCCTCTGGGACACCTCTTCCCACTCCACTCCGGCCCCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103251 ATCACCCGCCCTCTGGGACACCTCTTCCCACTCCACTCCGGCCCCTGCCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 GCAGTCAGCTGCCCCCGCCGCTCCCATACAGTGCCTCCCCCAGCTACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103301 GCAGTCAGCTGCCCCCGCCGCTCCCATACAGTGCCTCCCCCAGCTACCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 GACGACCCCACCAACTCCTGGTATCACGCACAGAACCTGAGTGGACCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103351 GACGACCCCACCAACTCCTGGTATCACGCACAGAACCTGAGTGGACCCCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 CTTACAGCAGCAGCCGCCTCAGCCAGCCACCCTGCACCATGCCTCTCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103401 CTTACAGCAGCAGCCGCCTCAGCCAGCCACCCTGCACCATGCCTCTCCCG

    850     .    :    .    :    .
    833 GGCCCCCGCCCAACCCTGGGGCTGTGTAC
        |||||||||||||||||||||||||||||
 103451 GGCCCCCGCCCAACCCTGGGGCTGTGTAC