seq1 = pF1KB7582.tfa, 861 bp
seq2 = pF1KB7582/gi568815588f_63046208.tfa (gi568815588f:63046208_63254215), 208008 bp

>pF1KB7582 861
>gi568815588f:63046208_63254215 (Chr10)

1-30  (87264-87293)   100% ->
31-115  (100002-100086)   100% ->
116-156  (105943-105983)   100% ->
157-861  (107304-108008)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAGTAATGGAAGGACCCCTCAACCTG         GCTCATCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
  87264 ATGGAAGTAATGGAAGGACCCCTCAACCTGGTG...TAGGCTCATCAACA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GAGCAGACGAGCAGACCGTTTATTAGCTGCAGGCAAATACGAAGAGGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100013 GAGCAGACGAGCAGACCGTTTATTAGCTGCAGGCAAATACGAAGAGGCTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTTCTTGTCACAAAAAGGCTGCAG         CATATCTTTCTGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100063 TTTCTTGTCACAAAAAGGCTGCAGGTG...CAGCATATCTTTCTGAAGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 ATGAAGCTGACACAGTCAGAGCAG         GCTCATCTTTCACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 105960 ATGAAGCTGACACAGTCAGAGCAGGTG...TAGGCTCATCTTTCACTGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    174 ATTGCAAAGGGATAGCCATATGAAACAGCTCCTCCTCATCCAAGAGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107321 ATTGCAAAGGGATAGCCATATGAAACAGCTCCTCCTCATCCAAGAGAGAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 GGAAAAGGGCCCAGCGTGAAGAAAGATTGAAAGCCCAGCAGAACACAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107371 GGAAAAGGGCCCAGCGTGAAGAAAGATTGAAAGCCCAGCAGAACACAGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AAGGATGCAGCTGCCCATCTTCAGACATCTCACAAACCCTCTGCAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107421 AAGGATGCAGCTGCCCATCTTCAGACATCTCACAAACCCTCTGCAGAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TGCAGAGGGCCAGAGTCCCCTTTCTCAGAAGTACAGCCCTTCCACAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107471 TGCAGAGGGCCAGAGTCCCCTTTCTCAGAAGTACAGCCCTTCCACAGAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AATGCCTGCCTGAGATTCAGGGGATCTTTGACAGGGATCCAGACACACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107521 AATGCCTGCCTGAGATTCAGGGGATCTTTGACAGGGATCCAGACACACTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CTTTATTTACTTCAGCAAAAGAGTGAGCCAGCAGAGCCATGTATTGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107571 CTTTATTTACTTCAGCAAAAGAGTGAGCCAGCAGAGCCATGTATTGGAAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CAAAGCCCCAAAAGATGATAAAACAATTATAGAGGAGCAGGCAACCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107621 CAAAGCCCCAAAAGATGATAAAACAATTATAGAGGAGCAGGCAACCAAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TTGCAGATTTGAAGAGGCATGTGGAATTCCTTGTGGCTGAGAATGAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107671 TTGCAGATTTGAAGAGGCATGTGGAATTCCTTGTGGCTGAGAATGAAAGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TTAAGGAAAGAAAATAAACAACTAAAGGCTGAAAAGGCCAGACTTCTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107721 TTAAGGAAAGAAAATAAACAACTAAAGGCTGAAAAGGCCAGACTTCTAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 AGGTCCAATAGAAAAGGAGCTGGATGTAGATGCTGATTTTGTAGAAACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107771 AGGTCCAATAGAAAAGGAGCTGGATGTAGATGCTGATTTTGTAGAAACGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CAGAGTTATGGAGCTTGCCACCACATGCAGAAACTGCTACAGCCTCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107821 CAGAGTTATGGAGCTTGCCACCACATGCAGAAACTGCTACAGCCTCCTCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 ACCTGGCAGAAGTTCGCAGCAAATACTGGGAAAGCCAAGGACATTCCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107871 ACCTGGCAGAAGTTCGCAGCAAATACTGGGAAAGCCAAGGACATTCCAAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CCCCAATCTTCCTCCCTTGGATTTTCCATCTCCAGAACTTCCTCTTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107921 CCCCAATCTTCCTCCCTTGGATTTTCCATCTCCAGAACTTCCTCTTATGG

    850     .    :    .    :    .    :    .
    824 AGCTCTCTGAGGATATTCTGAAAGGATTTATGAATAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107971 AGCTCTCTGAGGATATTCTGAAAGGATTTATGAATAAT